RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560941.5

LINS1-211, Transcript of lines homolog 1, humanhuman

TSL 5

Gene LINS1, Length 588 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINS1-211ENST00000560941 ITPRIPQ8IWB1 547 aa10.26□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 COA1Q9GZY4 146 aa10.26□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 CD209Q9NNX6 404 aa10.26□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 RCAN3Q9UKA8 241 aa10.26□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 IRS2Q9Y4H2 1338 aa10.26□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 SCN9AQ15858 1988 aa10.25□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 USP17L3A6NCW0 530 aa10.25□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 USP17L4A6NCW7 530 aa10.25□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 H7C1D1 291 aa10.25□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 EYA2O00167 538 aa10.25□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 GNAI3P08754 354 aa10.25□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 TTLL5Q6EMB2 1281 aa10.25□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 DLK2Q6UY11 383 aa10.25□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 USP17L1Q7RTZ2 530 aa10.25□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 ATG9AQ7Z3C6 839 aa10.25□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 CNTROBQ8N137 903 aa10.25□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa10.24□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 RNF223E7ERA6 249 aa10.24□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 TRAF5O00463 557 aa10.24□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 SRGAP3O43295 1099 aa10.24□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 GNAI2P04899 355 aa10.24□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 DNAJB2P25686 324 aa10.24□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 UBE4AQ14139 1066 aa10.24□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 DACT2Q5SW24 774 aa10.24□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 ZNF787Q6DD87 383 aa10.24□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa10.24□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 VGLL2Q8N8G2 317 aa10.24□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 DPF2Q92785 391 aa10.24□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 MROH5Q6ZUA9 1318 aa10.24□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 SCN4AP35499 1836 aa10.23□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 F8W031 263 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 PDE8BO95263 885 aa10.23□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 RPS12P25398 132 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 C20orf194Q5TEA3 1177 aa10.23□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 ZNF804AQ7Z570 1209 aa10.23□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 GMLQ99445 158 aa10.23□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 TMEM134Q9H6X4 195 aa10.23□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 COG6Q9Y2V7 657 aa10.23□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 USP17L8P0C7I0 530 aa10.22□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 PTGDRQ13258 359 aa10.22□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa10.22□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 STRIP1Q5VSL9 837 aa10.22□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 USP48Q86UV5 1035 aa10.22□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 KIAA0825Q8IV33 1275 aa10.22□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 CERS5Q8N5B7 392 aa10.22□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 AGBL3Q8NEM8 1001 aa10.22□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 HDAC5Q9UQL6 1122 aa10.22□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 IL1R1P14778 569 aa10.21□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 FGFR2P21802 821 aa10.21□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 SLC19A1P41440 591 aa10.21□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 PRR20EP86478 221 aa10.21□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 PRR20CP86479 221 aa10.21□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 PRR20DP86480 221 aa10.21□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 PRR20BP86481 221 aa10.21□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 PRR20AP86496 221 aa10.21□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 SCARF1Q14162 830 aa10.21□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 FBXO33Q7Z6M2 555 aa10.21□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 VPS37DQ86XT2 251 aa10.21□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 ANKLE1Q8NAG6 615 aa10.21□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 COPRSQ9NQ92 184 aa10.21□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 CEP126Q9P2H0 1117 aa10.21□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa10.21□□□□□ -0.77
LINS1-211ENST00000560941 PASKQ96RG2 1323 aa10.21□□□□□ -0.78
LINS1-211ENST00000560941 TLL1O43897 1013 aa10.2□□□□□ -0.78
LINS1-211ENST00000560941 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
LINS1-211ENST00000560941 CIAO1O76071 339 aa10.2□□□□□ -0.78
LINS1-211ENST00000560941 SASH1O94885 1247 aa10.2□□□□□ -0.78
LINS1-211ENST00000560941 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
LINS1-211ENST00000560941 ADORA1P30542 326 aa10.2□□□□□ -0.78
LINS1-211ENST00000560941 IL15P40933 162 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
LINS1-211ENST00000560941 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
LINS1-211ENST00000560941 TIMM10P62072 90 aa10.2□□□□□ -0.78
LINS1-211ENST00000560941 ATP8B2P98198 1209 aa10.2□□□□□ -0.78
LINS1-211ENST00000560941 TFCP2Q12800 502 aa10.2□□□□□ -0.78
LINS1-211ENST00000560941 MTX1Q13505 466 aa10.2□□□□□ -0.78
LINS1-211ENST00000560941 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
LINS1-211ENST00000560941 GRIK5Q16478 980 aa10.2□□□□□ -0.78
LINS1-211ENST00000560941 NBPF9Q3BBW0 867 aa10.2□□□□□ -0.78
LINS1-211ENST00000560941 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa10.2□□□□□ -0.78
LINS1-211ENST00000560941 ZNF408Q9H9D4 720 aa10.2□□□□□ -0.78
LINS1-211ENST00000560941 MYOZ2Q9NPC6 264 aa10.2□□□□□ -0.78
LINS1-211ENST00000560941 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
LINS1-211ENST00000560941 PGAP2Q9UHJ9 254 aa10.2□□□□□ -0.78
LINS1-211ENST00000560941 ADGRG1Q9Y653 693 aa10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms