RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621029.4

SEMA3B-215, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-215ENST00000621029 ABHD8Q96I13 439 aa35.71■■■■□ 3.31
SEMA3B-215ENST00000621029 RCAN3Q9UKA8 241 aa35.71■■■■□ 3.31
SEMA3B-215ENST00000621029 TCP10Q12799 353 aa35.7■■■■□ 3.31
SEMA3B-215ENST00000621029 DGKZQ13574 1117 aa35.7■■■■□ 3.31
SEMA3B-215ENST00000621029 SLF2Q8IX21 1173 aa35.7■■■■□ 3.31
SEMA3B-215ENST00000621029 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa35.7■■■■□ 3.31
SEMA3B-215ENST00000621029 MAP3K9P80192 1104 aa35.69■■■■□ 3.3
SEMA3B-215ENST00000621029 SPATA5Q8NB90 893 aa35.69■■■■□ 3.3
SEMA3B-215ENST00000621029 HMG20BQ9P0W2 317 aa35.69■■■■□ 3.3
SEMA3B-215ENST00000621029 CSADQ9Y600 493 aa35.69■■■■□ 3.3
SEMA3B-215ENST00000621029 INHBEP58166 350 aa35.68■■■■□ 3.3
SEMA3B-215ENST00000621029 TNNI3KQ59H18 835 aa35.68■■■■□ 3.3
SEMA3B-215ENST00000621029 ERICH6Q7L0X2 663 aa35.68■■■■□ 3.3
SEMA3B-215ENST00000621029 FAM151AQ8WW52 585 aa35.68■■■■□ 3.3
SEMA3B-215ENST00000621029 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa35.68■■■■□ 3.3
SEMA3B-215ENST00000621029 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa35.67■■■■□ 3.3
SEMA3B-215ENST00000621029 MCOLN1Q9GZU1 580 aa35.67■■■■□ 3.3
SEMA3B-215ENST00000621029 GPR108Q9NPR9 543 aa35.67■■■■□ 3.3
SEMA3B-215ENST00000621029 TTC39AQ5SRH9 613 aa35.66■■■■□ 3.3
SEMA3B-215ENST00000621029 DCAF15Q66K64 600 aa35.66■■■■□ 3.3
SEMA3B-215ENST00000621029 CEP85Q6P2H3 762 aa35.66■■■■□ 3.3
SEMA3B-215ENST00000621029 PI16Q6UXB8 463 aa35.66■■■■□ 3.3
SEMA3B-215ENST00000621029 OPTNQ96CV9 577 aa35.66■■■■□ 3.3
SEMA3B-215ENST00000621029 NFIAQ12857 509 aa35.65■■■■□ 3.3
SEMA3B-215ENST00000621029 VGLL4Q14135 290 aa35.65■■■■□ 3.3
SEMA3B-215ENST00000621029 CCDC158Q5M9N0 1113 aa35.65■■■■□ 3.3
SEMA3B-215ENST00000621029 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP35.65■■■■□ 3.3
SEMA3B-215ENST00000621029 COG6Q9Y2V7 657 aa35.65■■■■□ 3.3
SEMA3B-215ENST00000621029 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP35.64■■■■□ 3.3
SEMA3B-215ENST00000621029 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa35.64■■■■□ 3.3
SEMA3B-215ENST00000621029 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP35.64■■■■□ 3.3
SEMA3B-215ENST00000621029 WRNIP1Q96S55 665 aa35.64■■■■□ 3.3
SEMA3B-215ENST00000621029 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
SEMA3B-215ENST00000621029 ALDH1A1P00352 501 aa35.63■■■■□ 3.29
SEMA3B-215ENST00000621029 GJA5P36382 358 aa35.63■■■■□ 3.29
SEMA3B-215ENST00000621029 MECOMQ03112 1051 aa35.63■■■■□ 3.29
SEMA3B-215ENST00000621029 MIGA2Q7L4E1 593 aa35.63■■■■□ 3.29
SEMA3B-215ENST00000621029 DBNDD2Q9BQY9 259 aa35.63■■■■□ 3.29
SEMA3B-215ENST00000621029 RAI14Q9P0K7 980 aa35.63■■■■□ 3.29
SEMA3B-215ENST00000621029 IFNL1Q8IU54 200 aa35.62■■■■□ 3.29
SEMA3B-215ENST00000621029 DDX19BQ9UMR2 479 aa35.62■■■■□ 3.29
SEMA3B-215ENST00000621029 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP35.62■■■■□ 3.29
SEMA3B-215ENST00000621029 GAKO14976 1311 aa35.61■■■■□ 3.29
SEMA3B-215ENST00000621029 MCAMP43121 646 aa35.61■■■■□ 3.29
SEMA3B-215ENST00000621029 BTDP43251 543 aa35.61■■■■□ 3.29
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF341Q9BYN7 854 aa35.61■■■■□ 3.29
SEMA3B-215ENST00000621029 SNRKQ9NRH2 765 aa35.61■■■■□ 3.29
SEMA3B-215ENST00000621029 LRP2BPQ9P2M1 347 aa35.61■■■■□ 3.29
SEMA3B-215ENST00000621029 CCDC85CA6NKD9 419 aa35.6■■■■□ 3.29
SEMA3B-215ENST00000621029 GSTO1P78417 241 aa35.6■■■■□ 3.29
SEMA3B-215ENST00000621029 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa35.6■■■■□ 3.29
SEMA3B-215ENST00000621029 OTUD5Q96G74 571 aa35.6■■■■□ 3.29
SEMA3B-215ENST00000621029 FAM198AQ9UFP1 575 aa35.6■■■■□ 3.29
SEMA3B-215ENST00000621029 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa35.59■■■■□ 3.29
