RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361441.4

APOBEC3C-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3C, Length 2,818 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-201ENST00000361441 TMEM105Q8N8V8 129 aa8.72□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 AP5S1Q9NUS5 200 aa8.72□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 MED13Q9UHV7 2174 aa8.71□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 LAMA5O15230 3695 aa8.71□□□□□ -1.01
APOBEC3C-201ENST00000361441 C9JAW5 83 aa8.71□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 APOHP02749 345 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 COL8A1P27658 744 aa8.71□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 MAGEA5P43359 124 aa8.71□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 RRN3P1Q2M238 152 aa8.71□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 HIGD1AQ9Y241 93 aa8.71□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 WDR83OSQ9Y284 106 aa8.71□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa8.71□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 DEFB108AA8MXU0 73 aa8.71□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 GRPP07492 148 aa8.71□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 HBBP68871 147 aa8.71□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 LINC01587Q99440 93 aa8.71□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 CHCHD5Q9BSY4 110 aa8.71□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 FAM234AQ9H0X4 552 aa8.71□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 C21orf62Q9NYP8 219 aa8.71□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 FAM106CPP0CH98 169 aa8.7□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 PSMB2P49721 201 aa8.7□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 EMP1P54849 157 aa8.7□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 FAM106AQ4KMX7 169 aa8.7□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 PIP4P1Q86T03 277 aa8.7□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 SGK494Q96LW2 274 aa8.7□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 RASL11BQ9BPW5 248 aa8.7□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 SIGLEC9Q9Y336 463 aa8.7□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 TMEM262E9PQX1 116 aa8.7□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 H3BVH4 76 aa8.7□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF826PQ6ZT77 177 aa8.7□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 TEN1Q86WV5 123 aa8.7□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 RFESDQ8TAC1 157 aa8.7□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRDM14Q9GZV8 571 aa8.7□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 KLF12Q9Y4X4 402 aa8.7□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 ICE1Q9Y2F5 2266 aa8.69□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa8.69□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 OOSP1A8MZH6 123 aa8.69□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 WNT9BO14905 357 aa8.69□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 RPL30P62888 115 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 EFNB3Q15768 340 aa8.69□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 FAM214BQ7L5A3 538 aa8.69□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 WDR86Q86TI4 376 aa8.69□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 DRAM1Q8N682 238 aa8.69□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 TMEM101Q96IK0 257 aa8.69□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 FZR1Q9UM11 496 aa8.69□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 TCF19Q9Y242 345 aa8.69□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 A0A1B0GXF2 115 aa8.69□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 OR2H2O95918 312 aa8.69□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 MGST2Q99735 147 aa8.69□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 SLC25A33Q9BSK2 321 aa8.69□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 TREML4Q6UXN2 200 aa8.68□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 ABHD12Q8N2K0 398 aa8.68□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 PGLYRP4Q96LB8 373 aa8.68□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa8.68□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa8.68□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa8.68□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 GGTLC3B5MD39 225 aa8.68□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 NPFFO15130 113 aa8.68□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 WFDC3Q8IUB2 231 aa8.68□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 ARL17AQ8IVW1 177 aa8.68□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 DCTN5Q9BTE1 182 aa8.68□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 PLEKHA3Q9HB20 300 aa8.68□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 SPANXA1Q9NS26 97 aa8.68□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa8.67□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 MPV17P39210 176 aa8.67□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 IL11RAQ14626 422 aa8.67□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 MIR17HGQ75NE6 70 aa8.67□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa8.67□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 FAM173AQ9BQD7 235 aa8.67□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 MDFICQ9P1T7 246 aa8.67□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 DKK2Q9UBU2 259 aa8.67□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 LGALS9BQ3B8N2 356 aa8.67□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 LGALS9CQ6DKI2 356 aa8.67□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 SIT1Q9Y3P8 196 aa8.67□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa8.67□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 C17orf98A8MV24 154 aa8.67□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 J3KT08 172 aa8.67□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZFP2Q6ZN57 461 aa8.67□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa8.67□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 MDP1Q86V88 176 aa8.67□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa8.67□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 OR13C6PQ8NH95 151 aa8.67□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF414Q96IQ9 312 aa8.67□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 DEFB127Q9H1M4 99 aa8.67□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 PSPNO60542 156 aa8.66□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 GNG5P63218 68 aa8.66□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 PLGLB1Q02325 96 aa8.66□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 POU2AF1Q16633 256 aa8.66□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
APOBEC3C-201ENST00000361441 Q6P435 159 aa8.66□□□□□ -1.02
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