RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561726.1

TNRC6A-208, Transcript of trinucleotide repeat containing 6A, human

TSL 4

Gene TNRC6A, Length 543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TNRC6A-208	ENST00000561726	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	RAD18	Q9NS91	495 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	WNT11	O96014	354 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	NFIC	P08651	508 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	RAB6A	P20340	208 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	IRAK1	P51617	712 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	FAAP100	Q0VG06	881 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	GRM2	Q14416	872 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	ZAR1	Q86SH2	424 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	RBCK1	Q9BYM8	510 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	FAM170B	A6NMN3	283 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	AOC2	O75106	756 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	FOSL1	P15407	271 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	ASPA	P45381	313 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	PDE3A	Q14432	1141 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	PI16	Q6UXB8	463 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	CERS3	Q8IU89	383 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	GATA6	Q92908	595 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	SPATA32	Q96LK8	384 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	LIG1	P18858	919 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	AP3B2	Q13367	1082 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	MAP7	Q14244	749 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	MSMP	Q1L6U9	139 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	TMC7	Q7Z402	723 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	PSMD1	Q99460	953 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	WDR18	Q9BV38	432 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	LGR6	Q9HBX8	967 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	CYP26A1	O43174	497 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	FCGRT	P55899	365 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	CCDC86	Q9H6F5	360 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	ZNF862	O60290	1169 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	ZNF765	Q7L2R6	523 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	DRC1	Q96MC2	740 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TNRC6A-208	ENST00000561726	TMPRSS2	O15393	492 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TNRC6A-208	ENST00000561726	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TNRC6A-208	ENST00000561726	MAPK1	P28482	360 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TNRC6A-208	ENST00000561726	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TNRC6A-208	ENST00000561726	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TNRC6A-208	ENST00000561726	TICAM2	Q86XR7	235 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TNRC6A-208	ENST00000561726	ABI1	Q8IZP0	508 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TNRC6A-208	ENST00000561726	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TNRC6A-208	ENST00000561726	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TNRC6A-208	ENST00000561726	BCO2	Q9BYV7	579 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TNRC6A-208	ENST00000561726	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TNRC6A-208	ENST00000561726	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TNRC6A-208	ENST00000561726	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TNRC6A-208	ENST00000561726	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TNRC6A-208	ENST00000561726	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TNRC6A-208	ENST00000561726	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TNRC6A-208	ENST00000561726	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNRC6A-208	ENST00000561726	PAX4	O43316	350 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNRC6A-208	ENST00000561726	PRNP	P04156	253 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNRC6A-208	ENST00000561726	PLCB3	Q01970	1234 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TNRC6A-208	ENST00000561726	DSC3	Q14574	896 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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