RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 MAP4K1Q92918 833 aa8.52□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 CHMP4CQ96CF2 233 aa8.52□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 SGIP1Q9BQI5 828 aa8.52□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 MAST3O60307 1309 aa8.52□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 CHD4Q14839 1912 aa8.52□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 ZBTB7AO95365 584 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 PDE6AP16499 860 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 CHRNA5P30532 468 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 SETQ01105 290 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 RABEP1Q15276 862 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 SUPT20HQ8NEM7 779 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 WDR66Q8TBY9 1149 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 C7orf43Q8WVR3 580 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 KCNB2Q92953 911 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 NCAPGQ9BPX3 1015 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 DSCC1Q9BVC3 393 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 POLLQ9UGP5 575 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 CEP83Q9Y592 693 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 C6orf229H3BNL8 230 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 IDH1O75874 414 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 SOGA3Q5TF21 947 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 TXNRD3Q86VQ6 643 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 TTLL6Q8N841 843 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 PDLIM2Q96JY6 352 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 KIF2CQ99661 725 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 COA1Q9GZY4 146 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 BRMS1Q9HCU9 246 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 CD2APQ9Y5K6 639 aa8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 RNF20Q5VTR2 975 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF592Q92610 1267 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 OSBP2Q969R2 916 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 SNX21Q969T3 373 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 CD209Q9NNX6 404 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 LRP2BPQ9P2M1 347 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 CCDC39Q9UFE4 941 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 MYH2Q9UKX2 1941 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM205AQ6ZU69 1335 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF532Q9HCE3 1301 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 M0R2C6 588 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 SLFN14P0C7P3 912 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 PTH1RQ03431 593 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 NECTIN1Q15223 517 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 VPS33BQ9H267 617 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 RAI14Q9P0K7 980 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 WWC3Q9ULE0 1092 aa8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 LAMB1P07942 1786 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 ZMYM6O95789 1325 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 CCDC172P0C7W6 258 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 DPEP1P16444 411 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 KCNA3P22001 575 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 CCDC93Q567U6 631 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC51AQ86UW1 340 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 RTKN2Q8IZC4 609 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 MAGEB6Q8N7X4 407 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 FOCADQ5VW36 1801 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 TIAM2Q8IVF5 1701 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 GPAA1O43292 621 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 PRR29P0C7W0 189 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 GNAT2P19087 354 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 PTGER2P43116 358 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 TSGA10IPQ3SY00 556 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 PSMD1Q99460 953 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 TM6SF1Q9BZW5 370 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 PIM2Q9P1W9 311 aa8.49□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa8.48□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 GSTO1P78417 241 aa8.48□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 KRT32Q14532 448 aa8.48□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 CREB3L3Q68CJ9 461 aa8.48□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa8.48□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 ABCF2Q9UG63 623 aa8.48□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 CTNNA3Q9UI47 895 aa8.48□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 SNX14Q9Y5W7 946 aa8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.6 ms