RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564630.5

CCNDBP1-205, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 2,079 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-205ENST00000564630 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
CCNDBP1-205ENST00000564630 TAF7LQ5H9L4 462 aa23.67■■□□□ 1.38
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF75DP51815 510 aa23.66■■□□□ 1.38
CCNDBP1-205ENST00000564630 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
CCNDBP1-205ENST00000564630 SCARF1Q14162 830 aa23.66■■□□□ 1.38
CCNDBP1-205ENST00000564630 WASHC4Q2M389 1173 aa23.66■■□□□ 1.38
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
CCNDBP1-205ENST00000564630 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa23.66■■□□□ 1.38
CCNDBP1-205ENST00000564630 AKAP11Q9UKA4 1901 aa23.66■■□□□ 1.38
CCNDBP1-205ENST00000564630 CARMIL3Q8ND23 1372 aa23.66■■□□□ 1.38
CCNDBP1-205ENST00000564630 ERVV-1B6SEH8 477 aa23.66■■□□□ 1.38
CCNDBP1-205ENST00000564630 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
CCNDBP1-205ENST00000564630 RIC1Q4ADV7 1423 aa23.65■■□□□ 1.38
CCNDBP1-205ENST00000564630 GPTP24298 496 aa23.65■■□□□ 1.38
CCNDBP1-205ENST00000564630 CLEC4GQ6UXB4 293 aa23.65■■□□□ 1.38
CCNDBP1-205ENST00000564630 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP23.65■■□□□ 1.38
CCNDBP1-205ENST00000564630 FAM177BA6PVY3 158 aa23.64■■□□□ 1.38
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZAP70P43403 619 aa23.64■■□□□ 1.38
CCNDBP1-205ENST00000564630 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.38
CCNDBP1-205ENST00000564630 SARM1Q6SZW1 724 aa23.64■■□□□ 1.38
CCNDBP1-205ENST00000564630 APPBP2Q92624 585 aa23.64■■□□□ 1.38
CCNDBP1-205ENST00000564630 USP28Q96RU2 1077 aa23.64■■□□□ 1.38
CCNDBP1-205ENST00000564630 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP23.64■■□□□ 1.382e-7■□□□□ 10.2
CCNDBP1-205ENST00000564630 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF165P49910 485 aa23.64■■□□□ 1.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa23.64■■□□□ 1.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 SETDB2Q96T68 719 aa23.64■■□□□ 1.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 DNAJC25Q9H1X3 360 aa23.64■■□□□ 1.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 CDHR2Q9BYE9 1310 aa23.63■■□□□ 1.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 FGAP02671 866 aa23.63■■□□□ 1.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 SERPINB2P05120 415 aa23.63■■□□□ 1.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCDC186Q7Z3E2 898 aa23.63■■□□□ 1.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCDC24Q8N4L8 307 aa23.63■■□□□ 1.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 CTAGE5O15320 804 aa23.63■■□□□ 1.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 NEMFO60524 1076 aa23.63■■□□□ 1.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 FDPSP14324 419 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 HAND2P61296 217 aa23.63■■□□□ 1.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 GUCY1B3Q02153 619 aa23.62■■□□□ 1.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 NRXN2Q9P2S2 1712 aa23.62■■□□□ 1.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP23.61■■□□□ 1.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 TAF3Q5VWG9 929 aa23.61■■□□□ 1.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa23.61■■□□□ 1.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 KCND1Q9NSA2 647 aa23.61■■□□□ 1.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa23.61■■□□□ 1.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 UBN2Q6ZU65 1347 aa23.61■■□□□ 1.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 PPFIA3O75145 1194 aa23.61■■□□□ 1.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 NLGN2Q8NFZ4 835 aa23.61■■□□□ 1.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 SYT17Q9BSW7 474 aa23.61■■□□□ 1.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 PRC1O43663 620 aa23.6■■□□□ 1.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 METTL24Q5JXM2 366 aa23.6■■□□□ 1.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 PI16Q6UXB8 463 aa23.6■■□□□ 1.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa23.6■■□□□ 1.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa23.6■■□□□ 1.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 SYNE4Q8N205 404 aa23.6■■□□□ 1.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 TRIM5Q9C035 493 aa23.6■■□□□ 1.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 C10orf71Q711Q0 1435 aa23.59■■□□□ 1.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 GPAA1O43292 621 aa23.59■■□□□ 1.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 NLRP10Q86W26 655 aa23.59■■□□□ 1.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 TTLL11Q8NHH1 800 aa23.59■■□□□ 1.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 NCOA7Q8NI08 942 aa23.59■■□□□ 1.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 RGL2O15211 777 aa23.58■■□□□ 1.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 ITGA6P23229 1130 aa23.58■■□□□ 1.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 MCAMP43121 646 aa23.58■■□□□ 1.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa23.58■■□□□ 1.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 ENGASEQ8NFI3 743 aa23.58■■□□□ 1.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa23.58■■□□□ 1.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP23.58■■□□□ 1.371e-6■■■□□ 18.5
CCNDBP1-205ENST00000564630 GREM2Q9H772 168 aa23.58■■□□□ 1.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 NPHP1O15259 732 aa23.58■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 TNNT1P13805 278 aa23.58■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 FAM160A1Q05DH4 1040 aa23.58■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 STX1AQ16623 288 aa23.58■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF34Q8IZ26 560 aa23.58■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 KIF13BQ9NQT8 1826 aa23.58■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 WDR19Q8NEZ3 1342 aa23.57■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa23.57■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF213O14771 459 aa23.57■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 ANTXR2P58335 489 aa23.57■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 PRR5LQ6MZQ0 368 aa23.57■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 HPS5Q9UPZ3 1129 aa23.57■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 GOLGA8BA8MQT2 603 aa23.56■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 KINO60870 393 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 ME1P48163 572 aa23.56■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 CTSWP56202 376 aa23.56■■□□□ 1.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 IQCB1Q15051 598 aa23.56■■□□□ 1.36
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