RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
GIPC1-201ENST00000345425 HELTA6NFD8 242 aa20.99■□□□□ 0.95
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GIPC1-201ENST00000345425 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
GIPC1-201ENST00000345425 OR2K2Q8NGT1 345 aa20.99■□□□□ 0.95
GIPC1-201ENST00000345425 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa20.98■□□□□ 0.95
GIPC1-201ENST00000345425 MIR17HGQ75NE6 70 aa20.98■□□□□ 0.95
GIPC1-201ENST00000345425 TCF24Q7RTU0 167 aa20.98■□□□□ 0.95
GIPC1-201ENST00000345425 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
GIPC1-201ENST00000345425 TAS2R45P59539 299 aa20.97■□□□□ 0.95
GIPC1-201ENST00000345425 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
GIPC1-201ENST00000345425 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa20.97■□□□□ 0.95
GIPC1-201ENST00000345425 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
GIPC1-201ENST00000345425 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa20.97■□□□□ 0.95
GIPC1-201ENST00000345425 GALR1P47211 349 aa20.97■□□□□ 0.95
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GIPC1-201ENST00000345425 RPL11P62913 178 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
GIPC1-201ENST00000345425 FAM90A2PQ658T7 463 aa20.96■□□□□ 0.95
GIPC1-201ENST00000345425 DPPA3Q6W0C5 159 aa20.96■□□□□ 0.95
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GIPC1-201ENST00000345425 TRAV5A0A0B4J249 113 aa20.95■□□□□ 0.94
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GIPC1-201ENST00000345425 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa20.95■□□□□ 0.94
GIPC1-201ENST00000345425 LCN12Q6JVE5 192 aa20.95■□□□□ 0.94
GIPC1-201ENST00000345425 ALKAL2Q6UX46 152 aa20.95■□□□□ 0.94
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GIPC1-201ENST00000345425 STXBP6Q8NFX7 210 aa20.95■□□□□ 0.94
GIPC1-201ENST00000345425 RAB24Q969Q5 203 aa20.95■□□□□ 0.94
GIPC1-201ENST00000345425 SLC25A2Q9BXI2 301 aa20.94■□□□□ 0.94
GIPC1-201ENST00000345425 NOTCH3Q9UM47 2321 aa20.94■□□□□ 0.94
GIPC1-201ENST00000345425 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa20.93■□□□□ 0.94
GIPC1-201ENST00000345425 SULT1A2P50226 295 aa20.93■□□□□ 0.94
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GIPC1-201ENST00000345425 PAFAH1B2P68402 229 aa20.92■□□□□ 0.94
GIPC1-201ENST00000345425 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa20.92■□□□□ 0.94
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM14CQ9P0S9 112 aa20.92■□□□□ 0.94
GIPC1-201ENST00000345425 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
GIPC1-201ENST00000345425 OXLD1Q5BKU9 147 aa20.92■□□□□ 0.94
GIPC1-201ENST00000345425 FAM213BQ8TBF2 198 aa20.92■□□□□ 0.94
GIPC1-201ENST00000345425 OR7C2O60412 319 aa20.91■□□□□ 0.94
GIPC1-201ENST00000345425 PQLC2Q6ZP29 291 aa20.91■□□□□ 0.94
GIPC1-201ENST00000345425 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa20.9■□□□□ 0.94
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF785A8K8V0 405 aa20.9■□□□□ 0.94
GIPC1-201ENST00000345425 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
GIPC1-201ENST00000345425 STAG3L2P0CL84 134 aa20.9■□□□□ 0.94
GIPC1-201ENST00000345425 STAG3L3P0CL85 134 aa20.9■□□□□ 0.94
GIPC1-201ENST00000345425 GP9P14770 177 aa20.9■□□□□ 0.94
GIPC1-201ENST00000345425 FHITP49789 147 aa20.9■□□□□ 0.94
GIPC1-201ENST00000345425 TEX261Q6UWH6 196 aa20.9■□□□□ 0.94
GIPC1-201ENST00000345425 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
GIPC1-201ENST00000345425 OR51M1Q9H341 326 aa20.9■□□□□ 0.94
GIPC1-201ENST00000345425 NRN1Q9NPD7 142 aa20.9■□□□□ 0.94
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF726P1Q15940 193 aa20.9■□□□□ 0.94
GIPC1-201ENST00000345425 FAM74A1Q5RGS3 127 aa20.9■□□□□ 0.94
GIPC1-201ENST00000345425 RNF141Q8WVD5 230 aa20.9■□□□□ 0.94
GIPC1-201ENST00000345425 PAXXQ9BUH6 204 aa20.9■□□□□ 0.94
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GIPC1-201ENST00000345425 MEOX2P50222 304 aa20.89■□□□□ 0.93
GIPC1-201ENST00000345425 MS4A6AQ9H2W1 248 aa20.89■□□□□ 0.93
GIPC1-201ENST00000345425 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa20.89■□□□□ 0.93
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GIPC1-201ENST00000345425 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP20.88■□□□□ 0.93
GIPC1-201ENST00000345425 SSX7Q7RTT5 188 aa20.88■□□□□ 0.93
GIPC1-201ENST00000345425 HRH4Q9H3N8 390 aa20.88■□□□□ 0.93
GIPC1-201ENST00000345425 A0A087X0K7 114 aa20.87■□□□□ 0.93
GIPC1-201ENST00000345425 PYYP10082 97 aa20.87■□□□□ 0.93
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GIPC1-201ENST00000345425 TRAV2A0A0B4J234 112 aa20.87■□□□□ 0.93
GIPC1-201ENST00000345425 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa20.87■□□□□ 0.93
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GIPC1-201ENST00000345425 LCN15Q6UWW0 184 aa20.85■□□□□ 0.93
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF680Q8NEM1 530 aa20.85■□□□□ 0.93
GIPC1-201ENST00000345425 DNHD1Q96M86 4753 aa20.85■□□□□ 0.93
GIPC1-201ENST00000345425 OR10J4P0C629 311 aa20.85■□□□□ 0.93
GIPC1-201ENST00000345425 TFPI2P48307 235 aa20.85■□□□□ 0.93
GIPC1-201ENST00000345425 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa20.85■□□□□ 0.93
GIPC1-201ENST00000345425 DCANP1Q8TF63 244 aa20.85■□□□□ 0.93
GIPC1-201ENST00000345425 MBD3L1Q8WWY6 194 aa20.85■□□□□ 0.93
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
GIPC1-201ENST00000345425 G3V4G9 280 aa20.84■□□□□ 0.93
GIPC1-201ENST00000345425 WFDC3Q8IUB2 231 aa20.84■□□□□ 0.93
GIPC1-201ENST00000345425 SFT2D1Q8WV19 159 aa20.84■□□□□ 0.93
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