RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 C1orf159Q96HA4 380 aa18.22■□□□□ 0.51
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PTPRM-201ENST00000332175 SSC4DQ8WTU2 575 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRM-201ENST00000332175 Q71RC1 249 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
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PTPRM-201ENST00000332175 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
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PTPRM-201ENST00000332175 A0A1W2PPI3 338 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRM-201ENST00000332175 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
PTPRM-201ENST00000332175 SS18Q15532 418 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRM-201ENST00000332175 GAGE13Q4V321 117 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRM-201ENST00000332175 UBE2CO00762 179 aa18.09■□□□□ 0.49
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