RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 IGLV2-8P01709 118 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXD8-201ENST00000313173 IGLC2P0DOY2 106 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXD8-201ENST00000313173 DEFB112Q30KQ8 113 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXD8-201ENST00000313173 LINC00479Q96M42 142 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXD8-201ENST00000313173 Q96MF0 132 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXD8-201ENST00000313173 HECTD1Q9ULT8 2610 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXD8-201ENST00000313173 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXD8-201ENST00000313173 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM190Q8WZ59 177 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXD8-201ENST00000313173 LINC00527Q9UJ94 153 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXD8-201ENST00000313173 ITPR2Q14571 2701 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXD8-201ENST00000313173 FAM223BA6NKX1 122 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXD8-201ENST00000313173 FSHBP01225 129 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXD8-201ENST00000313173 GCGP01275 180 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXD8-201ENST00000313173 CLEC3BP05452 202 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXD8-201ENST00000313173 FAM223AQ8IWN6 122 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF414Q96IQ9 312 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXD8-201ENST00000313173 TRBV19A0A075B6N1 114 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXD8-201ENST00000313173 A0A1W2PPQ1 181 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXD8-201ENST00000313173 ATP5G2Q06055 141 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXD8-201ENST00000313173 OR5I1Q13606 314 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXD8-201ENST00000313173 ATG101Q9BSB4 218 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM183BQ1AE95 376 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXD8-201ENST00000313173 ATP6V0BQ99437 205 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXD8-201ENST00000313173 RABAC1Q9UI14 185 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXD8-201ENST00000313173 PDZD2O15018 2839 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXD8-201ENST00000313173 FOXL1Q12952 345 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXD8-201ENST00000313173 CLEC19AQ6UXS0 136 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXD8-201ENST00000313173 SRD5A3Q9H8P0 318 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXD8-201ENST00000313173 KLF12Q9Y4X4 402 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXD8-201ENST00000313173 TRAV34A0A0B4J273 112 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXD8-201ENST00000313173 BMPR1BO00238 502 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXD8-201ENST00000313173 ISLRO14498 428 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXD8-201ENST00000313173 BRI3O95415 125 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXD8-201ENST00000313173 ERVFC1-1P60608 527 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXD8-201ENST00000313173 BLCAPP62952 87 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXD8-201ENST00000313173 TRGC2P03986 189 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXD8-201ENST00000313173 S100A7P31151 101 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXD8-201ENST00000313173 H3BUA1 57 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD8-201ENST00000313173 TCRAP04437 139 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD8-201ENST00000313173 UBE2G1P62253 170 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD8-201ENST00000313173 FABP9Q0Z7S8 132 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD8-201ENST00000313173 BTF3L4Q96K17 158 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD8-201ENST00000313173 ZFAND3Q9H8U3 227 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD8-201ENST00000313173 OSTCQ9NRP0 149 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD8-201ENST00000313173 RPH3ALQ9UNE2 315 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD8-201ENST00000313173 CSPG4Q6UVK1 2322 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD8-201ENST00000313173 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
HOXD8-201ENST00000313173 PPP5D1E7EU14 171 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXD8-201ENST00000313173 IGHV4-59P01825 116 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXD8-201ENST00000313173 TRGV3P03979 118 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXD8-201ENST00000313173 TYMSP04818 313 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXD8-201ENST00000313173 MGST1P10620 155 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
HOXD8-201ENST00000313173 PPIFP30405 207 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
HOXD8-201ENST00000313173 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
HOXD8-201ENST00000313173 TOMM20LQ6UXN7 152 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXD8-201ENST00000313173 C9orf139Q6ZV77 190 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXD8-201ENST00000313173 BAGE2Q86Y30 109 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXD8-201ENST00000313173 LYPD1Q8N2G4 141 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXD8-201ENST00000313173 GNB4Q9HAV0 340 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXD8-201ENST00000313173 AP4M1O00189 453 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXD8-201ENST00000313173 IL36BQ9NZH7 164 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXD8-201ENST00000313173 V9GYV3 84 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXD8-201ENST00000313173 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXD8-201ENST00000313173 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXD8-201ENST00000313173 FMC1Q96HJ9 113 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXD8-201ENST00000313173 C17orf77Q96MU5 243 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXD8-201ENST00000313173 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
HOXD8-201ENST00000313173 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD8-201ENST00000313173 SLC17A3O00476 420 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD8-201ENST00000313173 RPL7P18124 248 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
HOXD8-201ENST00000313173 IER3P46695 156 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD8-201ENST00000313173 PDE6HQ13956 83 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD8-201ENST00000313173 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD8-201ENST00000313173 Q6ZS46 218 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD8-201ENST00000313173 NHLRC2Q8NBF2 726 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD8-201ENST00000313173 CMTM2Q8TAZ6 248 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD8-201ENST00000313173 SMIM12Q96EX1 92 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD8-201ENST00000313173 CYB5R2Q6BCY4 276 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD8-201ENST00000313173 OR5R1Q8NH85 324 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD8-201ENST00000313173 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF580Q9UK33 172 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD8-201ENST00000313173 CCDC168Q8NDH2 2452 aa20.77■□□□□ 0.92
HOXD8-201ENST00000313173 TPPP2P59282 170 aa20.77■□□□□ 0.92
HOXD8-201ENST00000313173 ZANQ9Y493 2812 aa20.77■□□□□ 0.92
HOXD8-201ENST00000313173 RELQ04864 619 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
HOXD8-201ENST00000313173 WFDC11Q8NEX6 87 aa20.76■□□□□ 0.91
HOXD8-201ENST00000313173 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa20.76■□□□□ 0.91
HOXD8-201ENST00000313173 PHOX2AO14813 284 aa20.76■□□□□ 0.91
HOXD8-201ENST00000313173 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
HOXD8-201ENST00000313173 GPR82Q96P67 336 aa20.76■□□□□ 0.91
HOXD8-201ENST00000313173 RPEL1Q2QD12 228 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXD8-201ENST00000313173 OR8I2Q8N0Y5 310 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXD8-201ENST00000313173 USMG5Q96IX5 58 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXD8-201ENST00000313173 CREBBPQ92793 2442 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXD8-201ENST00000313173 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXD8-201ENST00000313173 HIST1H2BKO60814 126 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXD8-201ENST00000313173 HIST1H2BJP06899 126 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXD8-201ENST00000313173 HIST1H2BOP23527 126 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXD8-201ENST00000313173 HIST1H2BBP33778 126 aa20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms