RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546969.1

CASP9-211, Transcript of caspase 9, humanhuman

TSL 2

Gene CASP9, Length 569 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9-211ENST00000546969 OPTNQ96CV9 577 aa20.86■□□□□ 0.93
CASP9-211ENST00000546969 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa20.86■□□□□ 0.93
CASP9-211ENST00000546969 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
CASP9-211ENST00000546969 FKTNO75072 461 aa20.85■□□□□ 0.93
CASP9-211ENST00000546969 FAM151AQ8WW52 585 aa20.85■□□□□ 0.93
CASP9-211ENST00000546969 CFHR5Q9BXR6 569 aa20.85■□□□□ 0.93
CASP9-211ENST00000546969 USP40Q9NVE5 1235 aa20.85■□□□□ 0.93
CASP9-211ENST00000546969 TNNQ9UQP3 1299 aa20.85■□□□□ 0.93
CASP9-211ENST00000546969 DIXDC1Q155Q3 683 aa20.84■□□□□ 0.93
CASP9-211ENST00000546969 ERICH6Q7L0X2 663 aa20.84■□□□□ 0.93
CASP9-211ENST00000546969 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
CASP9-211ENST00000546969 ZNF341Q9BYN7 854 aa20.84■□□□□ 0.93
CASP9-211ENST00000546969 AK9Q5TCS8 1911 aa20.84■□□□□ 0.93
CASP9-211ENST00000546969 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa20.83■□□□□ 0.93
CASP9-211ENST00000546969 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa20.83■□□□□ 0.93
CASP9-211ENST00000546969 GTF2A2P52657 109 aa20.83■□□□□ 0.93
CASP9-211ENST00000546969 ATP8B2P98198 1209 aa20.83■□□□□ 0.93
CASP9-211ENST00000546969 RASGRF1Q13972 1273 aa20.83■□□□□ 0.93
CASP9-211ENST00000546969 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa20.83■□□□□ 0.93
CASP9-211ENST00000546969 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP20.83■□□□□ 0.93
CASP9-211ENST00000546969 WRNIP1Q96S55 665 aa20.83■□□□□ 0.93
CASP9-211ENST00000546969 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.92
CASP9-211ENST00000546969 LDHCP07864 332 aa20.82■□□□□ 0.92
CASP9-211ENST00000546969 GSTO1P78417 241 aa20.82■□□□□ 0.92
CASP9-211ENST00000546969 VGLL4Q14135 290 aa20.82■□□□□ 0.92
CASP9-211ENST00000546969 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
CASP9-211ENST00000546969 SURF6O75683 361 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
CASP9-211ENST00000546969 TCP10Q12799 353 aa20.81■□□□□ 0.92
CASP9-211ENST00000546969 CCDC158Q5M9N0 1113 aa20.81■□□□□ 0.92
CASP9-211ENST00000546969 ERO1BQ86YB8 467 aa20.81■□□□□ 0.92
CASP9-211ENST00000546969 CDAN1Q8IWY9 1227 aa20.81■□□□□ 0.92
CASP9-211ENST00000546969 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
CASP9-211ENST00000546969 SPATA5Q8NB90 893 aa20.8■□□□□ 0.92
CASP9-211ENST00000546969 OTUD5Q96G74 571 aa20.8■□□□□ 0.92
CASP9-211ENST00000546969 GPR108Q9NPR9 543 aa20.8■□□□□ 0.92
CASP9-211ENST00000546969 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa20.79■□□□□ 0.92
CASP9-211ENST00000546969 POLA2Q14181 598 aa20.79■□□□□ 0.92
CASP9-211ENST00000546969 ARHGEF6Q15052 776 aa20.79■□□□□ 0.92
CASP9-211ENST00000546969 CCL15Q16663 113 aa20.79■□□□□ 0.92
CASP9-211ENST00000546969 TTC39AQ5SRH9 613 aa20.79■□□□□ 0.92
CASP9-211ENST00000546969 SSH3Q8TE77 659 aa20.79■□□□□ 0.92
CASP9-211ENST00000546969 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
CASP9-211ENST00000546969 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
CASP9-211ENST00000546969 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
CASP9-211ENST00000546969 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP20.78■□□□□ 0.92
CASP9-211ENST00000546969 CETPP11597 493 aa20.78■□□□□ 0.92
CASP9-211ENST00000546969 GJA5P36382 358 aa20.78■□□□□ 0.92
CASP9-211ENST00000546969 SNAPC2Q13487 334 aa20.78■□□□□ 0.92
CASP9-211ENST00000546969 MIGA2Q7L4E1 593 aa20.78■□□□□ 0.92
