RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575185.1

SPNS3-203, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS3, Length 496 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-203ENST00000575185 MTFR1Q15390 333 aa26.11■■□□□ 1.77
SPNS3-203ENST00000575185 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
SPNS3-203ENST00000575185 MIGA2Q7L4E1 593 aa26.11■■□□□ 1.77
SPNS3-203ENST00000575185 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
SPNS3-203ENST00000575185 CPA4Q9UI42 421 aa26.11■■□□□ 1.77
SPNS3-203ENST00000575185 UTYO14607 1347 aa26.11■■□□□ 1.77
SPNS3-203ENST00000575185 C17orf99Q6UX52 265 aa26.1■■□□□ 1.77
SPNS3-203ENST00000575185 MGAMO43451 1857 aa26.1■■□□□ 1.77
SPNS3-203ENST00000575185 PDE8BO95263 885 aa26.09■■□□□ 1.77
SPNS3-203ENST00000575185 TRIM47Q96LD4 638 aa26.09■■□□□ 1.77
SPNS3-203ENST00000575185 FKBP1CQ5VVH2 108 aa26.08■■□□□ 1.77
SPNS3-203ENST00000575185 ZNF341Q9BYN7 854 aa26.08■■□□□ 1.77
SPNS3-203ENST00000575185 ADGRA2Q96PE1 1338 aa26.08■■□□□ 1.77
SPNS3-203ENST00000575185 GNRH1P01148 92 aa26.07■■□□□ 1.76
SPNS3-203ENST00000575185 PPATQ06203 517 aa26.07■■□□□ 1.76
SPNS3-203ENST00000575185 DCAF15Q66K64 600 aa26.07■■□□□ 1.76
SPNS3-203ENST00000575185 CHRDL2Q6WN34 429 aa26.07■■□□□ 1.76
SPNS3-203ENST00000575185 MAST3O60307 1309 aa26.07■■□□□ 1.76
SPNS3-203ENST00000575185 OSBPP22059 807 aa26.06■■□□□ 1.76
SPNS3-203ENST00000575185 PSMC4P43686 418 aa26.06■■□□□ 1.76
SPNS3-203ENST00000575185 HOOK2Q96ED9 719 aa26.06■■□□□ 1.76
SPNS3-203ENST00000575185 MRIQ9BWK5 157 aa26.06■■□□□ 1.76
SPNS3-203ENST00000575185 SRRDQ9UH36 339 aa26.06■■□□□ 1.76
SPNS3-203ENST00000575185 DOCK2Q92608 1830 aa26.06■■□□□ 1.76
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SPNS3-203ENST00000575185 PRMT2P55345 433 aa26.05■■□□□ 1.76
SPNS3-203ENST00000575185 FGFR2P21802 821 aa26.04■■□□□ 1.76
SPNS3-203ENST00000575185 TCP10Q12799 353 aa26.04■■□□□ 1.76
SPNS3-203ENST00000575185 MOGSQ13724 837 aa26.04■■□□□ 1.76
SPNS3-203ENST00000575185 HHIPL2Q6UWX4 724 aa26.04■■□□□ 1.76
SPNS3-203ENST00000575185 ANKRD23Q86SG2 305 aa26.04■■□□□ 1.76
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SPNS3-203ENST00000575185 KCNH4Q9UQ05 1017 aa26.03■■□□□ 1.76
SPNS3-203ENST00000575185 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa26.03■■□□□ 1.76
SPNS3-203ENST00000575185 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
SPNS3-203ENST00000575185 NFIAQ12857 509 aa26.02■■□□□ 1.76
SPNS3-203ENST00000575185 DIXDC1Q155Q3 683 aa26.02■■□□□ 1.76
SPNS3-203ENST00000575185 RAET1EQ8TD07 263 aa26.02■■□□□ 1.76
SPNS3-203ENST00000575185 DPF3Q92784 378 aa26.02■■□□□ 1.76
SPNS3-203ENST00000575185 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa26.02■■□□□ 1.76
SPNS3-203ENST00000575185 MYPNQ86TC9 1320 aa26.02■■□□□ 1.76
SPNS3-203ENST00000575185 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
SPNS3-203ENST00000575185 GRK4P32298 578 aa26.01■■□□□ 1.75
SPNS3-203ENST00000575185 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa26.01■■□□□ 1.75
SPNS3-203ENST00000575185 KIF16BQ96L93 1317 aa26.01■■□□□ 1.75
