RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262539.7

PTPN3-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPN3, Length 6,832 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3-201ENST00000262539 K7EM74 188 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 ERASQ7Z444 233 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 ISOC2Q96AB3 205 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 ESPL1Q14674 2120 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 HOXA5P20719 270 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 CCL20P78556 96 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 PDE6HQ13956 83 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 DMRTA1Q5VZB9 504 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF581Q9P0T4 197 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 SIGLEC9Q9Y336 463 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 DOCK10Q96BY6 2186 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 TRAV21A0A0B4J279 112 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 C1QL4Q86Z23 238 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 WFDC1Q9HC57 220 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 WNK2Q9Y3S1 2297 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 TRGV11A0A075B6L2 103 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 NDUFB8O95169 186 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 RHOGP84095 191 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 GTF3C1Q12789 2109 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 MSMPQ1L6U9 139 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF600Q6ZNG1 722 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 CEP192Q8TEP8 1941 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 F8WEM9 126 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 PEX7O00628 323 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 PRR20EP86478 221 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 PRR20CP86479 221 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 PRR20DP86480 221 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 PRR20BP86481 221 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 PRR20AP86496 221 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 C18orf15Q96N68 181 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 C1QL1O75973 258 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 ADORA2A-AS1P86434 159 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 BRD3OSQ6XYD6 125 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 TMEM136Q6ZRR5 245 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 ATP5LO75964 103 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 HLA-DQA1P01909 254 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 CRYGCP07315 174 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 SLC50A1Q9BRV3 221 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 GRIFINA4D1Z8 144 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 CACNA1BQ00975 2339 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 RAMP3O60896 148 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 NDUFA3O95167 84 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 GHRHP01286 108 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 FABP2P12104 132 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 OR10AG1Q8NH19 301 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 OSTCQ9NRP0 149 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 COL6A6A6NMZ7 2263 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 FAM231BA6NCW3 169 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 PLA2G5P39877 138 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 TRAV41A0A0B4J266 112 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 SMIM6P0DI80 62 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 MDKP21741 143 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 KLRD1Q13241 179 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 FBLN7Q53RD9 439 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 THAP8Q8NA92 274 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 PARLQ9H300 379 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 EBI3Q14213 229 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 SPATA45Q537H7 98 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 KCNS1Q96KK3 526 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 TMEM89A2RUT3 159 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 LEPROTL1O95214 131 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 SELLP14151 372 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 PAX8Q06710 450 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 RCHY1Q96PM5 261 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 ST20Q9HBF5 79 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 TRANK1O15050 2925 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 LINC00158P58513 81 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 TTC32Q5I0X7 151 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 ACTL10Q5JWF8 245 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 C10orf126Q8N4M7 172 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 UBE2E2Q96LR5 201 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 A0A1B0GV72 72 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 NPIPB5A8MRT5 1133 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 Q6ZPA2 131 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 EML5Q05BV3 1969 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 SOD3P08294 240 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 RASL11AQ6T310 242 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 SPG11Q96JI7 2443 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 CD28P10747 220 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 TMEM95Q3KNT9 176 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 PCNX1Q96RV3 2341 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 RPL32P62910 135 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPN3-201ENST00000262539 C1orf194Q5T5A4 169 aa6.63□□□□□ -1.35
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