RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506197.2

SMIM20-201, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMIM20, Length 935 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-201ENST00000506197 GRIK5Q16478 980 aa24.25■■□□□ 1.47
SMIM20-201ENST00000506197 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa24.25■■□□□ 1.47
SMIM20-201ENST00000506197 CYP4F22Q6NT55 531 aa24.25■■□□□ 1.47
SMIM20-201ENST00000506197 USP48Q86UV5 1035 aa24.25■■□□□ 1.47
SMIM20-201ENST00000506197 SLF2Q8IX21 1173 aa24.25■■□□□ 1.47
SMIM20-201ENST00000506197 HDAC9Q9UKV0 1011 aa24.25■■□□□ 1.47
SMIM20-201ENST00000506197 HIP1O00291 1037 aa24.24■■□□□ 1.47
SMIM20-201ENST00000506197 MECOMQ03112 1051 aa24.24■■□□□ 1.47
SMIM20-201ENST00000506197 GRM1Q13255 1194 aa24.24■■□□□ 1.47
SMIM20-201ENST00000506197 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
SMIM20-201ENST00000506197 KRT26Q7Z3Y9 468 aa24.24■■□□□ 1.47
SMIM20-201ENST00000506197 SAPCD2Q86UD0 394 aa24.24■■□□□ 1.47
SMIM20-201ENST00000506197 TICAM2Q86XR7 235 aa24.24■■□□□ 1.47
SMIM20-201ENST00000506197 OGFOD1Q8N543 542 aa24.24■■□□□ 1.47
SMIM20-201ENST00000506197 MAGEB6Q8N7X4 407 aa24.24■■□□□ 1.47
SMIM20-201ENST00000506197 WBP1LQ9NX94 342 aa24.24■■□□□ 1.47
SMIM20-201ENST00000506197 PDE6AP16499 860 aa24.23■■□□□ 1.47
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
SMIM20-201ENST00000506197 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
SMIM20-201ENST00000506197 TNS4Q8IZW8 715 aa24.23■■□□□ 1.47
SMIM20-201ENST00000506197 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
SMIM20-201ENST00000506197 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
SMIM20-201ENST00000506197 GMLQ99445 158 aa24.23■■□□□ 1.47
SMIM20-201ENST00000506197 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
SMIM20-201ENST00000506197 LDHCP07864 332 aa24.22■■□□□ 1.47
SMIM20-201ENST00000506197 USP17L8P0C7I0 530 aa24.22■■□□□ 1.47
SMIM20-201ENST00000506197 ADD2P35612 726 aa24.22■■□□□ 1.47
SMIM20-201ENST00000506197 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
SMIM20-201ENST00000506197 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa24.22■■□□□ 1.47
SMIM20-201ENST00000506197 GGA3Q9NZ52 723 aa24.22■■□□□ 1.47
SMIM20-201ENST00000506197 CYP7A1P22680 504 aa24.21■■□□□ 1.47
SMIM20-201ENST00000506197 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF532Q9HCE3 1301 aa24.2■■□□□ 1.46
SMIM20-201ENST00000506197 ADM5C9JUS6 153 aa24.2■■□□□ 1.46
SMIM20-201ENST00000506197 CDC45O75419 566 aa24.2■■□□□ 1.46
SMIM20-201ENST00000506197 MMP14P50281 582 aa24.2■■□□□ 1.46
SMIM20-201ENST00000506197 UBE3CQ15386 1083 aa24.2■■□□□ 1.46
SMIM20-201ENST00000506197 CASC1Q6TDU7 716 aa24.2■■□□□ 1.46
SMIM20-201ENST00000506197 DLK2Q6UY11 383 aa24.2■■□□□ 1.46
SMIM20-201ENST00000506197 TEKT1Q969V4 418 aa24.2■■□□□ 1.46
SMIM20-201ENST00000506197 HHIPL1Q96JK4 782 aa24.2■■□□□ 1.46
SMIM20-201ENST00000506197 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
SMIM20-201ENST00000506197 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
SMIM20-201ENST00000506197 DIXDC1Q155Q3 683 aa24.19■■□□□ 1.46
SMIM20-201ENST00000506197 SULF1Q8IWU6 871 aa24.19■■□□□ 1.46
SMIM20-201ENST00000506197 MYOZ2Q9NPC6 264 aa24.19■■□□□ 1.46
SMIM20-201ENST00000506197 SERPINA10Q9UK55 444 aa24.19■■□□□ 1.46
SMIM20-201ENST00000506197 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa24.18■■□□□ 1.46
SMIM20-201ENST00000506197 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
SMIM20-201ENST00000506197 CRKP46108 304 aa24.18■■□□□ 1.46
