RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564966.5

PPP4C-208, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 1,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-208ENST00000564966 TCP10Q12799 353 aa31.38■■■□□ 2.61
PPP4C-208ENST00000564966 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa31.38■■■□□ 2.61
PPP4C-208ENST00000564966 DCAF15Q66K64 600 aa31.38■■■□□ 2.61
PPP4C-208ENST00000564966 ABCF2Q9UG63 623 aa31.38■■■□□ 2.61
PPP4C-208ENST00000564966 A0A1B0GUL7 405 aa31.37■■■□□ 2.61
PPP4C-208ENST00000564966 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP31.37■■■□□ 2.61
PPP4C-208ENST00000564966 USP40Q9NVE5 1235 aa31.37■■■□□ 2.61
PPP4C-208ENST00000564966 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa31.36■■■□□ 2.61
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PPP4C-208ENST00000564966 CCL15Q16663 113 aa31.36■■■□□ 2.61
PPP4C-208ENST00000564966 GORABQ5T7V8 394 aa31.36■■■□□ 2.61
PPP4C-208ENST00000564966 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa31.36■■■□□ 2.61
PPP4C-208ENST00000564966 MIGA2Q7L4E1 593 aa31.36■■■□□ 2.61
PPP4C-208ENST00000564966 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP31.36■■■□□ 2.61
PPP4C-208ENST00000564966 SALL1Q9NSC2 1324 aa31.35■■■□□ 2.61
PPP4C-208ENST00000564966 GTF2A2P52657 109 aa31.35■■■□□ 2.61
PPP4C-208ENST00000564966 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP31.35■■■□□ 2.613e-7■■□□□ 12.7
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PPP4C-208ENST00000564966 FAM151AQ8WW52 585 aa31.35■■■□□ 2.61
PPP4C-208ENST00000564966 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP31.35■■■□□ 2.61
PPP4C-208ENST00000564966 XAGE2Q96GT9 111 aa31.35■■■□□ 2.61
PPP4C-208ENST00000564966 MVPQ14764 893 aaKnown RBP31.34■■■□□ 2.61
PPP4C-208ENST00000564966 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP31.34■■■□□ 2.61
PPP4C-208ENST00000564966 TMEM57Q8N5G2 664 aa31.34■■■□□ 2.61
PPP4C-208ENST00000564966 PTPN18Q99952 460 aa31.34■■■□□ 2.61
PPP4C-208ENST00000564966 ZNF341Q9BYN7 854 aa31.34■■■□□ 2.61
PPP4C-208ENST00000564966 TRIM17Q9Y577 477 aa31.34■■■□□ 2.61
PPP4C-208ENST00000564966 RASGRF1Q13972 1273 aa31.33■■■□□ 2.61
PPP4C-208ENST00000564966 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
PPP4C-208ENST00000564966 AK9Q5TCS8 1911 aa31.33■■■□□ 2.61
PPP4C-208ENST00000564966 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP31.32■■■□□ 2.6
PPP4C-208ENST00000564966 LAMB1P07942 1786 aa31.31■■■□□ 2.6
PPP4C-208ENST00000564966 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP31.31■■■□□ 2.6
PPP4C-208ENST00000564966 SPDYE5A6NIY4 337 aa31.31■■■□□ 2.6
PPP4C-208ENST00000564966 NFIAQ12857 509 aa31.31■■■□□ 2.6
PPP4C-208ENST00000564966 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP31.31■■■□□ 2.6
PPP4C-208ENST00000564966 ERO1BQ86YB8 467 aa31.31■■■□□ 2.6
PPP4C-208ENST00000564966 BRI3BPQ8WY22 251 aa31.31■■■□□ 2.6
PPP4C-208ENST00000564966 ERO1AQ96HE7 468 aa31.31■■■□□ 2.6
PPP4C-208ENST00000564966 MS4A4AQ96JQ5 239 aa31.31■■■□□ 2.6
PPP4C-208ENST00000564966 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa31.31■■■□□ 2.6
PPP4C-208ENST00000564966 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa31.3■■■□□ 2.6
PPP4C-208ENST00000564966 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP31.3■■■□□ 2.6
PPP4C-208ENST00000564966 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP31.3■■■□□ 2.6
PPP4C-208ENST00000564966 SLF2Q8IX21 1173 aa31.3■■■□□ 2.6
PPP4C-208ENST00000564966 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP31.29■■■□□ 2.6
PPP4C-208ENST00000564966 CD99L2Q8TCZ2 262 aa31.29■■■□□ 2.6
PPP4C-208ENST00000564966 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP31.28■■■□□ 2.6
PPP4C-208ENST00000564966 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa31.28■■■□□ 2.6
PPP4C-208ENST00000564966 CETPP11597 493 aa31.27■■■□□ 2.6
PPP4C-208ENST00000564966 SP3Q02447 781 aa31.27■■■□□ 2.6
PPP4C-208ENST00000564966 ERICH6Q7L0X2 663 aa31.27■■■□□ 2.6
PPP4C-208ENST00000564966 ITPRIPQ8IWB1 547 aa31.27■■■□□ 2.6
PPP4C-208ENST00000564966 FAM198AQ9UFP1 575 aa31.27■■■□□ 2.6
PPP4C-208ENST00000564966 INPP5BP32019 993 aa31.26■■■□□ 2.59
PPP4C-208ENST00000564966 SNAPC2Q13487 334 aa31.26■■■□□ 2.59
PPP4C-208ENST00000564966 OTOP1Q7RTM1 612 aa31.26■■■□□ 2.59
PPP4C-208ENST00000564966 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP31.26■■■□□ 2.59
PPP4C-208ENST00000564966 MYH2Q9UKX2 1941 aa31.26■■■□□ 2.59
PPP4C-208ENST00000564966 IRF6O14896 467 aa31.25■■■□□ 2.59
PPP4C-208ENST00000564966 RGS3P49796 1198 aa31.25■■■□□ 2.59
PPP4C-208ENST00000564966 FAM43AQ8N2R8 423 aa31.25■■■□□ 2.59
PPP4C-208ENST00000564966 C1orf115Q9H7X2 142 aa31.25■■■□□ 2.59
PPP4C-208ENST00000564966 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP31.24■■■□□ 2.59
PPP4C-208ENST00000564966 PPIL2Q13356 520 aa31.24■■■□□ 2.59
PPP4C-208ENST00000564966 ZFPM1Q8IX07 1006 aa31.24■■■□□ 2.59
PPP4C-208ENST00000564966 EFCC1Q9HA90 598 aa31.24■■■□□ 2.59
PPP4C-208ENST00000564966 BTDP43251 543 aa31.23■■■□□ 2.59
PPP4C-208ENST00000564966 PICALMQ13492 652 aa31.23■■■□□ 2.59
PPP4C-208ENST00000564966 SPATA5Q8NB90 893 aa31.23■■■□□ 2.59
PPP4C-208ENST00000564966 HMG20BQ9P0W2 317 aa31.23■■■□□ 2.59
PPP4C-208ENST00000564966 PPATQ06203 517 aa31.22■■■□□ 2.59
PPP4C-208ENST00000564966 RAI14Q9P0K7 980 aa31.22■■■□□ 2.59
PPP4C-208ENST00000564966 GAKO14976 1311 aa31.22■■■□□ 2.59
PPP4C-208ENST00000564966 MECOMQ03112 1051 aa31.21■■■□□ 2.59
PPP4C-208ENST00000564966 PI16Q6UXB8 463 aa31.21■■■□□ 2.59
PPP4C-208ENST00000564966 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP31.21■■■□□ 2.59
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PPP4C-208ENST00000564966 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa31.2■■■□□ 2.59
PPP4C-208ENST00000564966 BTBD19C9JJ37 291 aa31.19■■■□□ 2.58
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PPP4C-208ENST00000564966 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa31.19■■■□□ 2.58
PPP4C-208ENST00000564966 GSTO1P78417 241 aa31.19■■■□□ 2.58
PPP4C-208ENST00000564966 ARHGEF6Q15052 776 aa31.19■■■□□ 2.58
PPP4C-208ENST00000564966 IDI2Q9BXS1 227 aa31.19■■■□□ 2.58
PPP4C-208ENST00000564966 ATP8B2P98198 1209 aa31.18■■■□□ 2.58
PPP4C-208ENST00000564966 TTC39AQ5SRH9 613 aa31.18■■■□□ 2.58
PPP4C-208ENST00000564966 ZNF112Q9UJU3 913 aa31.18■■■□□ 2.58
PPP4C-208ENST00000564966 LDHCP07864 332 aa31.17■■■□□ 2.58
PPP4C-208ENST00000564966 LRP2BPQ9P2M1 347 aa31.17■■■□□ 2.58
PPP4C-208ENST00000564966 PTPN22Q9Y2R2 807 aa31.17■■■□□ 2.58
PPP4C-208ENST00000564966 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP31.16■■■□□ 2.58
PPP4C-208ENST00000564966 POLA2Q14181 598 aa31.16■■■□□ 2.58
PPP4C-208ENST00000564966 CCDC158Q5M9N0 1113 aa31.16■■■□□ 2.58
PPP4C-208ENST00000564966 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP31.16■■■□□ 2.58
PPP4C-208ENST00000564966 PICK1Q9NRD5 415 aa31.16■■■□□ 2.58
PPP4C-208ENST00000564966 DOCK2Q92608 1830 aa31.16■■■□□ 2.58
PPP4C-208ENST00000564966 ZBED9Q6R2W3 1325 aa31.16■■■□□ 2.58
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