RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591307.5

BECN1-218, Transcript of beclin 1, humanhuman

TSL 2

Gene BECN1, Length 744 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1-218ENST00000591307 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
BECN1-218ENST00000591307 MS4A1P11836 297 aa21.83■■□□□ 1.09
BECN1-218ENST00000591307 TNNI2P48788 182 aa21.83■■□□□ 1.09
BECN1-218ENST00000591307 FKBP1CQ5VVH2 108 aa21.83■■□□□ 1.09
BECN1-218ENST00000591307 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
BECN1-218ENST00000591307 SPATA5Q8NB90 893 aa21.83■■□□□ 1.09
BECN1-218ENST00000591307 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
BECN1-218ENST00000591307 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
BECN1-218ENST00000591307 SNRKQ9NRH2 765 aa21.83■■□□□ 1.09
BECN1-218ENST00000591307 USP40Q9NVE5 1235 aa21.83■■□□□ 1.09
BECN1-218ENST00000591307 FAM198AQ9UFP1 575 aa21.83■■□□□ 1.09
BECN1-218ENST00000591307 CAPN15O75808 1086 aa21.82■■□□□ 1.08
BECN1-218ENST00000591307 TM4SF4P48230 202 aa21.82■■□□□ 1.08
BECN1-218ENST00000591307 TCP10Q12799 353 aa21.82■■□□□ 1.08
BECN1-218ENST00000591307 FAM83AQ86UY5 434 aa21.82■■□□□ 1.08
BECN1-218ENST00000591307 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa21.82■■□□□ 1.08
BECN1-218ENST00000591307 WNK4Q96J92 1243 aa21.82■■□□□ 1.08
BECN1-218ENST00000591307 GAKO14976 1311 aa21.81■■□□□ 1.08
BECN1-218ENST00000591307 OTOFQ9HC10 1997 aa21.81■■□□□ 1.08
BECN1-218ENST00000591307 IREB2P48200 963 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
BECN1-218ENST00000591307 MECOMQ03112 1051 aa21.81■■□□□ 1.08
BECN1-218ENST00000591307 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
BECN1-218ENST00000591307 TMOD2Q9NZR1 351 aa21.81■■□□□ 1.08
BECN1-218ENST00000591307 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
BECN1-218ENST00000591307 ERICH6Q7L0X2 663 aa21.8■■□□□ 1.08
BECN1-218ENST00000591307 MIGA2Q7L4E1 593 aa21.8■■□□□ 1.08
BECN1-218ENST00000591307 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
BECN1-218ENST00000591307 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa21.8■■□□□ 1.08
BECN1-218ENST00000591307 ELP3Q9H9T3 547 aa21.8■■□□□ 1.08
BECN1-218ENST00000591307 DDX19BQ9UMR2 479 aa21.8■■□□□ 1.08
BECN1-218ENST00000591307 TBC1D8O95759 1140 aa21.79■■□□□ 1.08
BECN1-218ENST00000591307 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa21.79■■□□□ 1.08
BECN1-218ENST00000591307 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa21.79■■□□□ 1.08
BECN1-218ENST00000591307 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP21.79■■□□□ 1.08
BECN1-218ENST00000591307 FAM151AQ8WW52 585 aa21.79■■□□□ 1.08
BECN1-218ENST00000591307 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
BECN1-218ENST00000591307 SAGE1Q9NXZ1 904 aa21.79■■□□□ 1.08
BECN1-218ENST00000591307 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
BECN1-218ENST00000591307 SLURP2P0DP57 97 aa21.78■■□□□ 1.08
BECN1-218ENST00000591307 MAP3K9P80192 1104 aa21.78■■□□□ 1.08
BECN1-218ENST00000591307 TTC39AQ5SRH9 613 aa21.78■■□□□ 1.08
BECN1-218ENST00000591307 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
BECN1-218ENST00000591307 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
BECN1-218ENST00000591307 VGLL4Q14135 290 aa21.77■■□□□ 1.08
BECN1-218ENST00000591307 PDE3AQ14432 1141 aa21.77■■□□□ 1.08
BECN1-218ENST00000591307 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa21.77■■□□□ 1.08
BECN1-218ENST00000591307 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
BECN1-218ENST00000591307 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
BECN1-218ENST00000591307 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa21.77■■□□□ 1.08
BECN1-218ENST00000591307 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
BECN1-218ENST00000591307 AK9Q5TCS8 1911 aa21.76■■□□□ 1.07
BECN1-218ENST00000591307 UNCXA6NJT0 531 aa21.76■■□□□ 1.07
BECN1-218ENST00000591307 APBB1O00213 710 aa21.76■■□□□ 1.07
BECN1-218ENST00000591307 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
BECN1-218ENST00000591307 BTDP43251 543 aa21.76■■□□□ 1.07
BECN1-218ENST00000591307 ZAP70P43403 619 aa21.76■■□□□ 1.07
BECN1-218ENST00000591307 RGS3P49796 1198 aa21.76■■□□□ 1.07
BECN1-218ENST00000591307 RHBDL3P58872 404 aa21.76■■□□□ 1.07
BECN1-218ENST00000591307 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
BECN1-218ENST00000591307 RAI14Q9P0K7 980 aa21.76■■□□□ 1.07
BECN1-218ENST00000591307 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa21.76■■□□□ 1.07
BECN1-218ENST00000591307 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa21.76■■□□□ 1.07
BECN1-218ENST00000591307 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa21.75■■□□□ 1.07
BECN1-218ENST00000591307 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
BECN1-218ENST00000591307 CCDC158Q5M9N0 1113 aa21.75■■□□□ 1.07
BECN1-218ENST00000591307 RHPN1Q8TCX5 695 aa21.75■■□□□ 1.07
BECN1-218ENST00000591307 OPTNQ96CV9 577 aa21.75■■□□□ 1.07
BECN1-218ENST00000591307 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
BECN1-218ENST00000591307 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
BECN1-218ENST00000591307 LAMB1P07942 1786 aa21.74■■□□□ 1.07
BECN1-218ENST00000591307 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP21.74■■□□□ 1.07
BECN1-218ENST00000591307 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
BECN1-218ENST00000591307 INPP5BP32019 993 aa21.74■■□□□ 1.07
BECN1-218ENST00000591307 PTPN18Q99952 460 aa21.74■■□□□ 1.07
BECN1-218ENST00000591307 IDI2Q9BXS1 227 aa21.74■■□□□ 1.07
BECN1-218ENST00000591307 LRP2BPQ9P2M1 347 aa21.74■■□□□ 1.07
BECN1-218ENST00000591307 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa21.74■■□□□ 1.07
BECN1-218ENST00000591307 RFX7Q2KHR2 1363 aa21.74■■□□□ 1.07
BECN1-218ENST00000591307 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
BECN1-218ENST00000591307 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
BECN1-218ENST00000591307 AACSQ86V21 672 aa21.73■■□□□ 1.07
BECN1-218ENST00000591307 IFNL1Q8IU54 200 aa21.73■■□□□ 1.07
BECN1-218ENST00000591307 MS4A4AQ96JQ5 239 aa21.73■■□□□ 1.07
BECN1-218ENST00000591307 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
BECN1-218ENST00000591307 WRNIP1Q96S55 665 aa21.73■■□□□ 1.07
BECN1-218ENST00000591307 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
BECN1-218ENST00000591307 SREBF2Q12772 1141 aa21.72■■□□□ 1.07
BECN1-218ENST00000591307 SLF2Q8IX21 1173 aa21.72■■□□□ 1.07
BECN1-218ENST00000591307 MCOLN1Q9GZU1 580 aa21.72■■□□□ 1.07
BECN1-218ENST00000591307 BCL11AQ9H165 835 aa21.72■■□□□ 1.07
BECN1-218ENST00000591307 ENTPD3O75355 529 aa21.71■■□□□ 1.07
BECN1-218ENST00000591307 PICALMQ13492 652 aa21.71■■□□□ 1.07
BECN1-218ENST00000591307 ADGRA1Q86SQ6 560 aa21.71■■□□□ 1.07
BECN1-218ENST00000591307 ERC1Q8IUD2 1116 aa21.71■■□□□ 1.07
BECN1-218ENST00000591307 OTUD5Q96G74 571 aa21.71■■□□□ 1.07
BECN1-218ENST00000591307 ABHD8Q96I13 439 aa21.71■■□□□ 1.07
BECN1-218ENST00000591307 ZNF341Q9BYN7 854 aa21.71■■□□□ 1.07
BECN1-218ENST00000591307 ANTXR1Q9H6X2 564 aa21.71■■□□□ 1.07
BECN1-218ENST00000591307 ZNF112Q9UJU3 913 aa21.71■■□□□ 1.07
BECN1-218ENST00000591307 ATRNL1Q5VV63 1379 aa21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms