RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 VEGFBP49765 207 aa25.83■■□□□ 1.73
SGMS1-210ENST00000619438 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa25.83■■□□□ 1.73
SGMS1-210ENST00000619438 RILPL2Q969X0 211 aa25.83■■□□□ 1.73
SGMS1-210ENST00000619438 MAST3O60307 1309 aa25.83■■□□□ 1.73
SGMS1-210ENST00000619438 ANAPC15P60006 121 aa25.83■■□□□ 1.73
SGMS1-210ENST00000619438 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
SGMS1-210ENST00000619438 GRM1Q13255 1194 aa25.83■■□□□ 1.73
SGMS1-210ENST00000619438 SAPCD2Q86UD0 394 aa25.83■■□□□ 1.73
SGMS1-210ENST00000619438 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
SGMS1-210ENST00000619438 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
SGMS1-210ENST00000619438 LDHBP07195 334 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
SGMS1-210ENST00000619438 MCM4P33991 863 aa25.82■■□□□ 1.72
SGMS1-210ENST00000619438 RASGRF1Q13972 1273 aa25.82■■□□□ 1.72
SGMS1-210ENST00000619438 CCDC158Q5M9N0 1113 aa25.82■■□□□ 1.72
SGMS1-210ENST00000619438 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
SGMS1-210ENST00000619438 ABCF2Q9UG63 623 aa25.82■■□□□ 1.72
SGMS1-210ENST00000619438 AK9Q5TCS8 1911 aa25.81■■□□□ 1.72
SGMS1-210ENST00000619438 ST18O60284 1047 aa25.81■■□□□ 1.72
SGMS1-210ENST00000619438 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
SGMS1-210ENST00000619438 MRIQ9BWK5 157 aa25.81■■□□□ 1.72
SGMS1-210ENST00000619438 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
SGMS1-210ENST00000619438 MCCP23508 829 aa25.8■■□□□ 1.72
SGMS1-210ENST00000619438 NF2P35240 595 aa25.8■■□□□ 1.72
SGMS1-210ENST00000619438 TTC39AQ5SRH9 613 aa25.8■■□□□ 1.72
SGMS1-210ENST00000619438 DEFB129Q9H1M3 183 aa25.8■■□□□ 1.72
SGMS1-210ENST00000619438 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa25.8■■□□□ 1.72
SGMS1-210ENST00000619438 PRDX5P30044 214 aa25.8■■□□□ 1.72
SGMS1-210ENST00000619438 HUNKP57058 714 aa25.8■■□□□ 1.72
SGMS1-210ENST00000619438 DBNDD2Q9BQY9 259 aa25.8■■□□□ 1.72
SGMS1-210ENST00000619438 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
SGMS1-210ENST00000619438 MYH13Q9UKX3 1938 aa25.79■■□□□ 1.72
SGMS1-210ENST00000619438 ARAP2Q8WZ64 1704 aa25.79■■□□□ 1.72
SGMS1-210ENST00000619438 SALL1Q9NSC2 1324 aa25.78■■□□□ 1.72
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SGMS1-210ENST00000619438 ECE1P42892 770 aa25.78■■□□□ 1.72
SGMS1-210ENST00000619438 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
SGMS1-210ENST00000619438 RAB3GAP1Q15042 981 aa25.78■■□□□ 1.72
SGMS1-210ENST00000619438 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
SGMS1-210ENST00000619438 SPATA5Q8NB90 893 aa25.78■■□□□ 1.72
SGMS1-210ENST00000619438 GPATCH3Q96I76 525 aa25.78■■□□□ 1.72
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
SGMS1-210ENST00000619438 ZBTB22O15209 634 aa25.77■■□□□ 1.72
SGMS1-210ENST00000619438 CYP4F22Q6NT55 531 aa25.77■■□□□ 1.72
SGMS1-210ENST00000619438 HHIPL2Q6UWX4 724 aa25.77■■□□□ 1.72
SGMS1-210ENST00000619438 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
SGMS1-210ENST00000619438 ZDHHC15Q96MV8 337 aa25.77■■□□□ 1.72
SGMS1-210ENST00000619438 HMG20BQ9P0W2 317 aa25.77■■□□□ 1.72
SGMS1-210ENST00000619438 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
SGMS1-210ENST00000619438 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
SGMS1-210ENST00000619438 TNFAIP1Q13829 316 aa25.77■■□□□ 1.72
SGMS1-210ENST00000619438 CAPNS2Q96L46 248 aa25.77■■□□□ 1.72
SGMS1-210ENST00000619438 ECHDC1Q9NTX5 307 aa25.77■■□□□ 1.72
SGMS1-210ENST00000619438 ECM29Q5VYK3 1845 aa25.77■■□□□ 1.72
SGMS1-210ENST00000619438 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
SGMS1-210ENST00000619438 SPDYE2Q495Y8 402 aa25.76■■□□□ 1.71
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SGMS1-210ENST00000619438 DIXDC1Q155Q3 683 aa25.75■■□□□ 1.71
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SGMS1-210ENST00000619438 TMOD2Q9NZR1 351 aa25.75■■□□□ 1.71
SGMS1-210ENST00000619438 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa25.75■■□□□ 1.71
SGMS1-210ENST00000619438 TCP10L2B9ZVM9 353 aa25.74■■□□□ 1.71
SGMS1-210ENST00000619438 MCM2P49736 904 aa25.74■■□□□ 1.71
SGMS1-210ENST00000619438 RASA3Q14644 834 aa25.74■■□□□ 1.71
SGMS1-210ENST00000619438 PI16Q6UXB8 463 aa25.74■■□□□ 1.71
SGMS1-210ENST00000619438 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
SGMS1-210ENST00000619438 DDX11L8A8MPP1 907 aa25.74■■□□□ 1.71
SGMS1-210ENST00000619438 SGSM2O43147 1006 aa25.74■■□□□ 1.71
SGMS1-210ENST00000619438 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
SGMS1-210ENST00000619438 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
SGMS1-210ENST00000619438 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
SGMS1-210ENST00000619438 MCAMP43121 646 aa25.74■■□□□ 1.71
SGMS1-210ENST00000619438 TNNI2P48788 182 aa25.74■■□□□ 1.71
SGMS1-210ENST00000619438 FKBP1BP68106 108 aa25.74■■□□□ 1.71
SGMS1-210ENST00000619438 PRKG1Q13976 671 aa25.74■■□□□ 1.71
SGMS1-210ENST00000619438 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
SGMS1-210ENST00000619438 SLF2Q8IX21 1173 aa25.74■■□□□ 1.71
SGMS1-210ENST00000619438 ANO2Q9NQ90 1003 aa25.74■■□□□ 1.71
SGMS1-210ENST00000619438 SNRKQ9NRH2 765 aa25.74■■□□□ 1.71
SGMS1-210ENST00000619438 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa25.73■■□□□ 1.71
SGMS1-210ENST00000619438 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
SGMS1-210ENST00000619438 RGMBQ6NW40 437 aa25.72■■□□□ 1.71
SGMS1-210ENST00000619438 CLEC17AQ6ZS10 378 aa25.72■■□□□ 1.71
SGMS1-210ENST00000619438 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
SGMS1-210ENST00000619438 LRP2BPQ9P2M1 347 aa25.72■■□□□ 1.71
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
SGMS1-210ENST00000619438 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
SGMS1-210ENST00000619438 RAI14Q9P0K7 980 aa25.71■■□□□ 1.71
SGMS1-210ENST00000619438 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa25.71■■□□□ 1.71
SGMS1-210ENST00000619438 CACNB3P54284 484 aa25.71■■□□□ 1.71
SGMS1-210ENST00000619438 MOB2Q70IA6 237 aa25.71■■□□□ 1.71
SGMS1-210ENST00000619438 ARMC9Q7Z3E5 817 aa25.71■■□□□ 1.71
SGMS1-210ENST00000619438 GBP4Q96PP9 640 aa25.71■■□□□ 1.71
SGMS1-210ENST00000619438 UBE2Q2LH0YL09 131 aa25.7■■□□□ 1.7
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
SGMS1-210ENST00000619438 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
SGMS1-210ENST00000619438 PTMSP20962 102 aa25.69■■□□□ 1.7
SGMS1-210ENST00000619438 HSPA4P34932 840 aa25.69■■□□□ 1.7
SGMS1-210ENST00000619438 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
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