RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588494.5

NEDD4L-222, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 4

Gene NEDD4L, Length 505 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-222	ENST00000588494	RASIP1	Q5U651	963 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	ACAD11	Q709F0	780 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	RAD18	Q9NS91	495 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NEDD4L-222	ENST00000588494	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	WISP1	O95388	367 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	PF4	P02776	101 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	ELN	P15502	786 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	SEPT6	Q14141	434 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	TMEM74	Q96NL1	305 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	DLL1	O00548	723 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	APBA3	O96018	575 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	CTSB	P07858	339 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	LIG1	P18858	919 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	BMP6	P22004	513 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	RACK1	P63244	317 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	GOLM1	Q8NBJ4	401 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	PHC3	Q8NDX5	983 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	CCDC86	Q9H6F5	360 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	CAPN10	Q9HC96	672 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	ALX3	O95076	343 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	COL8A1	P27658	744 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	ILDR2	Q71H61	639 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	PDZD3	Q86UT5	571 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	SPON2	Q9BUD6	331 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	TGIF2	Q9GZN2	237 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	BPNT1	O95861	308 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	DLGAP3	O95886	979 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	GLB1	P16278	677 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	TNNI2	P48788	182 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	LMNB2	Q03252	620 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	FDX2	Q6P4F2	183 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	RHOV	Q96L33	236 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	NACC1	Q96RE7	527 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	PICK1	Q9NRD5	415 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	CSAD	Q9Y600	493 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	C9orf172	C9J069	976 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	TM4SF5	O14894	197 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZNF862	O60290	1169 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	TRIM37	O94972	964 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	F13A1	P00488	732 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	SLFN14	P0C7P3	912 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	SELP	P16109	830 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	PAK2	Q13177	524 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NEDD4L-222	ENST00000588494	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63

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