RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282841.9

GGPS1-201, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGPS1, Length 2,895 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-201ENST00000282841 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 HIST1H2BHQ93079 126 aa8.61□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF503Q96F45 646 aa8.61□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 HIST1H2BNQ99877 126 aa8.61□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 HIST1H2BMQ99879 126 aa8.61□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 TUBA4BQ9H853 241 aa8.61□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 C1RLQ9NZP8 487 aa8.61□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 NAGKQ9UJ70 344 aa8.61□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 COX7A2P2O60397 106 aa8.61□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 CRYGCP07315 174 aa8.61□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 COMMD1Q8N668 190 aa8.61□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 PGPEP1LA6NFU8 196 aa8.6□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 IGKV1-17P01599 117 aa8.6□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 RHOBP62745 196 aa8.6□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 Q56UQ5 140 aa8.6□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa8.6□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF114Q8NC26 417 aa8.6□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 FBXL7Q9UJT9 491 aa8.6□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 SELENOKQ9Y6D0 94 aa8.6□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF727A8MUV8 499 aa8.6□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 C11orf94C9JXX5 98 aa8.6□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 HLA-DRB1P01911 266 aa8.6□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 IGLC1P0CG04 106 aa8.6□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 STAG3L2P0CL84 134 aa8.6□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 NPPCP23582 126 aa8.6□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 PSMB3P49720 205 aa8.6□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 OCIAD2Q56VL3 154 aa8.6□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 LINC00305Q7Z4B0 112 aa8.6□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 TMEM116Q8NCL8 245 aa8.6□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 CITED1Q99966 193 aa8.6□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 VAX2Q9UIW0 290 aa8.6□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 FUT9Q9Y231 359 aa8.6□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa8.59□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 H3BQ15 152 aa8.59□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 GCHFRP30047 84 aa8.59□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF329Q86UD4 541 aa8.59□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 OR5AU1Q8NGC0 362 aa8.59□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 HIVEP1P15822 2718 aa8.59□□□□□ -1.03
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GGPS1-201ENST00000282841 PSMB11A5LHX3 300 aa8.59□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 CRYBA4P53673 196 aa8.59□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 C15orf32Q32M92 178 aa8.59□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 C10orf113Q5VZT2 155 aa8.59□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 FAM90A2PQ658T7 463 aa8.59□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 C10orf99Q6UWK7 81 aa8.59□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 OR2D3Q8NGH3 330 aa8.59□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 BLNKQ8WV28 456 aa8.59□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 SMR3AQ99954 134 aa8.59□□□□□ -1.03
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GGPS1-201ENST00000282841 MOB4Q9Y3A3 225 aa8.59□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa8.59□□□□□ -1.04
GGPS1-201ENST00000282841 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa8.59□□□□□ -1.04
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GGPS1-201ENST00000282841 RHOGP84095 191 aa8.59□□□□□ -1.04
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GGPS1-201ENST00000282841 THAP8Q8NA92 274 aa8.59□□□□□ -1.04
GGPS1-201ENST00000282841 SGMS2Q8NHU3 365 aa8.59□□□□□ -1.04
GGPS1-201ENST00000282841 CHRDL1Q9BU40 450 aa8.59□□□□□ -1.04
GGPS1-201ENST00000282841 SLC25A2Q9BXI2 301 aa8.59□□□□□ -1.04
GGPS1-201ENST00000282841 HIVEP2P31629 2446 aa8.58□□□□□ -1.04
GGPS1-201ENST00000282841 FNDC10F2Z333 226 aa8.58□□□□□ -1.04
GGPS1-201ENST00000282841 F8W735 103 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
GGPS1-201ENST00000282841 GPR183P32249 361 aa8.58□□□□□ -1.04
GGPS1-201ENST00000282841 SGK494Q96LW2 274 aa8.58□□□□□ -1.04
GGPS1-201ENST00000282841 JMJD1CQ15652 2540 aa8.58□□□□□ -1.04
GGPS1-201ENST00000282841 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa8.58□□□□□ -1.04
GGPS1-201ENST00000282841 SCO2A0A1W2PP80 73 aa8.58□□□□□ -1.04
GGPS1-201ENST00000282841 NDUFB4O95168 129 aa8.58□□□□□ -1.04
GGPS1-201ENST00000282841 CXorf1O96002 111 aa8.58□□□□□ -1.04
GGPS1-201ENST00000282841 IGHV3-11P01762 117 aa8.58□□□□□ -1.04
GGPS1-201ENST00000282841 PVRIGQ6DKI7 326 aa8.58□□□□□ -1.04
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GGPS1-201ENST00000282841 WNK1Q9H4A3 2382 aa8.58□□□□□ -1.04
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GGPS1-201ENST00000282841 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa8.57□□□□□ -1.04
GGPS1-201ENST00000282841 KLK15Q9H2R5 256 aa8.57□□□□□ -1.04
GGPS1-201ENST00000282841 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa8.57□□□□□ -1.04
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GGPS1-201ENST00000282841 CST9LQ9H4G1 147 aa8.57□□□□□ -1.04
GGPS1-201ENST00000282841 KCNIP2Q9NS61 270 aa8.57□□□□□ -1.04
GGPS1-201ENST00000282841 C21orf62Q9NYP8 219 aa8.57□□□□□ -1.04
GGPS1-201ENST00000282841 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
GGPS1-201ENST00000282841 PPP5D1E7EU14 171 aa8.56□□□□□ -1.04
GGPS1-201ENST00000282841 CORTO00230 105 aa8.56□□□□□ -1.04
GGPS1-201ENST00000282841 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
GGPS1-201ENST00000282841 OR2C1O95371 312 aa8.56□□□□□ -1.04
GGPS1-201ENST00000282841 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
GGPS1-201ENST00000282841 Q71RC1 249 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
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