SEMA3B-215ENST00000621029 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa35.59■■■■□ 3.29
SEMA3B-215ENST00000621029 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP35.59■■■■□ 3.29
SEMA3B-215ENST00000621029 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP35.59■■■■□ 3.29
SEMA3B-215ENST00000621029 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa35.59■■■■□ 3.29
SEMA3B-215ENST00000621029 LDHCP07864 332 aa35.58■■■■□ 3.29
SEMA3B-215ENST00000621029 RGS3P49796 1198 aa35.58■■■■□ 3.29
SEMA3B-215ENST00000621029 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP35.58■■■■□ 3.29
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP35.58■■■■□ 3.29
SEMA3B-215ENST00000621029 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP35.58■■■■□ 3.29
SEMA3B-215ENST00000621029 GPR25O00155 361 aa35.57■■■■□ 3.28
SEMA3B-215ENST00000621029 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP35.57■■■■□ 3.28
SEMA3B-215ENST00000621029 ERC1Q8IUD2 1116 aa35.57■■■■□ 3.28
SEMA3B-215ENST00000621029 PICALMQ13492 652 aa35.56■■■■□ 3.28
SEMA3B-215ENST00000621029 ZFPM1Q8IX07 1006 aa35.56■■■■□ 3.28
SEMA3B-215ENST00000621029 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP35.56■■■■□ 3.28
SEMA3B-215ENST00000621029 OTOFQ9HC10 1997 aa35.55■■■■□ 3.28
SEMA3B-215ENST00000621029 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP35.55■■■■□ 3.28
SEMA3B-215ENST00000621029 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP35.55■■■■□ 3.28
SEMA3B-215ENST00000621029 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP35.55■■■■□ 3.28
SEMA3B-215ENST00000621029 IDI2Q9BXS1 227 aa35.55■■■■□ 3.28
SEMA3B-215ENST00000621029 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa35.55■■■■□ 3.28
SEMA3B-215ENST00000621029 MYH2Q9UKX2 1941 aa35.54■■■■□ 3.28
SEMA3B-215ENST00000621029 ENTPD3O75355 529 aa35.54■■■■□ 3.28
SEMA3B-215ENST00000621029 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa35.54■■■■□ 3.28
SEMA3B-215ENST00000621029 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP35.54■■■■□ 3.28
SEMA3B-215ENST00000621029 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa35.53■■■■□ 3.28
SEMA3B-215ENST00000621029 SPDYE5A6NIY4 337 aa35.53■■■■□ 3.28
SEMA3B-215ENST00000621029 GTF2A2P52657 109 aa35.53■■■■□ 3.28
SEMA3B-215ENST00000621029 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa35.53■■■■□ 3.28
SEMA3B-215ENST00000621029 ERO1BQ86YB8 467 aa35.53■■■■□ 3.28
SEMA3B-215ENST00000621029 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP35.53■■■■□ 3.28
SEMA3B-215ENST00000621029 CFHR5Q9BXR6 569 aa35.53■■■■□ 3.28
SEMA3B-215ENST00000621029 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP35.53■■■■□ 3.28
SEMA3B-215ENST00000621029 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa35.52■■■■□ 3.28
SEMA3B-215ENST00000621029 FKTNO75072 461 aa35.52■■■■□ 3.28
SEMA3B-215ENST00000621029 HMMRO75330 724 aa35.52■■■■□ 3.28
SEMA3B-215ENST00000621029 CCL15Q16663 113 aa35.52■■■■□ 3.28
SEMA3B-215ENST00000621029 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP35.52■■■■□ 3.28
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF384Q8TF68 577 aa35.52■■■■□ 3.28
SEMA3B-215ENST00000621029 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP35.52■■■■□ 3.28
SEMA3B-215ENST00000621029 APBB1O00213 710 aa35.51■■■■□ 3.28
SEMA3B-215ENST00000621029 INPP5BP32019 993 aa35.51■■■■□ 3.28
SEMA3B-215ENST00000621029 BCL11AQ9H165 835 aa35.51■■■■□ 3.28
SEMA3B-215ENST00000621029 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa35.51■■■■□ 3.28
SEMA3B-215ENST00000621029 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP35.5■■■■□ 3.27
SEMA3B-215ENST00000621029 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP35.5■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms