RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606714.5

TRAM2-AS1-204, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 2,453 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PTF1AQ7RTS3 328 aa25.36■■□□□ 1.65
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TOMM22Q9NS69 142 aa25.35■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PRDM4Q9UKN5 801 aa25.35■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa25.35■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GYG1P46976 350 aa25.35■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZNF165P49910 485 aa25.35■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa25.35■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RTEL1Q9NZ71 1219 aa25.35■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZSWIM5Q9P217 1185 aa25.35■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 COL4A1P02462 1669 aa25.34■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TDO2P48775 406 aa25.34■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 STK38Q15208 465 aa25.34■■□□□ 1.65
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ABCF2Q9UG63 623 aa25.34■■□□□ 1.65
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa25.33■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ALG1Q9BT22 464 aa25.33■■□□□ 1.65
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 A0A1B0GVL5 298 aa25.32■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZBTB43O43298 467 aa25.32■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FAM160A1Q05DH4 1040 aa25.32■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LINC00301Q8NCQ3 95 aa25.32■■□□□ 1.64
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TMEM87BQ96K49 555 aa25.32■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 C8orf37Q96NL8 207 aa25.32■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 UBE2Q2LH0YL09 131 aa25.31■■□□□ 1.64
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FBXW7Q969H0 707 aa25.31■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RTL9Q8NET4 1388 aa25.31■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GOLGA8AA7E2F4 631 aa25.31■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ADGRA1Q86SQ6 560 aa25.31■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CYP7A1P22680 504 aa25.3■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 AKNAD1Q5T1N1 836 aa25.3■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MFSD6Q6ZSS7 791 aa25.3■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LTBP4Q8N2S1 1624 aa25.29■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CCDC24Q8N4L8 307 aa25.29■■□□□ 1.64
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TBC1D9BQ66K14 1250 aa25.29■■□□□ 1.64
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SDR42E1Q8WUS8 393 aa25.29■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SLC12A7Q9Y666 1083 aa25.29■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ARAP2Q8WZ64 1704 aa25.29■■□□□ 1.64
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CDKL5O76039 1030 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ADALQ6DHV7 355 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CLEC4GQ6UXB4 293 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CCDC69A6NI79 296 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SPTLC2O15270 562 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KRT40Q6A162 431 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NGLY1Q96IV0 654 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TRIM5Q9C035 493 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CTAGE5O15320 804 aa25.27■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KCNF1Q9H3M0 494 aa25.27■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 POLR3EQ9NVU0 708 aa25.27■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SMIM22K7EJ46 135 aa25.27■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IARSP41252 1262 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FAM182BQ5T319 152 aa25.27■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KCNG4Q8TDN1 519 aa25.27■■□□□ 1.64
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NTRK3Q16288 839 aa25.26■■□□□ 1.63
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ANO1Q5XXA6 986 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SGMS1Q86VZ5 419 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 VPS37DQ86XT2 251 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DRC7Q8IY82 874 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SDF4Q9BRK5 362 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SLC26A6Q9BXS9 759 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CNNM2Q9H8M5 875 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MYH15Q9Y2K3 1946 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MINDY4BA8MYZ0 360 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GNAT2P19087 354 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 STX1AQ16623 288 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PIBF1Q8WXW3 757 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KRT23Q9C075 422 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RREB1Q92766 1687 aa25.26■■□□□ 1.63
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