RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566135.1

TMX3-208, Transcript of thioredoxin related transmembrane protein 3, human

TSL 3

Gene TMX3, Length 395 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMX3-208	ENST00000566135	CABP4	P57796	275 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TMX3-208	ENST00000566135	FDX2	Q6P4F2	183 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TMX3-208	ENST00000566135	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TMX3-208	ENST00000566135	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TMX3-208	ENST00000566135	ASIC4	Q96FT7	647 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TMX3-208	ENST00000566135	CRELD1	Q96HD1	420 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TMX3-208	ENST00000566135	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TMX3-208	ENST00000566135	PIM2	Q9P1W9	311 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TMX3-208	ENST00000566135	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TMX3-208	ENST00000566135	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TMX3-208	ENST00000566135	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	BSND	Q8WZ55	320 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	ADAM19	Q9H013	955 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	RNF208	Q9H0X6	261 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	ITPKA	P23677	461 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	5.01	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	ABI1	Q8IZP0	508 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	FBXL18	Q96ME1	805 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	USP31	Q70CQ4	1352 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	SCAMP3	O14828	347 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	TCF3	P15923	654 aa		5	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	RXRB	P28702	533 aa		5	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	JAG1	P78504	1218 aa		5	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	OGFOD2	Q6N063	350 aa		5	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		5	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		5	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	WNT8B	Q93098	351 aa		5	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		5	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		5	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	ZNF576	Q9H609	170 aa		5	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		5	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	SOX13	Q9UN79	622 aa		5	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135		H3BRJ5	948 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	EPHA1	P21709	976 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	ZNF76	P36508	570 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	PREP	P48147	710 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	ARL4D	P49703	201 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	PIP4K2B	P78356	416 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	PCDH1	Q08174	1060 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	FBXO24	O75426	580 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	FANCC	Q00597	558 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	FAAP100	Q0VG06	881 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	IKBKE	Q14164	716 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	FBXL6	Q8N531	539 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	RNF34	Q969K3	372 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	FOSL1	P15407	271 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	NLRP12	P59046	1061 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	CEP44	Q9C0F1	390 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMX3-208	ENST00000566135	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TMX3-208	ENST00000566135	ADAM11	O75078	769 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TMX3-208	ENST00000566135	B3GALT4	O96024	378 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TMX3-208	ENST00000566135	C8A	P07357	584 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TMX3-208	ENST00000566135	CELA3A	P09093	270 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TMX3-208	ENST00000566135	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TMX3-208	ENST00000566135	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TMX3-208	ENST00000566135	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TMX3-208	ENST00000566135	PAOX	Q6QHF9	649 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TMX3-208	ENST00000566135	SV2B	Q7L1I2	683 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TMX3-208	ENST00000566135	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TMX3-208	ENST00000566135	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		4.96	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms