RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621029.4

SEMA3B-215, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-215ENST00000621029 ABHD8Q96I13 439 aa35.71■■■■□ 3.31
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SEMA3B-215ENST00000621029 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa35.7■■■■□ 3.31
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SEMA3B-215ENST00000621029 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP35.64■■■■□ 3.3
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SEMA3B-215ENST00000621029 MIGA2Q7L4E1 593 aa35.63■■■■□ 3.29
SEMA3B-215ENST00000621029 DBNDD2Q9BQY9 259 aa35.63■■■■□ 3.29
SEMA3B-215ENST00000621029 RAI14Q9P0K7 980 aa35.63■■■■□ 3.29
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SEMA3B-215ENST00000621029 DDX19BQ9UMR2 479 aa35.62■■■■□ 3.29
SEMA3B-215ENST00000621029 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP35.62■■■■□ 3.29
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SEMA3B-215ENST00000621029 MCAMP43121 646 aa35.61■■■■□ 3.29
SEMA3B-215ENST00000621029 BTDP43251 543 aa35.61■■■■□ 3.29
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF341Q9BYN7 854 aa35.61■■■■□ 3.29
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SEMA3B-215ENST00000621029 LRP2BPQ9P2M1 347 aa35.61■■■■□ 3.29
SEMA3B-215ENST00000621029 CCDC85CA6NKD9 419 aa35.6■■■■□ 3.29
SEMA3B-215ENST00000621029 GSTO1P78417 241 aa35.6■■■■□ 3.29
SEMA3B-215ENST00000621029 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa35.6■■■■□ 3.29
SEMA3B-215ENST00000621029 OTUD5Q96G74 571 aa35.6■■■■□ 3.29
SEMA3B-215ENST00000621029 FAM198AQ9UFP1 575 aa35.6■■■■□ 3.29
SEMA3B-215ENST00000621029 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa35.59■■■■□ 3.29
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SEMA3B-215ENST00000621029 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP35.59■■■■□ 3.29
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SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP35.58■■■■□ 3.29
SEMA3B-215ENST00000621029 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP35.58■■■■□ 3.29
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SEMA3B-215ENST00000621029 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP35.57■■■■□ 3.28
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SEMA3B-215ENST00000621029 PICALMQ13492 652 aa35.56■■■■□ 3.28
SEMA3B-215ENST00000621029 ZFPM1Q8IX07 1006 aa35.56■■■■□ 3.28
SEMA3B-215ENST00000621029 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP35.56■■■■□ 3.28
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SEMA3B-215ENST00000621029 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP35.55■■■■□ 3.28
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SEMA3B-215ENST00000621029 IDI2Q9BXS1 227 aa35.55■■■■□ 3.28
SEMA3B-215ENST00000621029 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa35.55■■■■□ 3.28
SEMA3B-215ENST00000621029 MYH2Q9UKX2 1941 aa35.54■■■■□ 3.28
SEMA3B-215ENST00000621029 ENTPD3O75355 529 aa35.54■■■■□ 3.28
SEMA3B-215ENST00000621029 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa35.54■■■■□ 3.28
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SEMA3B-215ENST00000621029 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa35.53■■■■□ 3.28
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SEMA3B-215ENST00000621029 GTF2A2P52657 109 aa35.53■■■■□ 3.28
SEMA3B-215ENST00000621029 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa35.53■■■■□ 3.28
SEMA3B-215ENST00000621029 ERO1BQ86YB8 467 aa35.53■■■■□ 3.28
SEMA3B-215ENST00000621029 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP35.53■■■■□ 3.28
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SEMA3B-215ENST00000621029 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP35.53■■■■□ 3.28
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SEMA3B-215ENST00000621029 CCL15Q16663 113 aa35.52■■■■□ 3.28
SEMA3B-215ENST00000621029 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP35.52■■■■□ 3.28
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SEMA3B-215ENST00000621029 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP35.5■■■■□ 3.27
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