RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629219.1

PKP4-218, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PKP4, Length 162 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-218ENST00000629219 PRDX5P30044 214 aa11.19□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 ADORA1P30542 326 aa11.19□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 MOB2Q70IA6 237 aa11.19□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 DDX19BQ9UMR2 479 aa11.19□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 DOCK2Q92608 1830 aa11.19□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 USP2O75604 605 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 TIMM10P62072 90 aa11.18□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 PDE3AQ14432 1141 aa11.18□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 CEP85Q6P2H3 762 aa11.18□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 IDI2Q9BXS1 227 aa11.18□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 RCAN3Q9UKA8 241 aa11.18□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa11.18□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa11.17□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 TNNI3KQ59H18 835 aa11.17□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 DCAF15Q66K64 600 aa11.17□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 ERC1Q8IUD2 1116 aa11.17□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP11.17□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 FAM151AQ8WW52 585 aa11.17□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 SLC10A4Q96EP9 437 aa11.17□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 WNK4Q96J92 1243 aa11.17□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa11.17□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 AK9Q5TCS8 1911 aa11.16□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 TCP10L2B9ZVM9 353 aa11.16□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 ENTPD3O75355 529 aa11.16□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 GSTO1P78417 241 aa11.16□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa11.16□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 SPATA5Q8NB90 893 aa11.16□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 TMEM39BQ9GZU3 492 aa11.16□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa11.16□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 HMG20BQ9P0W2 317 aa11.16□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 HTTP42858 3142 aa11.15□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa11.15□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 FOCADQ5VW36 1801 aa11.15□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa11.15□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 HMMRO75330 724 aa11.15□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 SURF6O75683 361 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 LDHCP07864 332 aa11.15□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 MAP3K9P80192 1104 aa11.15□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 DIXDC1Q155Q3 683 aa11.15□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 CCDC158Q5M9N0 1113 aa11.15□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 GORABQ5T7V8 394 aa11.15□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 ERICH6Q7L0X2 663 aa11.15□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 PANK1Q8TE04 598 aa11.15□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 NEUROD6Q96NK8 337 aa11.15□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 ZNF112Q9UJU3 913 aa11.15□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 HPS5Q9UPZ3 1129 aa11.15□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 CSADQ9Y600 493 aa11.15□□□□□ -0.62
PKP4-218ENST00000629219 ATRNL1Q5VV63 1379 aa11.15□□□□□ -0.63
PKP4-218ENST00000629219 SPDYE5A6NIY4 337 aa11.14□□□□□ -0.63
PKP4-218ENST00000629219 TBC1D8O95759 1140 aa11.14□□□□□ -0.63
PKP4-218ENST00000629219 MCAMP43121 646 aa11.14□□□□□ -0.63
PKP4-218ENST00000629219 MAP3K10Q02779 954 aa11.14□□□□□ -0.63
PKP4-218ENST00000629219 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
PKP4-218ENST00000629219 PRKG1Q13976 671 aa11.14□□□□□ -0.63
PKP4-218ENST00000629219 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
PKP4-218ENST00000629219 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa11.14□□□□□ -0.63
PKP4-218ENST00000629219 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
PKP4-218ENST00000629219 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
PKP4-218ENST00000629219 ZNF341Q9BYN7 854 aa11.14□□□□□ -0.63
PKP4-218ENST00000629219 C1orf115Q9H7X2 142 aa11.14□□□□□ -0.63
PKP4-218ENST00000629219 ABCF2Q9UG63 623 aa11.14□□□□□ -0.63
PKP4-218ENST00000629219 CENPFP49454 3210 aa11.13□□□□□ -0.63
PKP4-218ENST00000629219 CACNB3P54284 484 aa11.13□□□□□ -0.63
PKP4-218ENST00000629219 MECOMQ03112 1051 aa11.13□□□□□ -0.63
PKP4-218ENST00000629219 VGLL4Q14135 290 aa11.13□□□□□ -0.63
PKP4-218ENST00000629219 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
PKP4-218ENST00000629219 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
PKP4-218ENST00000629219 ERO1BQ86YB8 467 aa11.13□□□□□ -0.63
PKP4-218ENST00000629219 IFNL1Q8IU54 200 aa11.13□□□□□ -0.63
PKP4-218ENST00000629219 CERS3Q8IU89 383 aa11.13□□□□□ -0.63
PKP4-218ENST00000629219 CDAN1Q8IWY9 1227 aa11.13□□□□□ -0.63
PKP4-218ENST00000629219 CLMNQ96JQ2 1002 aa11.13□□□□□ -0.63
PKP4-218ENST00000629219 USP40Q9NVE5 1235 aa11.13□□□□□ -0.63
PKP4-218ENST00000629219 FAM198AQ9UFP1 575 aa11.13□□□□□ -0.63
PKP4-218ENST00000629219 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa11.12□□□□□ -0.63
PKP4-218ENST00000629219 TBC1D12O60347 775 aa11.12□□□□□ -0.63
PKP4-218ENST00000629219 RAB11FIP3O75154 756 aa11.12□□□□□ -0.63
PKP4-218ENST00000629219 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
PKP4-218ENST00000629219 GJA5P36382 358 aa11.12□□□□□ -0.63
PKP4-218ENST00000629219 GTF2A2P52657 109 aa11.12□□□□□ -0.63
PKP4-218ENST00000629219 RHBDL3P58872 404 aa11.12□□□□□ -0.63
PKP4-218ENST00000629219 NFIAQ12857 509 aa11.12□□□□□ -0.63
PKP4-218ENST00000629219 PPIL2Q13356 520 aa11.12□□□□□ -0.63
PKP4-218ENST00000629219 TTC39AQ5SRH9 613 aa11.12□□□□□ -0.63
PKP4-218ENST00000629219 ZNF384Q8TF68 577 aa11.12□□□□□ -0.63
PKP4-218ENST00000629219 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP11.12□□□□□ -0.63
PKP4-218ENST00000629219 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms