RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615579.1

TTC28-AS1_3.1-201, humanhuman

BASIC

Gene TTC28-AS1_3, Length 181 nt, Biotype misc RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SPDYE2BA6NHP3 402 aa17.52■□□□□ 0.4
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CDC45O75419 566 aa17.52■□□□□ 0.4
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SPDYE6P0CI01 402 aa17.52■□□□□ 0.4
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LCORLQ8N3X6 602 aa17.52■□□□□ 0.4
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 AIDAQ96BJ3 306 aa17.52■□□□□ 0.4
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZDHHC15Q96MV8 337 aa17.52■□□□□ 0.4
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.4
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 POTECB2RU33 542 aa17.51■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HIP1O00291 1037 aa17.51■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 WNT10BO00744 389 aa17.51■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 UBE3CQ15386 1083 aa17.51■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HHIPL2Q6UWX4 724 aa17.51■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OSBP2Q969R2 916 aa17.51■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 USP40Q9NVE5 1235 aa17.51■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GGA3Q9NZ52 723 aa17.51■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CLEC11AQ9Y240 323 aa17.51■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FOCADQ5VW36 1801 aa17.51■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MYO1BO43795 1136 aa17.5■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 BAG3O95817 575 aa17.5■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CHMLP26374 656 aa17.5■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PICALMQ13492 652 aa17.5■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa17.5■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TEX11Q8IYF3 940 aa17.5■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TCP10L2B9ZVM9 353 aa17.49■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GPAA1O43292 621 aa17.49■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 POTEIP0CG38 1075 aa17.49■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 POTEJP0CG39 1038 aa17.49■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP17.49■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa17.49■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CASC1Q6TDU7 716 aa17.49■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TMOD2Q9NZR1 351 aa17.49■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa17.48■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 USP5P45974 858 aa17.48■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa17.48■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP17.48■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP17.48■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 IL25Q9H293 177 aa17.48■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP17.48■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MYH1P12882 1939 aa17.47■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PRKAB2O43741 272 aa17.47■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TCP10Q12799 353 aa17.47■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa17.47■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa17.47■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MTMR14Q8NCE2 650 aa17.47■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa17.47■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SDR42E1Q8WUS8 393 aa17.47■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP17.47■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HELLSQ9NRZ9 838 aa17.47■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa17.47■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CCDC171Q6TFL3 1326 aa17.47■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LAMB1P07942 1786 aa17.46■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RHBDL3P58872 404 aa17.46■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NFIAQ12857 509 aa17.46■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SPDYE2Q495Y8 402 aa17.46■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RUFY2Q8WXA3 655 aa17.46■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 IGSF3O75054 1194 aa17.45■□□□□ 0.38
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 APPP05067 770 aa17.45■□□□□ 0.38
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PLCG2P16885 1265 aa17.45■□□□□ 0.38
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MMP14P50281 582 aa17.45■□□□□ 0.38
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MRIQ9BWK5 157 aa17.45■□□□□ 0.38
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ADM5C9JUS6 153 aa17.44■□□□□ 0.38
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PPP4CP60510 307 aa17.44■□□□□ 0.38
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 VPS53Q5VIR6 699 aa17.44■□□□□ 0.38
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa17.44■□□□□ 0.38
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FLT1P17948 1338 aa17.44■□□□□ 0.38
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RAD50Q92878 1312 aa17.44■□□□□ 0.38
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TDO2P48775 406 aa17.43■□□□□ 0.38
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ANO2Q9NQ90 1003 aa17.43■□□□□ 0.38
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SGSM2O43147 1006 aa17.42■□□□□ 0.38
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa17.42■□□□□ 0.38
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DLK2Q6UY11 383 aa17.42■□□□□ 0.38
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CERS3Q8IU89 383 aa17.42■□□□□ 0.38
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FAM198AQ9UFP1 575 aa17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.6 ms