SMIM20-201ENST00000506197 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP24.18■■□□□ 1.46
SMIM20-201ENST00000506197 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa24.17■■□□□ 1.46
SMIM20-201ENST00000506197 HHIPL2Q6UWX4 724 aa24.17■■□□□ 1.46
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF384Q8TF68 577 aa24.17■■□□□ 1.46
SMIM20-201ENST00000506197 APPBP2Q92624 585 aa24.17■■□□□ 1.46
SMIM20-201ENST00000506197 MRIQ9BWK5 157 aa24.17■■□□□ 1.46
SMIM20-201ENST00000506197 PRDM10Q9NQV6 1147 aa24.17■■□□□ 1.46
SMIM20-201ENST00000506197 ECM29Q5VYK3 1845 aa24.17■■□□□ 1.46
SMIM20-201ENST00000506197 AOC2O75106 756 aa24.16■■□□□ 1.46
SMIM20-201ENST00000506197 CHMLP26374 656 aa24.16■■□□□ 1.46
SMIM20-201ENST00000506197 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
SMIM20-201ENST00000506197 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
SMIM20-201ENST00000506197 RUFY2Q8WXA3 655 aa24.16■■□□□ 1.46
SMIM20-201ENST00000506197 GAKO14976 1311 aa24.15■■□□□ 1.46
SMIM20-201ENST00000506197 CHGBP05060 677 aa24.15■■□□□ 1.46
SMIM20-201ENST00000506197 HUNKP57058 714 aa24.15■■□□□ 1.46
SMIM20-201ENST00000506197 CFAP100Q494V2 611 aa24.15■■□□□ 1.46
SMIM20-201ENST00000506197 SLFNL1Q499Z3 407 aa24.15■■□□□ 1.46
SMIM20-201ENST00000506197 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa24.15■■□□□ 1.46
SMIM20-201ENST00000506197 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
SMIM20-201ENST00000506197 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
SMIM20-201ENST00000506197 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
SMIM20-201ENST00000506197 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa24.15■■□□□ 1.46
SMIM20-201ENST00000506197 BAG3O95817 575 aa24.14■■□□□ 1.45
SMIM20-201ENST00000506197 MAP2K2P36507 400 aa24.14■■□□□ 1.45
SMIM20-201ENST00000506197 DLGAP5Q15398 846 aa24.14■■□□□ 1.45
SMIM20-201ENST00000506197 ADGRA1Q86SQ6 560 aa24.14■■□□□ 1.45
SMIM20-201ENST00000506197 MIGA1Q8NAN2 632 aa24.14■■□□□ 1.45
SMIM20-201ENST00000506197 FAM227BQ96M60 508 aa24.14■■□□□ 1.45
SMIM20-201ENST00000506197 ZDHHC15Q96MV8 337 aa24.14■■□□□ 1.45
SMIM20-201ENST00000506197 BEGAINQ9BUH8 593 aa24.14■■□□□ 1.45
SMIM20-201ENST00000506197 HELLSQ9NRZ9 838 aa24.14■■□□□ 1.45
SMIM20-201ENST00000506197 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa24.13■■□□□ 1.45
SMIM20-201ENST00000506197 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa24.13■■□□□ 1.45
SMIM20-201ENST00000506197 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
SMIM20-201ENST00000506197 BTDP43251 543 aa24.13■■□□□ 1.45
SMIM20-201ENST00000506197 LBX1P52954 281 aa24.13■■□□□ 1.45
SMIM20-201ENST00000506197 CERS3Q8IU89 383 aa24.13■■□□□ 1.45
SMIM20-201ENST00000506197 C2orf69Q8N8R5 385 aa24.13■■□□□ 1.45
SMIM20-201ENST00000506197 CDCA5Q96FF9 252 aa24.13■■□□□ 1.45
SMIM20-201ENST00000506197 A0A0D9SFI3 127 aa24.12■■□□□ 1.45
SMIM20-201ENST00000506197 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa24.12■■□□□ 1.45
SMIM20-201ENST00000506197 MTMR14Q8NCE2 650 aa24.12■■□□□ 1.45
SMIM20-201ENST00000506197 OSBP2Q969R2 916 aa24.12■■□□□ 1.45
SMIM20-201ENST00000506197 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP24.12■■□□□ 1.45
SMIM20-201ENST00000506197 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa24.12■■□□□ 1.45
SMIM20-201ENST00000506197 RAD50Q92878 1312 aa24.11■■□□□ 1.45
SMIM20-201ENST00000506197 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa24.11■■□□□ 1.45
SMIM20-201ENST00000506197 M0R2C6 588 aa24.11■■□□□ 1.45
SMIM20-201ENST00000506197 PLCG2P16885 1265 aa24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms