RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510195.1

SNF8-208, Transcript of SNF8, ESCRT-II complex subunit, human

TSL 2

Gene SNF8, Length 445 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNF8-208	ENST00000510195	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		33.01	■■■□□ 2.87
SNF8-208	ENST00000510195		A0A1B0GUL7	405 aa		33	■■■□□ 2.87
SNF8-208	ENST00000510195	ADORA1	P30542	326 aa		33	■■■□□ 2.87
SNF8-208	ENST00000510195	GTF2A2	P52657	109 aa		33	■■■□□ 2.87
SNF8-208	ENST00000510195	TFCP2	Q12800	502 aa		33	■■■□□ 2.87
SNF8-208	ENST00000510195	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	33	■■■□□ 2.87
SNF8-208	ENST00000510195	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		33	■■■□□ 2.87
SNF8-208	ENST00000510195	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		33	■■■□□ 2.87
SNF8-208	ENST00000510195	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		33	■■■□□ 2.87
SNF8-208	ENST00000510195	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	32.98	■■■□□ 2.87
SNF8-208	ENST00000510195	XAGE2	Q96GT9	111 aa		32.98	■■■□□ 2.87
SNF8-208	ENST00000510195	PTPN18	Q99952	460 aa		32.98	■■■□□ 2.87
SNF8-208	ENST00000510195	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		32.98	■■■□□ 2.87
SNF8-208	ENST00000510195	TNN	Q9UQP3	1299 aa		32.98	■■■□□ 2.87
SNF8-208	ENST00000510195	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		32.97	■■■□□ 2.87
SNF8-208	ENST00000510195	RASGRF1	Q13972	1273 aa		32.97	■■■□□ 2.87
SNF8-208	ENST00000510195	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	32.97	■■■□□ 2.87
SNF8-208	ENST00000510195	SLF2	Q8IX21	1173 aa		32.97	■■■□□ 2.87
SNF8-208	ENST00000510195	WRNIP1	Q96S55	665 aa		32.97	■■■□□ 2.87
SNF8-208	ENST00000510195	ERO1B	Q86YB8	467 aa		32.96	■■■□□ 2.87
SNF8-208	ENST00000510195	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		32.96	■■■□□ 2.87
SNF8-208	ENST00000510195	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		32.96	■■■□□ 2.87
SNF8-208	ENST00000510195	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	32.95	■■■□□ 2.87
SNF8-208	ENST00000510195	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	32.95	■■■□□ 2.87
SNF8-208	ENST00000510195	USP40	Q9NVE5	1235 aa		32.95	■■■□□ 2.87
SNF8-208	ENST00000510195	CRHR2	Q13324	411 aa		32.94	■■■□□ 2.86
SNF8-208	ENST00000510195	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		32.94	■■■□□ 2.86
SNF8-208	ENST00000510195	OTUD5	Q96G74	571 aa		32.94	■■■□□ 2.86
SNF8-208	ENST00000510195	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		32.94	■■■□□ 2.86
SNF8-208	ENST00000510195	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		32.93	■■■□□ 2.86
SNF8-208	ENST00000510195	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		32.93	■■■□□ 2.86
SNF8-208	ENST00000510195	ERO1A	Q96HE7	468 aa		32.93	■■■□□ 2.86
SNF8-208	ENST00000510195	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		32.93	■■■□□ 2.86
SNF8-208	ENST00000510195	GAK	O14976	1311 aa		32.93	■■■□□ 2.86
SNF8-208	ENST00000510195	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		32.92	■■■□□ 2.86
SNF8-208	ENST00000510195	CCL15	Q16663	113 aa		32.92	■■■□□ 2.86
SNF8-208	ENST00000510195	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	32.92	■■■□□ 2.86
SNF8-208	ENST00000510195	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	32.92	■■■□□ 2.86
SNF8-208	ENST00000510195	IDI2	Q9BXS1	227 aa		32.92	■■■□□ 2.86
SNF8-208	ENST00000510195	ABCF2	Q9UG63	623 aa		32.92	■■■□□ 2.86
SNF8-208	ENST00000510195	NFIA	Q12857	509 aa		32.91	■■■□□ 2.86
SNF8-208	ENST00000510195	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	32.91	■■■□□ 2.86
SNF8-208	ENST00000510195	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		32.91	■■■□□ 2.86
SNF8-208	ENST00000510195	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		32.91	■■■□□ 2.86
SNF8-208	ENST00000510195	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		32.9	■■■□□ 2.86
SNF8-208	ENST00000510195	CETP	P11597	493 aa		32.9	■■■□□ 2.86
SNF8-208	ENST00000510195	PPAT	Q06203	517 aa		32.9	■■■□□ 2.86
SNF8-208	ENST00000510195	TCP10	Q12799	353 aa		32.9	■■■□□ 2.86
SNF8-208	ENST00000510195	PPIL2	Q13356	520 aa		32.9	■■■□□ 2.86
SNF8-208	ENST00000510195	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		32.9	■■■□□ 2.86
