RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273317.4

LIMD1-201, Transcript of LIM domains containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMD1, Length 11,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-201ENST00000273317 PYYP10082 97 aa6.6□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 ZNF415Q09FC8 603 aa6.6□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 TREML4Q6UXN2 200 aa6.6□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.6□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 DPH3P1Q9H4G8 78 aa6.6□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.6□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 LTBP1Q14766 1721 aa6.6□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 KIAA1671Q9BY89 1806 aa6.6□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 TRAV5A0A0B4J249 113 aa6.6□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 LYPD3O95274 346 aa6.6□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
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LIMD1-201ENST00000273317 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 Q6ZS49 121 aa6.59□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 LINC01551Q86U37 167 aa6.59□□□□□ -1.35
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LIMD1-201ENST00000273317 TRAV41A0A0B4J266 112 aa6.59□□□□□ -1.35
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LIMD1-201ENST00000273317 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
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LIMD1-201ENST00000273317 C2orf82Q6UX34 121 aa6.59□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 FAM223AQ8IWN6 122 aa6.59□□□□□ -1.35
LIMD1-201ENST00000273317 D6R8Y8 96 aa6.59□□□□□ -1.35
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LIMD1-201ENST00000273317 IL18BPO95998 194 aa6.59□□□□□ -1.35
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LIMD1-201ENST00000273317 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa6.59□□□□□ -1.36
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LIMD1-201ENST00000273317 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa6.59□□□□□ -1.36
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LIMD1-201ENST00000273317 C15orf32Q32M92 178 aa6.58□□□□□ -1.36
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LIMD1-201ENST00000273317 LINC00477Q96M19 166 aa6.58□□□□□ -1.36
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LIMD1-201ENST00000273317 SH2D1AO60880 128 aa6.57□□□□□ -1.36
LIMD1-201ENST00000273317 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
LIMD1-201ENST00000273317 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
LIMD1-201ENST00000273317 GLMPQ8WWB7 406 aa6.57□□□□□ -1.36
LIMD1-201ENST00000273317 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa6.57□□□□□ -1.36
LIMD1-201ENST00000273317 FAM27E3Q08E93 113 aa6.57□□□□□ -1.36
LIMD1-201ENST00000273317 TMEM75Q8N9X5 138 aa6.57□□□□□ -1.36
LIMD1-201ENST00000273317 WFDC12Q8WWY7 111 aa6.57□□□□□ -1.36
LIMD1-201ENST00000273317 TMEM141Q96I45 108 aa6.57□□□□□ -1.36
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