RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 KLHL23Q8NBE8 558 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRC-212ENST00000491302 KCNB2Q92953 911 aa11.64□□□□□ -0.55
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PTPRC-212ENST00000491302 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PTPRC-212ENST00000491302 TLR3O15455 904 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
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PTPRC-212ENST00000491302 KRT76Q01546 638 aa11.63□□□□□ -0.55
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PTPRC-212ENST00000491302 POU4F3Q15319 338 aa11.63□□□□□ -0.55
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PTPRC-212ENST00000491302 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
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PTPRC-212ENST00000491302 C8orf86Q6ZUL3 223 aa11.58□□□□□ -0.56
PTPRC-212ENST00000491302 ANAPC16Q96DE5 110 aa11.58□□□□□ -0.56
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PTPRC-212ENST00000491302 DTWD1Q8N5C7 304 aa11.57□□□□□ -0.56
PTPRC-212ENST00000491302 OR6P1Q8NGX9 317 aa11.57□□□□□ -0.56
PTPRC-212ENST00000491302 GPBAR1Q8TDU6 330 aa11.57□□□□□ -0.56
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
PTPRC-212ENST00000491302 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
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PTPRC-212ENST00000491302 PCDHA4Q9UN74 947 aa11.57□□□□□ -0.56
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PTPRC-212ENST00000491302 ANKS3Q6ZW76 656 aa11.56□□□□□ -0.56
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PTPRC-212ENST00000491302 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
PTPRC-212ENST00000491302 NID1P14543 1247 aa11.55□□□□□ -0.56
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PTPRC-212ENST00000491302 TRIM55Q9BYV6 548 aa11.55□□□□□ -0.56
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
PTPRC-212ENST00000491302 EHMT1Q9H9B1 1298 aa11.55□□□□□ -0.56
PTPRC-212ENST00000491302 ZNRF3Q9ULT6 936 aa11.55□□□□□ -0.56
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PTPRC-212ENST00000491302 CCDC81Q6ZN84 652 aa11.54□□□□□ -0.56
PTPRC-212ENST00000491302 ILDR2Q71H61 639 aa11.54□□□□□ -0.56
PTPRC-212ENST00000491302 HDXQ7Z353 690 aa11.54□□□□□ -0.56
PTPRC-212ENST00000491302 USP26Q9BXU7 913 aa11.54□□□□□ -0.56
PTPRC-212ENST00000491302 SIRPGQ9P1W8 387 aa11.54□□□□□ -0.56
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PTPRC-212ENST00000491302 ATE1O95260 518 aa11.53□□□□□ -0.56
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PTPRC-212ENST00000491302 MLECQ14165 292 aa11.53□□□□□ -0.56
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PTPRC-212ENST00000491302 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa11.53□□□□□ -0.56
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PTPRC-212ENST00000491302 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 LYPD4Q6UWN0 246 aa11.52□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 KLF4O43474 513 aa11.51□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 ECEL1O95672 775 aa11.51□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
PTPRC-212ENST00000491302 RAB33AQ14088 237 aa11.51□□□□□ -0.57
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