RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC102AQ96A19 550 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP2-218ENST00000511185 CLMNQ96JQ2 1002 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP2-218ENST00000511185 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP2-218ENST00000511185 SNRKQ9NRH2 765 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP2-218ENST00000511185 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
SH3BP2-218ENST00000511185 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
SH3BP2-218ENST00000511185 LBX1P52954 281 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP2-218ENST00000511185 RRP1P56182 461 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
SH3BP2-218ENST00000511185 NFIAQ12857 509 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP2-218ENST00000511185 TTC39AQ5SRH9 613 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP2-218ENST00000511185 ARMC9Q7Z3E5 817 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP2-218ENST00000511185 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
SH3BP2-218ENST00000511185 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2-218ENST00000511185 MECOMQ03112 1051 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2-218ENST00000511185 MAP3K11Q16584 847 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2-218ENST00000511185 LDLRAD1Q5T700 205 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2-218ENST00000511185 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2-218ENST00000511185 TMOD2Q9NZR1 351 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2-218ENST00000511185 DOCK1Q14185 1865 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-218ENST00000511185 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-218ENST00000511185 TNNI2P48788 182 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-218ENST00000511185 AACSQ86V21 672 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-218ENST00000511185 RHPN1Q8TCX5 695 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-218ENST00000511185 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-218ENST00000511185 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-218ENST00000511185 USP2O75604 605 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
SH3BP2-218ENST00000511185 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BP2-218ENST00000511185 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BP2-218ENST00000511185 ERC1Q8IUD2 1116 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM198AQ9UFP1 575 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BP2-218ENST00000511185 BTDP43251 543 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP2-218ENST00000511185 TCP10Q12799 353 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP2-218ENST00000511185 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
SH3BP2-218ENST00000511185 PHIPQ8WWQ0 1821 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP2-218ENST00000511185 NAV1Q8NEY1 1877 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP2-218ENST00000511185 PTPRFP10586 1907 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP2-218ENST00000511185 MYH1P12882 1939 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP2-218ENST00000511185 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2-218ENST00000511185 HMMRO75330 724 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2-218ENST00000511185 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2-218ENST00000511185 ZAP70P43403 619 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC158Q5M9N0 1113 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM83AQ86UY5 434 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2-218ENST00000511185 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2-218ENST00000511185 CSRNP1Q96S65 589 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2-218ENST00000511185 BEGAINQ9BUH8 593 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2-218ENST00000511185 BCL11AQ9H165 835 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2-218ENST00000511185 USP40Q9NVE5 1235 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2-218ENST00000511185 FKBP1CQ5VVH2 108 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2-218ENST00000511185 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2-218ENST00000511185 ZFPM1Q8IX07 1006 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2-218ENST00000511185 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2-218ENST00000511185 RAI14Q9P0K7 980 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2-218ENST00000511185 GJA5P36382 358 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-218ENST00000511185 IREB2P48200 963 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-218ENST00000511185 WNK4Q96J92 1243 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-218ENST00000511185 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-218ENST00000511185 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-218ENST00000511185 ATRNL1Q5VV63 1379 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP2-218ENST00000511185 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SH3BP2-218ENST00000511185 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP2-218ENST00000511185 SPRYD7Q5W111 196 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP2-218ENST00000511185 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SH3BP2-218ENST00000511185 ADGRA1Q86SQ6 560 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP2-218ENST00000511185 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.26
SH3BP2-218ENST00000511185 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP2-218ENST00000511185 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SH3BP2-218ENST00000511185 ELP3Q9H9T3 547 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP2-218ENST00000511185 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP2-218ENST00000511185 RGS3P49796 1198 aa22.91■■□□□ 1.26
SH3BP2-218ENST00000511185 RHBDL3P58872 404 aa22.91■■□□□ 1.26
SH3BP2-218ENST00000511185 VGLL4Q14135 290 aa22.91■■□□□ 1.26
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM151AQ8WW52 585 aa22.91■■□□□ 1.26
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
SH3BP2-218ENST00000511185 RNF186Q9NXI6 227 aa22.91■■□□□ 1.26
SH3BP2-218ENST00000511185 LRP2BPQ9P2M1 347 aa22.91■■□□□ 1.26
SH3BP2-218ENST00000511185 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa22.9■■□□□ 1.26
SH3BP2-218ENST00000511185 SLURP2P0DP57 97 aa22.9■■□□□ 1.26
SH3BP2-218ENST00000511185 PICALMQ13492 652 aa22.9■■□□□ 1.26
SH3BP2-218ENST00000511185 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa22.9■■□□□ 1.26
SH3BP2-218ENST00000511185 CRBNQ96SW2 442 aa22.9■■□□□ 1.26
SH3BP2-218ENST00000511185 ANTXR1Q9H6X2 564 aa22.9■■□□□ 1.26
SH3BP2-218ENST00000511185 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
SH3BP2-218ENST00000511185 TRPA1O75762 1119 aa22.89■■□□□ 1.25
SH3BP2-218ENST00000511185 MIGA2Q7L4E1 593 aa22.89■■□□□ 1.25
SH3BP2-218ENST00000511185 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa22.89■■□□□ 1.25
SH3BP2-218ENST00000511185 IDI2Q9BXS1 227 aa22.89■■□□□ 1.25
SH3BP2-218ENST00000511185 CA12O43570 354 aa22.88■■□□□ 1.25
SH3BP2-218ENST00000511185 SLF2Q8IX21 1173 aa22.88■■□□□ 1.25
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC10A4Q96EP9 437 aa22.88■■□□□ 1.25
SH3BP2-218ENST00000511185 WRNIP1Q96S55 665 aa22.88■■□□□ 1.25
SH3BP2-218ENST00000511185 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.88■■□□□ 1.25
SH3BP2-218ENST00000511185 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa22.88■■□□□ 1.25
SH3BP2-218ENST00000511185 TNS4Q8IZW8 715 aa22.87■■□□□ 1.25
SH3BP2-218ENST00000511185 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
SH3BP2-218ENST00000511185 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
SH3BP2-218ENST00000511185 OPTNQ96CV9 577 aa22.87■■□□□ 1.25
SH3BP2-218ENST00000511185 SAGE1Q9NXZ1 904 aa22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.1 ms