RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558324.1

HERC1-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, humanhuman

TSL 5

Gene HERC1, Length 828 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1-202ENST00000558324 PANK1Q8TE04 598 aa14.72□□□□□ -0.05
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HERC1-202ENST00000558324 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa14.72□□□□□ -0.05
HERC1-202ENST00000558324 CSADQ9Y600 493 aa14.72□□□□□ -0.05
HERC1-202ENST00000558324 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.05
HERC1-202ENST00000558324 MAP3K9P80192 1104 aa14.71□□□□□ -0.05
HERC1-202ENST00000558324 POLA2Q14181 598 aa14.71□□□□□ -0.05
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HERC1-202ENST00000558324 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.05
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HERC1-202ENST00000558324 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
HERC1-202ENST00000558324 SURF6O75683 361 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
HERC1-202ENST00000558324 ATP8B2P98198 1209 aa14.7□□□□□ -0.06
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HERC1-202ENST00000558324 ALDH1A1P00352 501 aa14.69□□□□□ -0.06
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HERC1-202ENST00000558324 FAM151AQ8WW52 585 aa14.69□□□□□ -0.06
HERC1-202ENST00000558324 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HERC1-202ENST00000558324 HOOK2Q96ED9 719 aa14.69□□□□□ -0.06
HERC1-202ENST00000558324 FAM198AQ9UFP1 575 aa14.69□□□□□ -0.06
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HERC1-202ENST00000558324 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
HERC1-202ENST00000558324 ZFPM1Q8IX07 1006 aa14.68□□□□□ -0.06
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HERC1-202ENST00000558324 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa14.68□□□□□ -0.06
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HERC1-202ENST00000558324 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
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HERC1-202ENST00000558324 GSTO1P78417 241 aa14.63□□□□□ -0.07
HERC1-202ENST00000558324 PPIL2Q13356 520 aa14.63□□□□□ -0.07
HERC1-202ENST00000558324 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
HERC1-202ENST00000558324 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa14.63□□□□□ -0.07
HERC1-202ENST00000558324 FAM43AQ8N2R8 423 aa14.63□□□□□ -0.07
HERC1-202ENST00000558324 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
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