RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557245.1

RBM23-228, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 2

Gene RBM23, Length 387 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-228	ENST00000557245	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		14	□□□□□ -0.17
RBM23-228	ENST00000557245	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		14	□□□□□ -0.17
RBM23-228	ENST00000557245	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
RBM23-228	ENST00000557245	FGFR2	P21802	821 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RBM23-228	ENST00000557245	BCAM	P50895	628 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RBM23-228	ENST00000557245	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
RBM23-228	ENST00000557245	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RBM23-228	ENST00000557245	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RBM23-228	ENST00000557245	WRNIP1	Q96S55	665 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RBM23-228	ENST00000557245	MRI	Q9BWK5	157 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RBM23-228	ENST00000557245	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
RBM23-228	ENST00000557245	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RBM23-228	ENST00000557245	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RBM23-228	ENST00000557245	DOCK1	Q14185	1865 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RBM23-228	ENST00000557245	CETP	P11597	493 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RBM23-228	ENST00000557245	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
RBM23-228	ENST00000557245	PPIL2	Q13356	520 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RBM23-228	ENST00000557245	ARHGEF6	Q15052	776 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RBM23-228	ENST00000557245	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
RBM23-228	ENST00000557245	ERO1B	Q86YB8	467 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RBM23-228	ENST00000557245	HOOK2	Q96ED9	719 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RBM23-228	ENST00000557245	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RBM23-228	ENST00000557245	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
RBM23-228	ENST00000557245	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
RBM23-228	ENST00000557245	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RBM23-228	ENST00000557245	DCAF15	Q66K64	600 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RBM23-228	ENST00000557245	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RBM23-228	ENST00000557245	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RBM23-228	ENST00000557245	USP44	Q9H0E7	712 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RBM23-228	ENST00000557245	BTBD19	C9JJ37	291 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM23-228	ENST00000557245	IRF6	O14896	467 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM23-228	ENST00000557245	TLR2	O60603	784 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM23-228	ENST00000557245	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
RBM23-228	ENST00000557245	SNAPC2	Q13487	334 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM23-228	ENST00000557245	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
RBM23-228	ENST00000557245	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM23-228	ENST00000557245	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
RBM23-228	ENST00000557245	MEIS3	Q99687	375 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM23-228	ENST00000557245	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM23-228	ENST00000557245	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RBM23-228	ENST00000557245	EYA2	O00167	538 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RBM23-228	ENST00000557245	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
RBM23-228	ENST00000557245	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
RBM23-228	ENST00000557245	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RBM23-228	ENST00000557245	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RBM23-228	ENST00000557245	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RBM23-228	ENST00000557245	RLBP1	P12271	317 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RBM23-228	ENST00000557245	SLC5A1	P13866	664 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RBM23-228	ENST00000557245	PPAT	Q06203	517 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RBM23-228	ENST00000557245	NBPF11	Q86T75	865 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RBM23-228	ENST00000557245	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RBM23-228	ENST00000557245	PANK1	Q8TE04	598 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RBM23-228	ENST00000557245	LPIN2	Q92539	896 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RBM23-228	ENST00000557245	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RBM23-228	ENST00000557245	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RBM23-228	ENST00000557245	GNRH1	P01148	92 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RBM23-228	ENST00000557245	INPP5B	P32019	993 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RBM23-228	ENST00000557245	KIF22	Q14807	665 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RBM23-228	ENST00000557245	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RBM23-228	ENST00000557245	FAM151A	Q8WW52	585 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RBM23-228	ENST00000557245	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RBM23-228	ENST00000557245	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RBM23-228	ENST00000557245	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
RBM23-228	ENST00000557245	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RBM23-228	ENST00000557245	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RBM23-228	ENST00000557245	PRDX5	P30044	214 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RBM23-228	ENST00000557245	PRMT2	P55345	433 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RBM23-228	ENST00000557245	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RBM23-228	ENST00000557245	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
RBM23-228	ENST00000557245	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RBM23-228	ENST00000557245	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RBM23-228	ENST00000557245	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
RBM23-228	ENST00000557245	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RBM23-228	ENST00000557245	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBM23-228	ENST00000557245	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBM23-228	ENST00000557245	GNAI3	P08754	354 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBM23-228	ENST00000557245	CTGF	P29279	349 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBM23-228	ENST00000557245	NFIA	Q12857	509 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBM23-228	ENST00000557245	MOGS	Q13724	837 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBM23-228	ENST00000557245	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBM23-228	ENST00000557245	C17orf99	Q6UX52	265 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBM23-228	ENST00000557245	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBM23-228	ENST00000557245	FBXO3	Q9UK99	471 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBM23-228	ENST00000557245	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBM23-228	ENST00000557245	ZBTB22	O15209	634 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM23-228	ENST00000557245	CIAO1	O76071	339 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM23-228	ENST00000557245	TCP10	Q12799	353 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM23-228	ENST00000557245	ATP2B3	Q16720	1220 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM23-228	ENST00000557245	SHISA4	Q96DD7	197 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM23-228	ENST00000557245	TRIM47	Q96LD4	638 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM23-228	ENST00000557245	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM23-228	ENST00000557245	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM23-228	ENST00000557245	CPA4	Q9UI42	421 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM23-228	ENST00000557245	COG6	Q9Y2V7	657 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM23-228	ENST00000557245	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM23-228	ENST00000557245	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM23-228	ENST00000557245	PDHX	O00330	501 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM23-228	ENST00000557245	SEMA3E	O15041	775 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM23-228	ENST00000557245	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RBM23-228	ENST00000557245	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19

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