RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587752.5

CTIF-203, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 5

Gene CTIF, Length 683 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-203ENST00000587752 USP40Q9NVE5 1235 aa18.57■□□□□ 0.56
CTIF-203ENST00000587752 AK9Q5TCS8 1911 aa18.57■□□□□ 0.56
CTIF-203ENST00000587752 UNCXA6NJT0 531 aa18.56■□□□□ 0.56
CTIF-203ENST00000587752 SURF6O75683 361 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
CTIF-203ENST00000587752 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
CTIF-203ENST00000587752 MAP3K9P80192 1104 aa18.56■□□□□ 0.56
CTIF-203ENST00000587752 NFIAQ12857 509 aa18.56■□□□□ 0.56
CTIF-203ENST00000587752 FKBP1CQ5VVH2 108 aa18.56■□□□□ 0.56
CTIF-203ENST00000587752 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
CTIF-203ENST00000587752 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
CTIF-203ENST00000587752 SSH3Q8TE77 659 aa18.56■□□□□ 0.56
CTIF-203ENST00000587752 OPTNQ96CV9 577 aa18.56■□□□□ 0.56
CTIF-203ENST00000587752 VGLL4Q14135 290 aa18.55■□□□□ 0.56
CTIF-203ENST00000587752 MIGA2Q7L4E1 593 aa18.55■□□□□ 0.56
CTIF-203ENST00000587752 IFNL1Q8IU54 200 aa18.55■□□□□ 0.56
CTIF-203ENST00000587752 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP18.55■□□□□ 0.56
CTIF-203ENST00000587752 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
CTIF-203ENST00000587752 HMG20BQ9P0W2 317 aa18.55■□□□□ 0.56
CTIF-203ENST00000587752 GPR25O00155 361 aa18.54■□□□□ 0.56
CTIF-203ENST00000587752 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP18.54■□□□□ 0.56
CTIF-203ENST00000587752 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa18.54■□□□□ 0.56
CTIF-203ENST00000587752 FAM151AQ8WW52 585 aa18.54■□□□□ 0.56
CTIF-203ENST00000587752 WRNIP1Q96S55 665 aa18.54■□□□□ 0.56
CTIF-203ENST00000587752 CSADQ9Y600 493 aa18.54■□□□□ 0.56
CTIF-203ENST00000587752 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
CTIF-203ENST00000587752 ZBTB22O15209 634 aa18.53■□□□□ 0.56
CTIF-203ENST00000587752 INHBEP58166 350 aa18.53■□□□□ 0.56
CTIF-203ENST00000587752 TNNI3KQ59H18 835 aa18.53■□□□□ 0.56
CTIF-203ENST00000587752 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
CTIF-203ENST00000587752 ERICH6Q7L0X2 663 aa18.53■□□□□ 0.56
CTIF-203ENST00000587752 ZFPM1Q8IX07 1006 aa18.53■□□□□ 0.56
CTIF-203ENST00000587752 SPATA5Q8NB90 893 aa18.53■□□□□ 0.56
CTIF-203ENST00000587752 OTUD5Q96G74 571 aa18.53■□□□□ 0.56
CTIF-203ENST00000587752 FAM198AQ9UFP1 575 aa18.53■□□□□ 0.56
CTIF-203ENST00000587752 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa18.53■□□□□ 0.56
CTIF-203ENST00000587752 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
CTIF-203ENST00000587752 MCAMP43121 646 aa18.52■□□□□ 0.56
CTIF-203ENST00000587752 MECOMQ03112 1051 aa18.52■□□□□ 0.56
CTIF-203ENST00000587752 DCAF15Q66K64 600 aa18.52■□□□□ 0.56
CTIF-203ENST00000587752 CEP85Q6P2H3 762 aa18.52■□□□□ 0.56
CTIF-203ENST00000587752 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
CTIF-203ENST00000587752 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
CTIF-203ENST00000587752 HOOK2Q96ED9 719 aa18.52■□□□□ 0.56
CTIF-203ENST00000587752 DBNDD2Q9BQY9 259 aa18.52■□□□□ 0.56
CTIF-203ENST00000587752 SNRKQ9NRH2 765 aa18.52■□□□□ 0.56
CTIF-203ENST00000587752 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.55
CTIF-203ENST00000587752 GAKO14976 1311 aa18.51■□□□□ 0.55
CTIF-203ENST00000587752 ALDH1A1P00352 501 aa18.51■□□□□ 0.55
CTIF-203ENST00000587752 RGS3P49796 1198 aa18.51■□□□□ 0.55
CTIF-203ENST00000587752 SLF2Q8IX21 1173 aa18.51■□□□□ 0.55
CTIF-203ENST00000587752 PTPN18Q99952 460 aa18.51■□□□□ 0.55
CTIF-203ENST00000587752 ZNF341Q9BYN7 854 aa18.51■□□□□ 0.55
CTIF-203ENST00000587752 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa18.51■□□□□ 0.55
CTIF-203ENST00000587752 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa18.5■□□□□ 0.55
CTIF-203ENST00000587752 INPP5BP32019 993 aa18.5■□□□□ 0.55
CTIF-203ENST00000587752 BTDP43251 543 aa18.5■□□□□ 0.55
CTIF-203ENST00000587752 TTC39AQ5SRH9 613 aa18.5■□□□□ 0.55
CTIF-203ENST00000587752 ZNF384Q8TF68 577 aa18.5■□□□□ 0.55
CTIF-203ENST00000587752 MS4A4AQ96JQ5 239 aa18.5■□□□□ 0.55
CTIF-203ENST00000587752 GPR108Q9NPR9 543 aa18.5■□□□□ 0.55
CTIF-203ENST00000587752 RAI14Q9P0K7 980 aa18.5■□□□□ 0.55
CTIF-203ENST00000587752 RCAN3Q9UKA8 241 aa18.5■□□□□ 0.55
CTIF-203ENST00000587752 COG6Q9Y2V7 657 aa18.5■□□□□ 0.55
CTIF-203ENST00000587752 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
CTIF-203ENST00000587752 LAMB1P07942 1786 aa18.5■□□□□ 0.55
CTIF-203ENST00000587752 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa18.49■□□□□ 0.55
CTIF-203ENST00000587752 FKTNO75072 461 aa18.49■□□□□ 0.55
CTIF-203ENST00000587752 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa18.49■□□□□ 0.55
CTIF-203ENST00000587752 BRI3BPQ8WY22 251 aa18.49■□□□□ 0.55
CTIF-203ENST00000587752 CFHR5Q9BXR6 569 aa18.49■□□□□ 0.55
CTIF-203ENST00000587752 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
CTIF-203ENST00000587752 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
CTIF-203ENST00000587752 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa18.49■□□□□ 0.55
CTIF-203ENST00000587752 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa18.48■□□□□ 0.55
CTIF-203ENST00000587752 SPDYE5A6NIY4 337 aa18.48■□□□□ 0.55
CTIF-203ENST00000587752 MS4A1P11836 297 aa18.48■□□□□ 0.55
CTIF-203ENST00000587752 CRHR2Q13324 411 aa18.48■□□□□ 0.55
CTIF-203ENST00000587752 PICALMQ13492 652 aa18.48■□□□□ 0.55
CTIF-203ENST00000587752 CCL15Q16663 113 aa18.48■□□□□ 0.55
CTIF-203ENST00000587752 CCDC158Q5M9N0 1113 aa18.48■□□□□ 0.55
CTIF-203ENST00000587752 ERO1BQ86YB8 467 aa18.48■□□□□ 0.55
CTIF-203ENST00000587752 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
CTIF-203ENST00000587752 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
CTIF-203ENST00000587752 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
CTIF-203ENST00000587752 LRP2BPQ9P2M1 347 aa18.48■□□□□ 0.55
CTIF-203ENST00000587752 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
CTIF-203ENST00000587752 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
CTIF-203ENST00000587752 SLURP2P0DP57 97 aa18.47■□□□□ 0.55
CTIF-203ENST00000587752 GTF2A2P52657 109 aa18.47■□□□□ 0.55
CTIF-203ENST00000587752 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
CTIF-203ENST00000587752 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
CTIF-203ENST00000587752 IDI2Q9BXS1 227 aa18.47■□□□□ 0.55
CTIF-203ENST00000587752 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
CTIF-203ENST00000587752 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa18.46■□□□□ 0.55
CTIF-203ENST00000587752 ENTPD3O75355 529 aa18.46■□□□□ 0.55
CTIF-203ENST00000587752 LDHCP07864 332 aa18.46■□□□□ 0.55
CTIF-203ENST00000587752 RHBDL3P58872 404 aa18.46■□□□□ 0.55
CTIF-203ENST00000587752 GSTO1P78417 241 aa18.46■□□□□ 0.55
CTIF-203ENST00000587752 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa18.46■□□□□ 0.55
CTIF-203ENST00000587752 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms