RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563854.1

NME3-205, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 5

Gene NME3, Length 583 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-205ENST00000563854 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP21.85■■□□□ 1.09
NME3-205ENST00000563854 INHBEP58166 350 aa21.85■■□□□ 1.09
NME3-205ENST00000563854 MAP3K9P80192 1104 aa21.85■■□□□ 1.09
NME3-205ENST00000563854 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa21.85■■□□□ 1.09
NME3-205ENST00000563854 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
NME3-205ENST00000563854 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
NME3-205ENST00000563854 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
NME3-205ENST00000563854 WRNIP1Q96S55 665 aa21.85■■□□□ 1.09
NME3-205ENST00000563854 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
NME3-205ENST00000563854 FKBP1CQ5VVH2 108 aa21.84■■□□□ 1.09
NME3-205ENST00000563854 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP21.84■■□□□ 1.092e-7■■■■□ 21.2
NME3-205ENST00000563854 HOOK2Q96ED9 719 aa21.84■■□□□ 1.09
NME3-205ENST00000563854 OTUD5Q96G74 571 aa21.84■■□□□ 1.09
NME3-205ENST00000563854 USP40Q9NVE5 1235 aa21.84■■□□□ 1.09
NME3-205ENST00000563854 FKTNO75072 461 aa21.82■■□□□ 1.08
NME3-205ENST00000563854 RLBP1P12271 317 aa21.82■■□□□ 1.08
NME3-205ENST00000563854 NFIAQ12857 509 aa21.82■■□□□ 1.08
NME3-205ENST00000563854 DCAF15Q66K64 600 aa21.82■■□□□ 1.08
NME3-205ENST00000563854 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa21.82■■□□□ 1.08
NME3-205ENST00000563854 MIGA2Q7L4E1 593 aa21.82■■□□□ 1.08
NME3-205ENST00000563854 FAM151AQ8WW52 585 aa21.82■■□□□ 1.08
NME3-205ENST00000563854 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
NME3-205ENST00000563854 LAMB1P07942 1786 aa21.82■■□□□ 1.08
NME3-205ENST00000563854 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
NME3-205ENST00000563854 CFHR5Q9BXR6 569 aa21.81■■□□□ 1.08
NME3-205ENST00000563854 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
NME3-205ENST00000563854 PI16Q6UXB8 463 aa21.8■■□□□ 1.08
NME3-205ENST00000563854 ZNF341Q9BYN7 854 aa21.8■■□□□ 1.08
NME3-205ENST00000563854 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa21.8■■□□□ 1.08
NME3-205ENST00000563854 MYH2Q9UKX2 1941 aa21.8■■□□□ 1.08
NME3-205ENST00000563854 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
NME3-205ENST00000563854 AK9Q5TCS8 1911 aa21.79■■□□□ 1.08
NME3-205ENST00000563854 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa21.79■■□□□ 1.08
NME3-205ENST00000563854 CCL15Q16663 113 aa21.79■■□□□ 1.08
NME3-205ENST00000563854 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
NME3-205ENST00000563854 ERICH6Q7L0X2 663 aa21.79■■□□□ 1.08
NME3-205ENST00000563854 PTPN18Q99952 460 aa21.79■■□□□ 1.08
NME3-205ENST00000563854 HMG20BQ9P0W2 317 aa21.79■■□□□ 1.08
NME3-205ENST00000563854 FAM198AQ9UFP1 575 aa21.79■■□□□ 1.08
NME3-205ENST00000563854 SPDYE5A6NIY4 337 aa21.78■■□□□ 1.08
NME3-205ENST00000563854 SURF6O75683 361 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
NME3-205ENST00000563854 GTF2A2P52657 109 aa21.78■■□□□ 1.08
NME3-205ENST00000563854 ATP8B2P98198 1209 aa21.78■■□□□ 1.08
NME3-205ENST00000563854 CRHR2Q13324 411 aa21.78■■□□□ 1.08
NME3-205ENST00000563854 POLA2Q14181 598 aa21.78■■□□□ 1.08
NME3-205ENST00000563854 SLF2Q8IX21 1173 aa21.78■■□□□ 1.08
NME3-205ENST00000563854 SPATA5Q8NB90 893 aa21.78■■□□□ 1.08
NME3-205ENST00000563854 GAKO14976 1311 aa21.78■■□□□ 1.08
NME3-205ENST00000563854 INPP5BP32019 993 aa21.77■■□□□ 1.08
NME3-205ENST00000563854 BTDP43251 543 aa21.77■■□□□ 1.08
NME3-205ENST00000563854 RGS3P49796 1198 aa21.77■■□□□ 1.08
NME3-205ENST00000563854 SOX10P56693 466 aa21.77■■□□□ 1.08
NME3-205ENST00000563854 MECOMQ03112 1051 aa21.77■■□□□ 1.08
NME3-205ENST00000563854 PICALMQ13492 652 aa21.77■■□□□ 1.08
NME3-205ENST00000563854 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa21.77■■□□□ 1.08
NME3-205ENST00000563854 ERO1BQ86YB8 467 aa21.77■■□□□ 1.08
NME3-205ENST00000563854 PANK1Q8TE04 598 aa21.77■■□□□ 1.08
NME3-205ENST00000563854 SSH3Q8TE77 659 aa21.77■■□□□ 1.08
NME3-205ENST00000563854 BRI3BPQ8WY22 251 aa21.77■■□□□ 1.08
NME3-205ENST00000563854 MS4A4AQ96JQ5 239 aa21.77■■□□□ 1.08
NME3-205ENST00000563854 HPS5Q9UPZ3 1129 aa21.77■■□□□ 1.08
NME3-205ENST00000563854 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
NME3-205ENST00000563854 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
NME3-205ENST00000563854 ZBTB22O15209 634 aa21.76■■□□□ 1.07
NME3-205ENST00000563854 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
NME3-205ENST00000563854 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
NME3-205ENST00000563854 ZFPM1Q8IX07 1006 aa21.76■■□□□ 1.07
NME3-205ENST00000563854 RAI14Q9P0K7 980 aa21.76■■□□□ 1.07
NME3-205ENST00000563854 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa21.76■■□□□ 1.07
NME3-205ENST00000563854 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
NME3-205ENST00000563854 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
NME3-205ENST00000563854 TNNI3KQ59H18 835 aa21.75■■□□□ 1.07
NME3-205ENST00000563854 TTC39AQ5SRH9 613 aa21.75■■□□□ 1.07
NME3-205ENST00000563854 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa21.75■■□□□ 1.07
NME3-205ENST00000563854 DOCK2Q92608 1830 aa21.74■■□□□ 1.07
NME3-205ENST00000563854 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa21.74■■□□□ 1.07
NME3-205ENST00000563854 MCAMP43121 646 aa21.74■■□□□ 1.07
NME3-205ENST00000563854 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
NME3-205ENST00000563854 DBNDD2Q9BQY9 259 aa21.74■■□□□ 1.07
NME3-205ENST00000563854 SNRKQ9NRH2 765 aa21.74■■□□□ 1.07
NME3-205ENST00000563854 TRIM17Q9Y577 477 aa21.74■■□□□ 1.07
NME3-205ENST00000563854 IRF6O14896 467 aa21.73■■□□□ 1.07
NME3-205ENST00000563854 CETPP11597 493 aa21.73■■□□□ 1.07
NME3-205ENST00000563854 PPIL2Q13356 520 aa21.73■■□□□ 1.07
NME3-205ENST00000563854 SNAPC2Q13487 334 aa21.73■■□□□ 1.07
NME3-205ENST00000563854 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
NME3-205ENST00000563854 FAM43AQ8N2R8 423 aa21.73■■□□□ 1.07
NME3-205ENST00000563854 CD99L2Q8TCZ2 262 aa21.73■■□□□ 1.07
NME3-205ENST00000563854 LRP2BPQ9P2M1 347 aa21.73■■□□□ 1.07
NME3-205ENST00000563854 ENTPD3O75355 529 aa21.72■■□□□ 1.07
NME3-205ENST00000563854 GSTO1P78417 241 aa21.72■■□□□ 1.07
NME3-205ENST00000563854 CCDC158Q5M9N0 1113 aa21.72■■□□□ 1.07
NME3-205ENST00000563854 ZNF384Q8TF68 577 aa21.72■■□□□ 1.07
NME3-205ENST00000563854 ERO1AQ96HE7 468 aa21.72■■□□□ 1.07
NME3-205ENST00000563854 IDI2Q9BXS1 227 aa21.72■■□□□ 1.07
NME3-205ENST00000563854 GPR108Q9NPR9 543 aa21.72■■□□□ 1.07
NME3-205ENST00000563854 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
NME3-205ENST00000563854 RFX7Q2KHR2 1363 aa21.72■■□□□ 1.07
NME3-205ENST00000563854 CEP85Q6P2H3 762 aa21.71■■□□□ 1.07
NME3-205ENST00000563854 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.9 ms