RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531385.1

PTPRU-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 737 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-211ENST00000531385 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRU-211ENST00000531385 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
PTPRU-211ENST00000531385 ERC1Q8IUD2 1116 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRU-211ENST00000531385 RHPN1Q8TCX5 695 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRU-211ENST00000531385 CCDC102AQ96A19 550 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRU-211ENST00000531385 CLMNQ96JQ2 1002 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRU-211ENST00000531385 TNNI2P48788 182 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRU-211ENST00000531385 MECOMQ03112 1051 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRU-211ENST00000531385 NFIAQ12857 509 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRU-211ENST00000531385 CCDC158Q5M9N0 1113 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRU-211ENST00000531385 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRU-211ENST00000531385 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
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PTPRU-211ENST00000531385 TCP10Q12799 353 aa23■■□□□ 1.27
PTPRU-211ENST00000531385 LDLRAD1Q5T700 205 aa23■■□□□ 1.27
PTPRU-211ENST00000531385 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
PTPRU-211ENST00000531385 USP40Q9NVE5 1235 aa23■■□□□ 1.27
PTPRU-211ENST00000531385 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa23■■□□□ 1.27
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PTPRU-211ENST00000531385 USP2O75604 605 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
PTPRU-211ENST00000531385 ZAP70P43403 619 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRU-211ENST00000531385 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
PTPRU-211ENST00000531385 LBX1P52954 281 aa22.99■■□□□ 1.27
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PTPRU-211ENST00000531385 RAI14Q9P0K7 980 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRU-211ENST00000531385 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa22.99■■□□□ 1.27
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PTPRU-211ENST00000531385 BTDP43251 543 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRU-211ENST00000531385 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.98■■□□□ 1.27
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PTPRU-211ENST00000531385 FAM198AQ9UFP1 575 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRU-211ENST00000531385 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
PTPRU-211ENST00000531385 MAP3K11Q16584 847 aa22.97■■□□□ 1.27
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PTPRU-211ENST00000531385 CRBNQ96SW2 442 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRU-211ENST00000531385 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PTPRU-211ENST00000531385 LRP2BPQ9P2M1 347 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRU-211ENST00000531385 AK9Q5TCS8 1911 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRU-211ENST00000531385 FKBP1CQ5VVH2 108 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRU-211ENST00000531385 FAM83AQ86UY5 434 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRU-211ENST00000531385 CSRNP1Q96S65 589 aa22.96■■□□□ 1.27
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PTPRU-211ENST00000531385 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
PTPRU-211ENST00000531385 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PTPRU-211ENST00000531385 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PTPRU-211ENST00000531385 RGS3P49796 1198 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRU-211ENST00000531385 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
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PTPRU-211ENST00000531385 SLC10A4Q96EP9 437 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRU-211ENST00000531385 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
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PTPRU-211ENST00000531385 SLF2Q8IX21 1173 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRU-211ENST00000531385 ANTXR1Q9H6X2 564 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRU-211ENST00000531385 ELP3Q9H9T3 547 aa22.93■■□□□ 1.26
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PTPRU-211ENST00000531385 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa22.92■■□□□ 1.26
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PTPRU-211ENST00000531385 PICALMQ13492 652 aa22.92■■□□□ 1.26
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PTPRU-211ENST00000531385 SLURP2P0DP57 97 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRU-211ENST00000531385 GSTO1P78417 241 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRU-211ENST00000531385 VGLL4Q14135 290 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRU-211ENST00000531385 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PTPRU-211ENST00000531385 ADGRA1Q86SQ6 560 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRU-211ENST00000531385 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRU-211ENST00000531385 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP22.91■■□□□ 1.26
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PTPRU-211ENST00000531385 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRU-211ENST00000531385 WRNIP1Q96S55 665 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRU-211ENST00000531385 IDI2Q9BXS1 227 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRU-211ENST00000531385 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRU-211ENST00000531385 RNF186Q9NXI6 227 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRU-211ENST00000531385 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa22.89■■□□□ 1.26
PTPRU-211ENST00000531385 IDH1O75874 414 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
PTPRU-211ENST00000531385 LDHCP07864 332 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRU-211ENST00000531385 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
PTPRU-211ENST00000531385 CA12O43570 354 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRU-211ENST00000531385 MAP3K9P80192 1104 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRU-211ENST00000531385 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
PTPRU-211ENST00000531385 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
PTPRU-211ENST00000531385 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRU-211ENST00000531385 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP22.88■■□□□ 1.25
PTPRU-211ENST00000531385 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
PTPRU-211ENST00000531385 INPP5BP32019 993 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRU-211ENST00000531385 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
PTPRU-211ENST00000531385 TEX11Q8IYF3 940 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRU-211ENST00000531385 OPTNQ96CV9 577 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRU-211ENST00000531385 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
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