RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637003.1

ARID1B-222, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, human

TSL 5 BASIC

Gene ARID1B, Length 1,290 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARID1B-222	ENST00000637003	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	18.5	■□□□□ 0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		18.5	■□□□□ 0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	18.5	■□□□□ 0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		18.49	■□□□□ 0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	GOLIM4	O00461	696 aa		18.49	■□□□□ 0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	NF2	P35240	595 aa		18.49	■□□□□ 0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	TCP10	Q12799	353 aa		18.49	■□□□□ 0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	TNFAIP1	Q13829	316 aa		18.49	■□□□□ 0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	18.49	■□□□□ 0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	SLF2	Q8IX21	1173 aa		18.49	■□□□□ 0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	TNNI2	P48788	182 aa		18.48	■□□□□ 0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	GSTO1	P78417	241 aa		18.48	■□□□□ 0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	AAMP	Q13685	434 aa		18.48	■□□□□ 0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		18.48	■□□□□ 0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		18.48	■□□□□ 0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		18.48	■□□□□ 0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	18.48	■□□□□ 0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	CAPNS2	Q96L46	248 aa		18.48	■□□□□ 0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	TEPSIN	Q96N21	525 aa		18.48	■□□□□ 0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		18.48	■□□□□ 0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		18.47	■□□□□ 0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	AOC2	O75106	756 aa		18.47	■□□□□ 0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	LDHC	P07864	332 aa		18.47	■□□□□ 0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	ATP5J	P18859	108 aa		18.47	■□□□□ 0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	18.47	■□□□□ 0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	18.47	■□□□□ 0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		18.47	■□□□□ 0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	18.47	■□□□□ 0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	18.47	■□□□□ 0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		18.47	■□□□□ 0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	CYP7A1	P22680	504 aa		18.46	■□□□□ 0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	RHBDL3	P58872	404 aa		18.46	■□□□□ 0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	PICALM	Q13492	652 aa		18.46	■□□□□ 0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		18.46	■□□□□ 0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		18.46	■□□□□ 0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	GCC1	Q96CN9	775 aa		18.46	■□□□□ 0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		18.46	■□□□□ 0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	18.46	■□□□□ 0.55
ARID1B-222	ENST00000637003	RGS3	P49796	1198 aa		18.45	■□□□□ 0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	18.45	■□□□□ 0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	18.45	■□□□□ 0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		18.45	■□□□□ 0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	RGMB	Q6NW40	437 aa		18.45	■□□□□ 0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		18.45	■□□□□ 0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	ZIC5	Q96T25	663 aa		18.45	■□□□□ 0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	18.45	■□□□□ 0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		18.45	■□□□□ 0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		18.45	■□□□□ 0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	18.44	■□□□□ 0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	18.44	■□□□□ 0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	CHGB	P05060	677 aa		18.44	■□□□□ 0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	FKBP1B	P68106	108 aa		18.44	■□□□□ 0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	MAP3K12	Q12852	859 aa		18.44	■□□□□ 0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		18.44	■□□□□ 0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	FAM83A	Q86UY5	434 aa		18.44	■□□□□ 0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		18.44	■□□□□ 0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	18.44	■□□□□ 0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	FAM151A	Q8WW52	585 aa		18.44	■□□□□ 0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	HAUS7	Q99871	368 aa		18.44	■□□□□ 0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	18.44	■□□□□ 0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		18.44	■□□□□ 0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	18.43	■□□□□ 0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	18.43	■□□□□ 0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	SLURP2	P0DP57	97 aa		18.43	■□□□□ 0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	ECE1	P42892	770 aa		18.43	■□□□□ 0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		18.43	■□□□□ 0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	TEX11	Q8IYF3	940 aa		18.43	■□□□□ 0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	JMY	Q8N9B5	988 aa		18.43	■□□□□ 0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	LNPK	Q9C0E8	428 aa		18.43	■□□□□ 0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	18.42	■□□□□ 0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		18.42	■□□□□ 0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	GPATCH3	Q96I76	525 aa		18.42	■□□□□ 0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		18.42	■□□□□ 0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		18.42	■□□□□ 0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	18.42	■□□□□ 0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	IDI2	Q9BXS1	227 aa		18.42	■□□□□ 0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	BAG3	O95817	575 aa		18.41	■□□□□ 0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	PDE6A	P16499	860 aa		18.41	■□□□□ 0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		18.41	■□□□□ 0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		18.41	■□□□□ 0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	SMC5	Q8IY18	1101 aa		18.41	■□□□□ 0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	18.4	■□□□□ 0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		18.4	■□□□□ 0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		18.4	■□□□□ 0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		18.4	■□□□□ 0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		18.4	■□□□□ 0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		18.4	■□□□□ 0.54
ARID1B-222	ENST00000637003	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		18.39	■□□□□ 0.53
ARID1B-222	ENST00000637003	ENTPD3	O75355	529 aa		18.39	■□□□□ 0.53
ARID1B-222	ENST00000637003	SLC10A3	P09131	477 aa		18.39	■□□□□ 0.53
ARID1B-222	ENST00000637003	MX1	P20591	662 aa		18.39	■□□□□ 0.53
ARID1B-222	ENST00000637003	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	18.39	■□□□□ 0.53
ARID1B-222	ENST00000637003	PPP4C	P60510	307 aa		18.39	■□□□□ 0.53
ARID1B-222	ENST00000637003	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		18.39	■□□□□ 0.53
ARID1B-222	ENST00000637003	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		18.39	■□□□□ 0.53
ARID1B-222	ENST00000637003	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		18.39	■□□□□ 0.53
ARID1B-222	ENST00000637003	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	18.38	■□□□□ 0.53

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