CASP9-211ENST00000546969 ERO1AQ96HE7 468 aa20.78■□□□□ 0.92
CASP9-211ENST00000546969 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
CASP9-211ENST00000546969 RAI14Q9P0K7 980 aa20.78■□□□□ 0.92
CASP9-211ENST00000546969 MYH2Q9UKX2 1941 aa20.78■□□□□ 0.92
CASP9-211ENST00000546969 SPDYE5A6NIY4 337 aa20.77■□□□□ 0.92
CASP9-211ENST00000546969 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
CASP9-211ENST00000546969 ENTPD3O75355 529 aa20.77■□□□□ 0.92
CASP9-211ENST00000546969 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
CASP9-211ENST00000546969 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
CASP9-211ENST00000546969 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
CASP9-211ENST00000546969 C1orf115Q9H7X2 142 aa20.77■□□□□ 0.92
CASP9-211ENST00000546969 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa20.77■□□□□ 0.92
CASP9-211ENST00000546969 HMG20BQ9P0W2 317 aa20.77■□□□□ 0.92
CASP9-211ENST00000546969 LRP2BPQ9P2M1 347 aa20.77■□□□□ 0.92
CASP9-211ENST00000546969 GAKO14976 1311 aa20.77■□□□□ 0.91
CASP9-211ENST00000546969 BTDP43251 543 aa20.76■□□□□ 0.91
CASP9-211ENST00000546969 NFIAQ12857 509 aa20.76■□□□□ 0.91
CASP9-211ENST00000546969 ERC1Q8IUD2 1116 aa20.76■□□□□ 0.91
CASP9-211ENST00000546969 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
CASP9-211ENST00000546969 IDI2Q9BXS1 227 aa20.76■□□□□ 0.91
CASP9-211ENST00000546969 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa20.76■□□□□ 0.91
CASP9-211ENST00000546969 RLBP1P12271 317 aa20.75■□□□□ 0.91
CASP9-211ENST00000546969 RGS3P49796 1198 aa20.75■□□□□ 0.91
CASP9-211ENST00000546969 MECOMQ03112 1051 aa20.75■□□□□ 0.91
CASP9-211ENST00000546969 PPATQ06203 517 aa20.75■□□□□ 0.91
CASP9-211ENST00000546969 CRHR2Q13324 411 aa20.75■□□□□ 0.91
CASP9-211ENST00000546969 PPIL2Q13356 520 aa20.75■□□□□ 0.91
CASP9-211ENST00000546969 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
CASP9-211ENST00000546969 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa20.75■□□□□ 0.91
CASP9-211ENST00000546969 TNNI3KQ59H18 835 aa20.75■□□□□ 0.91
CASP9-211ENST00000546969 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
CASP9-211ENST00000546969 MS4A4AQ96JQ5 239 aa20.75■□□□□ 0.91
CASP9-211ENST00000546969 FAM198AQ9UFP1 575 aa20.75■□□□□ 0.91
CASP9-211ENST00000546969 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa20.75■□□□□ 0.91
CASP9-211ENST00000546969 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa20.75■□□□□ 0.91
CASP9-211ENST00000546969 OTOFQ9HC10 1997 aa20.74■□□□□ 0.91
CASP9-211ENST00000546969 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa20.74■□□□□ 0.91
CASP9-211ENST00000546969 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
CASP9-211ENST00000546969 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa20.73■□□□□ 0.91
CASP9-211ENST00000546969 IGSF3O75054 1194 aa20.73■□□□□ 0.91
CASP9-211ENST00000546969 SP3Q02447 781 aa20.73■□□□□ 0.91
CASP9-211ENST00000546969 PICALMQ13492 652 aa20.73■□□□□ 0.91
CASP9-211ENST00000546969 BRI3BPQ8WY22 251 aa20.73■□□□□ 0.91
CASP9-211ENST00000546969 PTPN18Q99952 460 aa20.73■□□□□ 0.91
CASP9-211ENST00000546969 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa20.73■□□□□ 0.91
CASP9-211ENST00000546969 PICK1Q9NRD5 415 aa20.73■□□□□ 0.91
CASP9-211ENST00000546969 HPS5Q9UPZ3 1129 aa20.73■□□□□ 0.91
CASP9-211ENST00000546969 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
CASP9-211ENST00000546969 TRIM17Q9Y577 477 aa20.73■□□□□ 0.91
CASP9-211ENST00000546969 BAG3O95817 575 aa20.72■□□□□ 0.91
CASP9-211ENST00000546969 INPP5BP32019 993 aa20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms