RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 PTPN22Q9Y2R2 807 aa21.05■□□□□ 0.96
HERC3-211ENST00000513325 LDHBP07195 334 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
HERC3-211ENST00000513325 ADORA1P30542 326 aa21.04■□□□□ 0.96
HERC3-211ENST00000513325 CAP1Q01518 475 aa21.04■□□□□ 0.96
HERC3-211ENST00000513325 TCP10Q12799 353 aa21.04■□□□□ 0.96
HERC3-211ENST00000513325 DCAF15Q66K64 600 aa21.04■□□□□ 0.96
HERC3-211ENST00000513325 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
HERC3-211ENST00000513325 EFCC1Q9HA90 598 aa21.04■□□□□ 0.96
HERC3-211ENST00000513325 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa21.04■□□□□ 0.96
HERC3-211ENST00000513325 DENND2AQ9ULE3 1009 aa21.04■□□□□ 0.96
HERC3-211ENST00000513325 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
HERC3-211ENST00000513325 NFIAQ12857 509 aa21.03■□□□□ 0.96
HERC3-211ENST00000513325 FAM151AQ8WW52 585 aa21.03■□□□□ 0.96
HERC3-211ENST00000513325 ARHGAP45Q92619 1136 aa21.03■□□□□ 0.96
HERC3-211ENST00000513325 ZNF341Q9BYN7 854 aa21.03■□□□□ 0.96
HERC3-211ENST00000513325 SALL1Q9NSC2 1324 aa21.03■□□□□ 0.96
HERC3-211ENST00000513325 IRF6O14896 467 aa21.02■□□□□ 0.96
HERC3-211ENST00000513325 SEMA3EO15041 775 aa21.02■□□□□ 0.96
HERC3-211ENST00000513325 CETPP11597 493 aa21.02■□□□□ 0.96
HERC3-211ENST00000513325 CCDC102BQ68D86 513 aa21.02■□□□□ 0.96
HERC3-211ENST00000513325 GNAI3P08754 354 aa21.01■□□□□ 0.95
HERC3-211ENST00000513325 INPP5BP32019 993 aa21.01■□□□□ 0.95
HERC3-211ENST00000513325 TIMM10P62072 90 aa21.01■□□□□ 0.95
HERC3-211ENST00000513325 PPIL2Q13356 520 aa21.01■□□□□ 0.95
HERC3-211ENST00000513325 USP40Q9NVE5 1235 aa21.01■□□□□ 0.95
HERC3-211ENST00000513325 SRGAP3O43295 1099 aa21■□□□□ 0.95
HERC3-211ENST00000513325 SLC34A2O95436 690 aa21■□□□□ 0.95
HERC3-211ENST00000513325 SNAPC2Q13487 334 aa21■□□□□ 0.95
HERC3-211ENST00000513325 FAM198AQ9UFP1 575 aa21■□□□□ 0.95
HERC3-211ENST00000513325 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa20.99■□□□□ 0.95
HERC3-211ENST00000513325 BTBD19C9JJ37 291 aa20.99■□□□□ 0.95
HERC3-211ENST00000513325 PPATQ06203 517 aa20.99■□□□□ 0.95
HERC3-211ENST00000513325 A0A1B0GUL7 405 aa20.98■□□□□ 0.95
HERC3-211ENST00000513325 ZBTB22O15209 634 aa20.98■□□□□ 0.95
HERC3-211ENST00000513325 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
HERC3-211ENST00000513325 TFCP2Q12800 502 aa20.98■□□□□ 0.95
HERC3-211ENST00000513325 MTX1Q13505 466 aa20.98■□□□□ 0.95
HERC3-211ENST00000513325 RASGRF1Q13972 1273 aa20.98■□□□□ 0.95
HERC3-211ENST00000513325 ZFPM1Q8IX07 1006 aa20.98■□□□□ 0.95
HERC3-211ENST00000513325 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
HERC3-211ENST00000513325 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
HERC3-211ENST00000513325 ZNF112Q9UJU3 913 aa20.98■□□□□ 0.95
HERC3-211ENST00000513325 TNNQ9UQP3 1299 aa20.98■□□□□ 0.95
HERC3-211ENST00000513325 POTEFA5A3E0 1075 aa20.97■□□□□ 0.95
HERC3-211ENST00000513325 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
HERC3-211ENST00000513325 TLR2O60603 784 aa20.97■□□□□ 0.95
HERC3-211ENST00000513325 TRIM27P14373 513 aa20.97■□□□□ 0.95
HERC3-211ENST00000513325 ARHGEF6Q15052 776 aa20.97■□□□□ 0.95
HERC3-211ENST00000513325 ARMC5Q96C12 935 aa20.97■□□□□ 0.95
HERC3-211ENST00000513325 XAGE2Q96GT9 111 aa20.97■□□□□ 0.95
HERC3-211ENST00000513325 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
HERC3-211ENST00000513325 ABCF2Q9UG63 623 aa20.97■□□□□ 0.95
HERC3-211ENST00000513325 AKAP2Q9Y2D5 859 aa20.97■□□□□ 0.95
HERC3-211ENST00000513325 BCAR3O75815 825 aa20.96■□□□□ 0.95
HERC3-211ENST00000513325 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
HERC3-211ENST00000513325 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
HERC3-211ENST00000513325 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
HERC3-211ENST00000513325 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
HERC3-211ENST00000513325 GAKO14976 1311 aa20.96■□□□□ 0.95
HERC3-211ENST00000513325 RGS3P49796 1198 aa20.95■□□□□ 0.94
HERC3-211ENST00000513325 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa20.95■□□□□ 0.94
HERC3-211ENST00000513325 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
HERC3-211ENST00000513325 AK9Q5TCS8 1911 aa20.94■□□□□ 0.94
HERC3-211ENST00000513325 HTTP42858 3142 aa20.94■□□□□ 0.94
HERC3-211ENST00000513325 MVPQ14764 893 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
HERC3-211ENST00000513325 CLUAP1Q96AJ1 413 aa20.94■□□□□ 0.94
HERC3-211ENST00000513325 NEUROD6Q96NK8 337 aa20.94■□□□□ 0.94
HERC3-211ENST00000513325 IDI2Q9BXS1 227 aa20.94■□□□□ 0.94
HERC3-211ENST00000513325 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa20.94■□□□□ 0.94
HERC3-211ENST00000513325 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa20.94■□□□□ 0.94
HERC3-211ENST00000513325 ENTPD3O75355 529 aa20.93■□□□□ 0.94
HERC3-211ENST00000513325 GNAI2P04899 355 aa20.93■□□□□ 0.94
HERC3-211ENST00000513325 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
HERC3-211ENST00000513325 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
HERC3-211ENST00000513325 SLF2Q8IX21 1173 aa20.93■□□□□ 0.94
HERC3-211ENST00000513325 KCNH4Q9UQ05 1017 aa20.93■□□□□ 0.94
HERC3-211ENST00000513325 MYH2Q9UKX2 1941 aa20.92■□□□□ 0.94
HERC3-211ENST00000513325 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
HERC3-211ENST00000513325 KIF22Q14807 665 aa20.92■□□□□ 0.94
HERC3-211ENST00000513325 ANKRD23Q86SG2 305 aa20.92■□□□□ 0.94
HERC3-211ENST00000513325 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
HERC3-211ENST00000513325 ATRNL1Q5VV63 1379 aa20.92■□□□□ 0.94
HERC3-211ENST00000513325 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa20.91■□□□□ 0.94
HERC3-211ENST00000513325 PHF20L1A8MW92 1017 aa20.91■□□□□ 0.94
HERC3-211ENST00000513325 PDHXO00330 501 aa20.91■□□□□ 0.94
HERC3-211ENST00000513325 BTDP43251 543 aa20.91■□□□□ 0.94
HERC3-211ENST00000513325 MOGSQ13724 837 aa20.91■□□□□ 0.94
HERC3-211ENST00000513325 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa20.91■□□□□ 0.94
HERC3-211ENST00000513325 C17orf99Q6UX52 265 aa20.91■□□□□ 0.94
HERC3-211ENST00000513325 ERICH6Q7L0X2 663 aa20.91■□□□□ 0.94
HERC3-211ENST00000513325 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa20.91■□□□□ 0.94
HERC3-211ENST00000513325 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
HERC3-211ENST00000513325 ZNF333Q96JL9 665 aa20.91■□□□□ 0.94
HERC3-211ENST00000513325 CPA4Q9UI42 421 aa20.91■□□□□ 0.94
HERC3-211ENST00000513325 RFX7Q2KHR2 1363 aa20.9■□□□□ 0.94
HERC3-211ENST00000513325 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa20.9■□□□□ 0.94
HERC3-211ENST00000513325 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
HERC3-211ENST00000513325 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
HERC3-211ENST00000513325 EN2P19622 333 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
HERC3-211ENST00000513325 MECOMQ03112 1051 aa20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms