RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612516.4

CCL23-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 23, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL23, Length 569 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23-201ENST00000612516 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa7.47□□□□□ -1.21
CCL23-201ENST00000612516 ECM29Q5VYK3 1845 aa7.47□□□□□ -1.21
CCL23-201ENST00000612516 SALL1Q9NSC2 1324 aa7.47□□□□□ -1.21
CCL23-201ENST00000612516 MYH13Q9UKX3 1938 aa7.46□□□□□ -1.21
CCL23-201ENST00000612516 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 ALDH1A1P00352 501 aa7.46□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 TM4SF4P48230 202 aa7.46□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 MAP3K9P80192 1104 aa7.46□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 TCP10Q12799 353 aa7.46□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 RASGRF1Q13972 1273 aa7.46□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 MAP3K11Q16584 847 aa7.46□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 TNNI3KQ59H18 835 aa7.46□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 SPRYD7Q5W111 196 aa7.46□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 SPATA5Q8NB90 893 aa7.46□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 FAM151AQ8WW52 585 aa7.46□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 CLMNQ96JQ2 1002 aa7.46□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa7.46□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 PCNTO95613 3336 aa7.46□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 AOX1Q06278 1338 aa7.46□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 THSD7BQ9C0I4 1608 aa7.45□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 AKAP11Q9UKA4 1901 aa7.45□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 ARAP2Q8WZ64 1704 aa7.45□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 APBB1O00213 710 aa7.45□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 TBC1D8O95759 1140 aa7.45□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 MECOMQ03112 1051 aa7.45□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 DGKZQ13574 1117 aa7.45□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa7.45□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 CEP85Q6P2H3 762 aa7.45□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 MIGA2Q7L4E1 593 aa7.45□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 OPTNQ96CV9 577 aa7.45□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 WNK4Q96J92 1243 aa7.45□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 WRNIP1Q96S55 665 aa7.45□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 ZNF341Q9BYN7 854 aa7.45□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 ELP3Q9H9T3 547 aa7.45□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 SNRKQ9NRH2 765 aa7.45□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 HMG20BQ9P0W2 317 aa7.45□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 ZBTB22O15209 634 aa7.44□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 BAG3O95817 575 aa7.44□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 BTDP43251 543 aa7.44□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 PICALMQ13492 652 aa7.44□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 PDE3AQ14432 1141 aa7.44□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa7.44□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 AACSQ86V21 672 aa7.44□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 TEPSINQ96N21 525 aa7.44□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 DBNDD2Q9BQY9 259 aa7.44□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa7.44□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 AK9Q5TCS8 1911 aa7.44□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 CCDC85CA6NKD9 419 aa7.43□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 ENTPD3O75355 529 aa7.43□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 PLCG2P16885 1265 aa7.43□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 MCAMP43121 646 aa7.43□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 RGS3P49796 1198 aa7.43□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 GTF2A2P52657 109 aa7.43□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 VGLL4Q14135 290 aa7.43□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 PI16Q6UXB8 463 aa7.43□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 ERO1BQ86YB8 467 aa7.43□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 IFNL1Q8IU54 200 aa7.43□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 CDAN1Q8IWY9 1227 aa7.43□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP7.43□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 KIF1BPQ96EK5 621 aa7.43□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 OTUD5Q96G74 571 aa7.43□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 ABHD8Q96I13 439 aa7.43□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa7.43□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa7.43□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa7.42□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 SSC5DA1L4H1 1573 aa7.42□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa7.42□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa7.42□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 GPR25O00155 361 aa7.42□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 FKTNO75072 461 aa7.42□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 RAB11FIP3O75154 756 aa7.42□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 IDH1O75874 414 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 CETPP11597 493 aa7.42□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 NFIAQ12857 509 aa7.42□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 SNAPC2Q13487 334 aa7.42□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 CCL15Q16663 113 aa7.42□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 TEX11Q8IYF3 940 aa7.42□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 RHPN1Q8TCX5 695 aa7.42□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 IDI2Q9BXS1 227 aa7.42□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 TRIM34Q9BYJ4 488 aa7.42□□□□□ -1.22
CCL23-201ENST00000612516 MCOLN1Q9GZU1 580 aa7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.2 ms