RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637068.1

TCF4-282, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 142 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-282	ENST00000637068	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	NECAB1	Q8N987	351 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	PIGB	Q92521	554 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	BAP1	Q92560	729 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	MAP4K1	Q92918	833 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	EVI5L	Q96CN4	794 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	STRN4	Q9NRL3	753 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	ATG3	Q9NT62	314 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	MTMR6	Q9Y217	621 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	LY75	O60449	1722 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068		M0R2C6	588 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	ATP5J	P18859	108 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	WNT7B	P56706	349 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	KCNH2	Q12809	1159 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	SCARF1	Q14162	830 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	HLF	Q16534	295 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	LINC01559	Q495D7	138 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	VPS53	Q5VIR6	699 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	DESI1	Q6ICB0	168 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	LYPD8	Q6UX82	237 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	HAUS7	Q99871	368 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	MAST3	O60307	1309 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	SYCE3	A1L190	88 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	AXIN1	O15169	862 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	JAK2	O60674	1132 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	LILRB3	O75022	631 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	SYT1	P21579	422 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	MCC	P23508	829 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	MRE11	P49959	708 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	TIMM10	P62072	90 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	PI16	Q6UXB8	463 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	USP48	Q86UV5	1035 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	FSD1	Q9BTV5	496 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	MAP10	Q9P2G4	905 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	NHS	Q6T4R5	1651 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	MYH1	P12882	1939 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	EYA2	O00167	538 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	AP5Z1	O43299	807 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	CTDNEP1	O95476	244 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	ALDH1A1	P00352	501 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	F13A1	P00488	732 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	CYP21A2	P08686	494 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	RPS6KB1	P23443	525 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	GJB2	P29033	226 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-282	ENST00000637068	MCM2	P49736	904 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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