SNF8-208	ENST00000510195	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	32.9	■■■□□ 2.86
SNF8-208	ENST00000510195	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		32.9	■■■□□ 2.86
SNF8-208	ENST00000510195	ENTPD3	O75355	529 aa		32.89	■■■□□ 2.86
SNF8-208	ENST00000510195	SNAPC2	Q13487	334 aa		32.89	■■■□□ 2.86
SNF8-208	ENST00000510195	POLA2	Q14181	598 aa		32.89	■■■□□ 2.86
SNF8-208	ENST00000510195	GORAB	Q5T7V8	394 aa		32.89	■■■□□ 2.86
SNF8-208	ENST00000510195	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		32.89	■■■□□ 2.86
SNF8-208	ENST00000510195	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	32.89	■■■□□ 2.86
SNF8-208	ENST00000510195	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	32.88	■■■□□ 2.85
SNF8-208	ENST00000510195	SP3	Q02447	781 aa		32.88	■■■□□ 2.85
SNF8-208	ENST00000510195	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		32.88	■■■□□ 2.85
SNF8-208	ENST00000510195	GPR108	Q9NPR9	543 aa		32.88	■■■□□ 2.85
SNF8-208	ENST00000510195	AK9	Q5TCS8	1911 aa		32.88	■■■□□ 2.85
SNF8-208	ENST00000510195	IRF6	O14896	467 aa		32.87	■■■□□ 2.85
SNF8-208	ENST00000510195	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	32.87	■■■□□ 2.85
SNF8-208	ENST00000510195	ATP8B2	P98198	1209 aa		32.87	■■■□□ 2.85
SNF8-208	ENST00000510195	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		32.87	■■■□□ 2.85
SNF8-208	ENST00000510195	SSH3	Q8TE77	659 aa		32.87	■■■□□ 2.85
SNF8-208	ENST00000510195	TRIM17	Q9Y577	477 aa		32.87	■■■□□ 2.85
SNF8-208	ENST00000510195	SOX10	P56693	466 aa		32.86	■■■□□ 2.85
SNF8-208	ENST00000510195	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	32.86	■■■□□ 2.85
SNF8-208	ENST00000510195	SPATA5	Q8NB90	893 aa		32.86	■■■□□ 2.85
SNF8-208	ENST00000510195	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		32.86	■■■□□ 2.85
SNF8-208	ENST00000510195	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		32.84	■■■□□ 2.85
SNF8-208	ENST00000510195	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	32.84	■■■□□ 2.85
SNF8-208	ENST00000510195	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		32.84	■■■□□ 2.85
SNF8-208	ENST00000510195	INPP5B	P32019	993 aa		32.84	■■■□□ 2.85
SNF8-208	ENST00000510195	RGS3	P49796	1198 aa		32.84	■■■□□ 2.85
SNF8-208	ENST00000510195	ARHGEF6	Q15052	776 aa		32.84	■■■□□ 2.85
SNF8-208	ENST00000510195	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	32.84	■■■□□ 2.85
SNF8-208	ENST00000510195	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		32.84	■■■□□ 2.85
SNF8-208	ENST00000510195	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		32.83	■■■□□ 2.85
SNF8-208	ENST00000510195	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	32.83	■■■□□ 2.85
SNF8-208	ENST00000510195	LDHC	P07864	332 aa		32.83	■■■□□ 2.85
SNF8-208	ENST00000510195	GSTO1	P78417	241 aa		32.83	■■■□□ 2.85
SNF8-208	ENST00000510195	MECOM	Q03112	1051 aa		32.83	■■■□□ 2.85
SNF8-208	ENST00000510195	HTT	P42858	3142 aa		32.83	■■■□□ 2.85
SNF8-208	ENST00000510195	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		32.83	■■■□□ 2.85
SNF8-208	ENST00000510195	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	32.82	■■■□□ 2.84
SNF8-208	ENST00000510195	BTD	P43251	543 aa		32.82	■■■□□ 2.84
SNF8-208	ENST00000510195	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		32.82	■■■□□ 2.84
SNF8-208	ENST00000510195	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	32.81	■■■□□ 2.84
SNF8-208	ENST00000510195	MAP3K10	Q02779	954 aa		32.81	■■■□□ 2.84
SNF8-208	ENST00000510195	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		32.81	■■■□□ 2.84
SNF8-208	ENST00000510195	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		32.81	■■■□□ 2.84
SNF8-208	ENST00000510195	EFCC1	Q9HA90	598 aa		32.81	■■■□□ 2.84
SNF8-208	ENST00000510195	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		32.81	■■■□□ 2.84
SNF8-208	ENST00000510195	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	32.8	■■■□□ 2.84
SNF8-208	ENST00000510195	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		32.8	■■■□□ 2.84
SNF8-208	ENST00000510195	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		32.8	■■■□□ 2.84

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