SPNS3-203ENST00000575185 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
SPNS3-203ENST00000575185 ZNF112Q9UJU3 913 aa26.01■■□□□ 1.75
SPNS3-203ENST00000575185 PTPRFP10586 1907 aa26■■□□□ 1.75
SPNS3-203ENST00000575185 CCL5P13501 91 aa26■■□□□ 1.75
SPNS3-203ENST00000575185 CCER2I3L3R5 266 aa25.99■■□□□ 1.75
SPNS3-203ENST00000575185 PRKCZQ05513 592 aa25.99■■□□□ 1.75
SPNS3-203ENST00000575185 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa25.99■■□□□ 1.75
SPNS3-203ENST00000575185 FAM198AQ9UFP1 575 aa25.99■■□□□ 1.75
SPNS3-203ENST00000575185 MYH2Q9UKX2 1941 aa25.98■■□□□ 1.75
SPNS3-203ENST00000575185 CYP2C8P10632 490 aa25.98■■□□□ 1.75
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SPNS3-203ENST00000575185 GJA8P48165 433 aa25.98■■□□□ 1.75
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SPNS3-203ENST00000575185 GPAT2Q6NUI2 795 aa25.97■■□□□ 1.75
SPNS3-203ENST00000575185 ZFPM1Q8IX07 1006 aa25.97■■□□□ 1.75
SPNS3-203ENST00000575185 WDR66Q8TBY9 1149 aa25.97■■□□□ 1.75
SPNS3-203ENST00000575185 PHIPQ8WWQ0 1821 aa25.97■■□□□ 1.75
SPNS3-203ENST00000575185 GJB1P08034 283 aa25.96■■□□□ 1.75
SPNS3-203ENST00000575185 BCRP11274 1271 aa25.96■■□□□ 1.75
SPNS3-203ENST00000575185 SLC5A1P13866 664 aa25.96■■□□□ 1.75
SPNS3-203ENST00000575185 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
SPNS3-203ENST00000575185 USP44Q9H0E7 712 aa25.96■■□□□ 1.75
SPNS3-203ENST00000575185 RNF208Q9H0X6 261 aa25.96■■□□□ 1.75
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SPNS3-203ENST00000575185 GABRQQ9UN88 632 aa25.96■■□□□ 1.75
SPNS3-203ENST00000575185 DOCK1Q14185 1865 aa25.96■■□□□ 1.75
SPNS3-203ENST00000575185 ATRNL1Q5VV63 1379 aa25.95■■□□□ 1.75
SPNS3-203ENST00000575185 EYA2O00167 538 aa25.95■■□□□ 1.74
SPNS3-203ENST00000575185 NKX2-3Q8TAU0 364 aa25.95■■□□□ 1.74
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SPNS3-203ENST00000575185 FCGRTP55899 365 aa25.93■■□□□ 1.74
SPNS3-203ENST00000575185 ATG9AQ7Z3C6 839 aa25.93■■□□□ 1.74
SPNS3-203ENST00000575185 UNC93B1Q9H1C4 597 aa25.93■■□□□ 1.74
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SPNS3-203ENST00000575185 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.92■■□□□ 1.74
SPNS3-203ENST00000575185 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
SPNS3-203ENST00000575185 PRO3102Q9H379 93 aa25.92■■□□□ 1.74
SPNS3-203ENST00000575185 PTPRCP08575 1304 aa25.91■■□□□ 1.74
SPNS3-203ENST00000575185 LDHBP07195 334 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
SPNS3-203ENST00000575185 UBXN2AP68543 259 aa25.91■■□□□ 1.74
SPNS3-203ENST00000575185 HTATIP2Q9BUP3 242 aa25.91■■□□□ 1.74
SPNS3-203ENST00000575185 SIL1Q9H173 461 aa25.91■■□□□ 1.74
SPNS3-203ENST00000575185 ZNF521Q96K83 1311 aa25.9■■□□□ 1.74
SPNS3-203ENST00000575185 PHF20L1A8MW92 1017 aa25.9■■□□□ 1.74
SPNS3-203ENST00000575185 CXCL11O14625 94 aa25.9■■□□□ 1.74
SPNS3-203ENST00000575185 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
SPNS3-203ENST00000575185 ELNP15502 786 aa25.9■■□□□ 1.74
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