RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 VWA8A3KMH1 1905 aa8.68□□□□□ -1.02
CLN8-201ENST00000331222 CD59P13987 128 aa8.68□□□□□ -1.02
CLN8-201ENST00000331222 DEFB131AP59861 70 aa8.68□□□□□ -1.02
CLN8-201ENST00000331222 hDV102S1A0JD36 115 aa8.68□□□□□ -1.02
CLN8-201ENST00000331222 GAGE2EQ4V326 116 aa8.68□□□□□ -1.02
CLN8-201ENST00000331222 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa8.68□□□□□ -1.02
CLN8-201ENST00000331222 TEX38Q6PEX7 206 aa8.68□□□□□ -1.02
CLN8-201ENST00000331222 GAGE2DQ9UEU5 116 aa8.68□□□□□ -1.02
CLN8-201ENST00000331222 DAD1P61803 113 aa8.68□□□□□ -1.02
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CLN8-201ENST00000331222 SPINK13Q1W4C9 94 aa8.68□□□□□ -1.02
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CLN8-201ENST00000331222 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa8.68□□□□□ -1.02
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CLN8-201ENST00000331222 TMEM144Q7Z5S9 345 aa8.68□□□□□ -1.02
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CLN8-201ENST00000331222 COL4A6Q14031 1691 aa8.67□□□□□ -1.02
CLN8-201ENST00000331222 GAGE12JA6NER3 117 aa8.67□□□□□ -1.02
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CLN8-201ENST00000331222 GAGE1Q13065 139 aa8.67□□□□□ -1.02
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CLN8-201ENST00000331222 GAGE5Q13069 117 aa8.67□□□□□ -1.02
CLN8-201ENST00000331222 ATXN8Q156A1 80 aa8.67□□□□□ -1.02
CLN8-201ENST00000331222 GAGE13Q4V321 117 aa8.67□□□□□ -1.02
CLN8-201ENST00000331222 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CLN8-201ENST00000331222 B4DSR2 109 aa8.67□□□□□ -1.02
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CLN8-201ENST00000331222 OVOL1O14753 267 aa8.67□□□□□ -1.02
CLN8-201ENST00000331222 DUTP33316 252 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CLN8-201ENST00000331222 SAMD5Q5TGI4 173 aa8.67□□□□□ -1.02
CLN8-201ENST00000331222 PRDM13Q9H4Q3 707 aa8.67□□□□□ -1.02
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CLN8-201ENST00000331222 GAGE2AQ6NT46 116 aa8.66□□□□□ -1.02
CLN8-201ENST00000331222 A0A087X0K7 114 aa8.66□□□□□ -1.02
CLN8-201ENST00000331222 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa8.66□□□□□ -1.02
CLN8-201ENST00000331222 UCP1P25874 307 aa8.66□□□□□ -1.02
CLN8-201ENST00000331222 TIMP3P35625 211 aa8.66□□□□□ -1.02
CLN8-201ENST00000331222 ORMDL2Q53FV1 153 aa8.66□□□□□ -1.02
CLN8-201ENST00000331222 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa8.66□□□□□ -1.02
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CLN8-201ENST00000331222 GAGE12BA1L429 117 aa8.66□□□□□ -1.02
CLN8-201ENST00000331222 LEPROTO15243 131 aa8.66□□□□□ -1.02
CLN8-201ENST00000331222 GAGE7O76087 117 aa8.66□□□□□ -1.02
CLN8-201ENST00000331222 GAGE12FP0CL80 117 aa8.66□□□□□ -1.02
CLN8-201ENST00000331222 GAGE12GP0CL81 117 aa8.66□□□□□ -1.02
CLN8-201ENST00000331222 GAGE12IP0CL82 117 aa8.66□□□□□ -1.02
CLN8-201ENST00000331222 ASPHD1Q5U4P2 390 aa8.66□□□□□ -1.02
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CLN8-201ENST00000331222 VWCEQ96DN2 955 aa8.66□□□□□ -1.02
CLN8-201ENST00000331222 Q9HAA7 133 aa8.66□□□□□ -1.02
CLN8-201ENST00000331222 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa8.65□□□□□ -1.02
CLN8-201ENST00000331222 CLPSL1A2RUU4 121 aa8.65□□□□□ -1.02
CLN8-201ENST00000331222 PAX9P55771 341 aa8.65□□□□□ -1.02
CLN8-201ENST00000331222 CD177Q8N6Q3 437 aa8.65□□□□□ -1.02
CLN8-201ENST00000331222 MGST2Q99735 147 aa8.65□□□□□ -1.02
CLN8-201ENST00000331222 WFDC1Q9HC57 220 aa8.65□□□□□ -1.02
CLN8-201ENST00000331222 COX11Q9Y6N1 276 aa8.65□□□□□ -1.02
CLN8-201ENST00000331222 NXPH4O95158 308 aa8.65□□□□□ -1.02
CLN8-201ENST00000331222 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CLN8-201ENST00000331222 Q6AWC8 147 aa8.65□□□□□ -1.02
CLN8-201ENST00000331222 TNCP24821 2201 aa8.65□□□□□ -1.02
CLN8-201ENST00000331222 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa8.65□□□□□ -1.02
CLN8-201ENST00000331222 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa8.65□□□□□ -1.02
CLN8-201ENST00000331222 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CLN8-201ENST00000331222 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa8.65□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 ZNF883P0CG24 379 aa8.65□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 DSCR9P59020 149 aa8.65□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 GAGE6Q13070 117 aa8.65□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 SNHG12Q9BXW3 62 aa8.65□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa8.65□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 A8MWV9 139 aa8.65□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 F2Z2F3 143 aa8.65□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 GHRHP01286 108 aa8.65□□□□□ -1.03
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CLN8-201ENST00000331222 C5orf30Q96GV9 206 aa8.65□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 CCL20P78556 96 aa8.64□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 NKAPP1Q8N9T2 125 aa8.64□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa8.64□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 HAPLN4Q86UW8 402 aa8.64□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 IGFBPL1Q8WX77 278 aa8.64□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 C8orf49Q96NF6 230 aa8.64□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 PRIMA1Q86XR5 153 aa8.64□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 RNF114Q9Y508 228 aa8.64□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa8.64□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 PSPNO60542 156 aa8.64□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 HGFACQ04756 655 aa8.64□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 C2orf82Q6UX34 121 aa8.64□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 EREGO14944 169 aa8.63□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
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