RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576589.1

NOMO3-217, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

TSL 5

Gene NOMO3, Length 683 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-217ENST00000576589 PRKG1Q13976 671 aa34.52■■■■□ 3.12
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NOMO3-217ENST00000576589 MECOMQ03112 1051 aa34.51■■■■□ 3.12
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NOMO3-217ENST00000576589 ARMC9Q7Z3E5 817 aa34.5■■■■□ 3.11
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NOMO3-217ENST00000576589 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP34.3■■■■□ 3.08
NOMO3-217ENST00000576589 RFX7Q2KHR2 1363 aa34.3■■■■□ 3.08
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