RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 ARHGAP45Q92619 1136 aa12.09□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 UTYO14607 1347 aa12.09□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 KIF16BQ96L93 1317 aa12.09□□□□□ -0.47
CS-217ENST00000550044 TRIM27P14373 513 aa12.08□□□□□ -0.48
CS-217ENST00000550044 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
CS-217ENST00000550044 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa12.08□□□□□ -0.48
CS-217ENST00000550044 MPHOSPH8Q99549 860 aa12.08□□□□□ -0.48
CS-217ENST00000550044 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa12.08□□□□□ -0.48
CS-217ENST00000550044 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
CS-217ENST00000550044 MINPP1Q9UNW1 487 aa12.08□□□□□ -0.48
CS-217ENST00000550044 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
CS-217ENST00000550044 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa12.08□□□□□ -0.48
CS-217ENST00000550044 UFL1O94874 794 aa12.07□□□□□ -0.48
CS-217ENST00000550044 SCARF1Q14162 830 aa12.07□□□□□ -0.48
CS-217ENST00000550044 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
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CS-217ENST00000550044 TAF7LQ5H9L4 462 aa12.07□□□□□ -0.48
CS-217ENST00000550044 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa12.07□□□□□ -0.48
CS-217ENST00000550044 TBC1D16Q8TBP0 767 aa12.07□□□□□ -0.48
CS-217ENST00000550044 FBXW7Q969H0 707 aa12.07□□□□□ -0.48
CS-217ENST00000550044 KIAA1468Q9P260 1216 aa12.07□□□□□ -0.48
CS-217ENST00000550044 TRIM17Q9Y577 477 aa12.07□□□□□ -0.48
CS-217ENST00000550044 CEP290O15078 2479 aa12.06□□□□□ -0.48
CS-217ENST00000550044 TM4SF4P48230 202 aa12.06□□□□□ -0.48
CS-217ENST00000550044 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa12.06□□□□□ -0.48
CS-217ENST00000550044 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
CS-217ENST00000550044 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
CS-217ENST00000550044 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
CS-217ENST00000550044 PODXL2Q9NZ53 605 aa12.06□□□□□ -0.48
CS-217ENST00000550044 GGA1Q9UJY5 639 aa12.06□□□□□ -0.48
CS-217ENST00000550044 PLIN1O60240 522 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-217ENST00000550044 VIL1P09327 827 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
CS-217ENST00000550044 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
CS-217ENST00000550044 COL9A1P20849 921 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-217ENST00000550044 ATP2B4P23634 1241 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-217ENST00000550044 SREBF2Q12772 1141 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-217ENST00000550044 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-217ENST00000550044 ANKRD44Q8N8A2 993 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-217ENST00000550044 EYA3Q99504 573 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-217ENST00000550044 MEIS3Q99687 375 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-217ENST00000550044 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
CS-217ENST00000550044 XDHP47989 1333 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-217ENST00000550044 PSME4Q14997 1843 aa12.04□□□□□ -0.48
CS-217ENST00000550044 SNAP23O00161 211 aa12.04□□□□□ -0.48
CS-217ENST00000550044 DLL1O00548 723 aa12.04□□□□□ -0.48
CS-217ENST00000550044 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
CS-217ENST00000550044 TAF5LO75529 589 aa12.04□□□□□ -0.48
CS-217ENST00000550044 EN2P19622 333 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
CS-217ENST00000550044 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
CS-217ENST00000550044 CHRNDQ07001 517 aa12.04□□□□□ -0.48
CS-217ENST00000550044 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
CS-217ENST00000550044 OTOP1Q7RTM1 612 aa12.04□□□□□ -0.48
CS-217ENST00000550044 TMEM57Q8N5G2 664 aa12.04□□□□□ -0.48
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CS-217ENST00000550044 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
CS-217ENST00000550044 CNNM1Q9NRU3 951 aa12.04□□□□□ -0.48
CS-217ENST00000550044 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa12.04□□□□□ -0.48
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CS-217ENST00000550044 LCE2BO14633 110 aa12.03□□□□□ -0.48
CS-217ENST00000550044 TYW1BQ6NUM6 668 aa12.03□□□□□ -0.48
CS-217ENST00000550044 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP12.03□□□□□ -0.48
CS-217ENST00000550044 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
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CS-217ENST00000550044 ANKRD2Q9GZV1 360 aa12.03□□□□□ -0.48
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CS-217ENST00000550044 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
CS-217ENST00000550044 RCAN3Q9UKA8 241 aa12.03□□□□□ -0.48
CS-217ENST00000550044 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
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CS-217ENST00000550044 RLBP1P12271 317 aa12.02□□□□□ -0.49
CS-217ENST00000550044 KCNJ4P48050 445 aa12.02□□□□□ -0.49
CS-217ENST00000550044 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
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CS-217ENST00000550044 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
CS-217ENST00000550044 LRCH3Q96II8 777 aa12.02□□□□□ -0.49
CS-217ENST00000550044 LEMD3Q9Y2U8 911 aa12.02□□□□□ -0.49
CS-217ENST00000550044 ZNF609O15014 1411 aa12.02□□□□□ -0.49
CS-217ENST00000550044 GNAI3P08754 354 aa12.01□□□□□ -0.49
CS-217ENST00000550044 USP17L8P0C7I0 530 aa12.01□□□□□ -0.49
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CS-217ENST00000550044 ITPRIPQ8IWB1 547 aa12□□□□□ -0.49
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CS-217ENST00000550044 PRKD2Q9BZL6 878 aa12□□□□□ -0.49
CS-217ENST00000550044 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
CS-217ENST00000550044 HDAC5Q9UQL6 1122 aa12□□□□□ -0.49
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