RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515147.1

ITGA3-215, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene ITGA3, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-215ENST00000515147 FAM83AQ86UY5 434 aa22.59■■□□□ 1.21
ITGA3-215ENST00000515147 AK9Q5TCS8 1911 aa22.59■■□□□ 1.21
ITGA3-215ENST00000515147 MGAMO43451 1857 aa22.58■■□□□ 1.21
ITGA3-215ENST00000515147 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
ITGA3-215ENST00000515147 SLFN5Q08AF3 891 aa22.58■■□□□ 1.21
ITGA3-215ENST00000515147 PPIL2Q13356 520 aa22.58■■□□□ 1.21
ITGA3-215ENST00000515147 SNAPC2Q13487 334 aa22.58■■□□□ 1.21
ITGA3-215ENST00000515147 SHISA4Q96DD7 197 aa22.58■■□□□ 1.21
ITGA3-215ENST00000515147 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa22.58■■□□□ 1.21
ITGA3-215ENST00000515147 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
ITGA3-215ENST00000515147 H0YGN5 161 aa22.57■■□□□ 1.2
ITGA3-215ENST00000515147 FKBP1CQ5VVH2 108 aa22.57■■□□□ 1.2
ITGA3-215ENST00000515147 C17orf99Q6UX52 265 aa22.57■■□□□ 1.2
ITGA3-215ENST00000515147 TMOD2Q9NZR1 351 aa22.57■■□□□ 1.2
ITGA3-215ENST00000515147 MAST3O60307 1309 aa22.57■■□□□ 1.2
ITGA3-215ENST00000515147 ADGRA2Q96PE1 1338 aa22.57■■□□□ 1.2
ITGA3-215ENST00000515147 EYA2O00167 538 aa22.56■■□□□ 1.2
ITGA3-215ENST00000515147 INPP5BP32019 993 aa22.56■■□□□ 1.2
ITGA3-215ENST00000515147 HHIPL2Q6UWX4 724 aa22.56■■□□□ 1.2
ITGA3-215ENST00000515147 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
ITGA3-215ENST00000515147 KIF22Q14807 665 aa22.55■■□□□ 1.2
ITGA3-215ENST00000515147 MTFR1Q15390 333 aa22.55■■□□□ 1.2
ITGA3-215ENST00000515147 ALDH1L2Q3SY69 923 aa22.55■■□□□ 1.2
ITGA3-215ENST00000515147 GNRH1P01148 92 aa22.54■■□□□ 1.2
ITGA3-215ENST00000515147 SLC5A1P13866 664 aa22.54■■□□□ 1.2
ITGA3-215ENST00000515147 MIGA2Q7L4E1 593 aa22.54■■□□□ 1.2
ITGA3-215ENST00000515147 ATG9AQ7Z3C6 839 aa22.54■■□□□ 1.2
ITGA3-215ENST00000515147 LPIN2Q92539 896 aa22.54■■□□□ 1.2
ITGA3-215ENST00000515147 TRIM47Q96LD4 638 aa22.54■■□□□ 1.2
ITGA3-215ENST00000515147 CPA4Q9UI42 421 aa22.54■■□□□ 1.2
ITGA3-215ENST00000515147 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
ITGA3-215ENST00000515147 PRMT2P55345 433 aa22.53■■□□□ 1.2
ITGA3-215ENST00000515147 PPATQ06203 517 aa22.53■■□□□ 1.2
ITGA3-215ENST00000515147 MOGSQ13724 837 aa22.53■■□□□ 1.2
ITGA3-215ENST00000515147 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
ITGA3-215ENST00000515147 WDR66Q8TBY9 1149 aa22.53■■□□□ 1.2
ITGA3-215ENST00000515147 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.53■■□□□ 1.2
ITGA3-215ENST00000515147 DCAF15Q66K64 600 aa22.52■■□□□ 1.2
ITGA3-215ENST00000515147 ANKRD23Q86SG2 305 aa22.52■■□□□ 1.2
ITGA3-215ENST00000515147 HOOK2Q96ED9 719 aa22.52■■□□□ 1.2
ITGA3-215ENST00000515147 ZNF341Q9BYN7 854 aa22.52■■□□□ 1.2
ITGA3-215ENST00000515147 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.52■■□□□ 1.2
ITGA3-215ENST00000515147 SRRDQ9UH36 339 aa22.52■■□□□ 1.2
ITGA3-215ENST00000515147 ZNF112Q9UJU3 913 aa22.52■■□□□ 1.2
ITGA3-215ENST00000515147 KCNH4Q9UQ05 1017 aa22.52■■□□□ 1.2
ITGA3-215ENST00000515147 SZT2Q5T011 3432 aa22.51■■□□□ 1.19
ITGA3-215ENST00000515147 PTPRFP10586 1907 aa22.51■■□□□ 1.19
ITGA3-215ENST00000515147 PSMC4P43686 418 aa22.51■■□□□ 1.19
ITGA3-215ENST00000515147 DOCK2Q92608 1830 aa22.51■■□□□ 1.19
ITGA3-215ENST00000515147 OSBPP22059 807 aa22.5■■□□□ 1.19
ITGA3-215ENST00000515147 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa22.5■■□□□ 1.19
