RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261667.7

KPNA3-201, Transcript of karyopherin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KPNA3, Length 4,474 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3-201ENST00000261667 LILRA5A6NI73 299 aa8.75□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 MYO7BQ6PIF6 2116 aa8.75□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa8.75□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 A0A1W2PPI3 338 aa8.75□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 C2CD4DB7Z1M9 353 aa8.75□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 SMKR1H3BMG3 65 aa8.75□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 H7C1H1 209 aa8.75□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 TMEM196Q5HYL7 178 aa8.75□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 MORN5Q5VZ52 161 aa8.75□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 SLC25A15Q9Y619 301 aa8.75□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 XIRP2A4UGR9 3374 aa8.75□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 FANCMQ8IYD8 2048 aa8.75□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa8.75□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa8.75□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 CFPP27918 469 aa8.75□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 CHCHD5Q9BSY4 110 aa8.75□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 DKK2Q9UBU2 259 aa8.75□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 DOCK10Q96BY6 2186 aa8.75□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 GCSAMQ8N6F7 178 aa8.74□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 TM4SF19Q96DZ7 209 aa8.74□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa8.74□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 NTF4P34130 210 aa8.74□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 DEFB123Q8N688 67 aa8.74□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa8.74□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 OTORQ9NRC9 128 aa8.74□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 K7EN84 100 aa8.74□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 LAGE3Q14657 143 aa8.74□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 PRO1854Q9UHT4 67 aa8.74□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 IGHMP01871 453 aa8.74□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 CCL7P80098 99 aa8.74□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 ASCL5Q7RTU5 278 aa8.74□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 BDP1A6H8Y1 2624 aa8.74□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 M0R381 172 aa8.73□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 HLA-DRB4P13762 266 aa8.73□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 LINC01545Q5VT33 79 aa8.73□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa8.73□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 TTC28Q96AY4 2481 aa8.73□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 CRYGCP07315 174 aa8.73□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa8.73□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 ASPHD1Q5U4P2 390 aa8.73□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 GPR179Q6PRD1 2367 aa8.73□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 WNK2Q9Y3S1 2297 aa8.73□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 MGST3O14880 152 aa8.73□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 SPRY3O43610 288 aa8.73□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 PPP1R17O96001 155 aa8.73□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 CD3EP07766 207 aa8.73□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 ARMS2P0C7Q2 107 aa8.73□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 ORMDL2Q53FV1 153 aa8.73□□□□□ -1.01
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KPNA3-201ENST00000261667 SZT2Q5T011 3432 aa8.73□□□□□ -1.01
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KPNA3-201ENST00000261667 TMEM258P61165 79 aa8.72□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 NPC2P61916 151 aa8.72□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 HERVK_113P63121 156 aa8.72□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 LYZL1Q6UWQ5 148 aa8.72□□□□□ -1.01
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KPNA3-201ENST00000261667 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 PILRAQ9UKJ1 303 aa8.72□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 RNF182Q8N6D2 247 aa8.72□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 TTTY13Q9BZ97 58 aa8.72□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 C5orf42Q9H799 3197 aa8.72□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 C12orf77C9JDV5 145 aa8.72□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 RPL39P5Q59GN2 51 aa8.72□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 CXXC4Q9H2H0 198 aa8.72□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 SLC25A16P16260 332 aa8.72□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 SMIM10L1P0DMW3 83 aa8.71□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 NPPCP23582 126 aa8.71□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 GATD1Q8NB37 220 aa8.71□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 TMEM54Q969K7 222 aa8.71□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 SMIM10Q96HG1 83 aa8.71□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 SHANK1Q9Y566 2161 aa8.71□□□□□ -1.01
KPNA3-201ENST00000261667 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa8.71□□□□□ -1.02
KPNA3-201ENST00000261667 LEAP2Q969E1 77 aa8.71□□□□□ -1.02
KPNA3-201ENST00000261667 ACACAQ13085 2346 aa8.71□□□□□ -1.02
KPNA3-201ENST00000261667 XGP55808 180 aa8.71□□□□□ -1.02
KPNA3-201ENST00000261667 OR13A1Q8NGR1 328 aa8.71□□□□□ -1.02
KPNA3-201ENST00000261667 TRPM6Q9BX84 2022 aa8.71□□□□□ -1.02
KPNA3-201ENST00000261667 COL4A2P08572 1712 aa8.71□□□□□ -1.02
KPNA3-201ENST00000261667 A0A1B0GX51 115 aa8.7□□□□□ -1.02
KPNA3-201ENST00000261667 C2orf70A6NJV1 201 aa8.7□□□□□ -1.02
KPNA3-201ENST00000261667 CD7P09564 240 aa8.7□□□□□ -1.02
KPNA3-201ENST00000261667 IL11RAQ14626 422 aa8.7□□□□□ -1.02
KPNA3-201ENST00000261667 DNAJC30Q96LL9 226 aa8.7□□□□□ -1.02
KPNA3-201ENST00000261667 CARD19Q96LW7 228 aa8.7□□□□□ -1.02
KPNA3-201ENST00000261667 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
KPNA3-201ENST00000261667 ZNF581Q9P0T4 197 aa8.7□□□□□ -1.02
KPNA3-201ENST00000261667 ATOX1O00244 68 aa8.7□□□□□ -1.02
KPNA3-201ENST00000261667 HLA-DMBP28068 263 aa8.7□□□□□ -1.02
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