ITGA3-215ENST00000515147 FAM151AQ8WW52 585 aa22.5■■□□□ 1.19
ITGA3-215ENST00000515147 SIL1Q9H173 461 aa22.5■■□□□ 1.19
ITGA3-215ENST00000515147 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa22.5■■□□□ 1.19
ITGA3-215ENST00000515147 PDHXO00330 501 aa22.49■■□□□ 1.19
ITGA3-215ENST00000515147 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
ITGA3-215ENST00000515147 FBXO3Q9UK99 471 aa22.49■■□□□ 1.19
ITGA3-215ENST00000515147 MYH2Q9UKX2 1941 aa22.49■■□□□ 1.19
ITGA3-215ENST00000515147 PHIPQ8WWQ0 1821 aa22.48■■□□□ 1.19
ITGA3-215ENST00000515147 CIAO1O76071 339 aa22.48■■□□□ 1.19
ITGA3-215ENST00000515147 PRDX5P30044 214 aa22.48■■□□□ 1.19
ITGA3-215ENST00000515147 NFIAQ12857 509 aa22.48■■□□□ 1.19
ITGA3-215ENST00000515147 DIXDC1Q155Q3 683 aa22.48■■□□□ 1.19
ITGA3-215ENST00000515147 ATP2B3Q16720 1220 aa22.48■■□□□ 1.19
ITGA3-215ENST00000515147 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa22.48■■□□□ 1.19
ITGA3-215ENST00000515147 CHRDL2Q6WN34 429 aa22.48■■□□□ 1.19
ITGA3-215ENST00000515147 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
ITGA3-215ENST00000515147 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.48■■□□□ 1.19
ITGA3-215ENST00000515147 GRK4P32298 578 aa22.47■■□□□ 1.19
ITGA3-215ENST00000515147 TCP10Q12799 353 aa22.47■■□□□ 1.19
ITGA3-215ENST00000515147 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
ITGA3-215ENST00000515147 GPAT2Q6NUI2 795 aa22.47■■□□□ 1.19
ITGA3-215ENST00000515147 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
ITGA3-215ENST00000515147 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
ITGA3-215ENST00000515147 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
ITGA3-215ENST00000515147 FAM198AQ9UFP1 575 aa22.46■■□□□ 1.19
ITGA3-215ENST00000515147 MYPNQ86TC9 1320 aa22.46■■□□□ 1.19
ITGA3-215ENST00000515147 DOCK3Q8IZD9 2030 aa22.46■■□□□ 1.19
ITGA3-215ENST00000515147 LDHBP07195 334 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
ITGA3-215ENST00000515147 BCRP11274 1271 aa22.45■■□□□ 1.18
ITGA3-215ENST00000515147 CCL5P13501 91 aa22.45■■□□□ 1.18
ITGA3-215ENST00000515147 GJA8P48165 433 aa22.45■■□□□ 1.18
ITGA3-215ENST00000515147 ZFPM1Q8IX07 1006 aa22.45■■□□□ 1.18
ITGA3-215ENST00000515147 RAET1EQ8TD07 263 aa22.45■■□□□ 1.18
ITGA3-215ENST00000515147 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
ITGA3-215ENST00000515147 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
ITGA3-215ENST00000515147 ATRNL1Q5VV63 1379 aa22.45■■□□□ 1.18
ITGA3-215ENST00000515147 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
ITGA3-215ENST00000515147 GJB1P08034 283 aa22.44■■□□□ 1.18
ITGA3-215ENST00000515147 PHKA1P46020 1223 aa22.44■■□□□ 1.18
ITGA3-215ENST00000515147 PRO3102Q9H379 93 aa22.44■■□□□ 1.18
ITGA3-215ENST00000515147 SALL1Q9NSC2 1324 aa22.44■■□□□ 1.18
ITGA3-215ENST00000515147 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
ITGA3-215ENST00000515147 ALPK3Q96L96 1907 aa22.43■■□□□ 1.18
ITGA3-215ENST00000515147 DOCK1Q14185 1865 aa22.43■■□□□ 1.18
ITGA3-215ENST00000515147 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
ITGA3-215ENST00000515147 CYP2C8P10632 490 aa22.43■■□□□ 1.18
ITGA3-215ENST00000515147 HOXD10P28358 340 aa22.43■■□□□ 1.18
ITGA3-215ENST00000515147 IL15P40933 162 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
ITGA3-215ENST00000515147 PRKCZQ05513 592 aa22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms