RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487548.2

SENP6-210, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2

Gene SENP6, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-210ENST00000487548 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa6.39□□□□□ -1.39
SENP6-210ENST00000487548 PIDD1Q9HB75 910 aa6.39□□□□□ -1.39
SENP6-210ENST00000487548 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa6.39□□□□□ -1.39
SENP6-210ENST00000487548 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa6.39□□□□□ -1.39
SENP6-210ENST00000487548 FAM13AO94988 1023 aa6.38□□□□□ -1.39
SENP6-210ENST00000487548 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
SENP6-210ENST00000487548 LIG1P18858 919 aa6.38□□□□□ -1.39
SENP6-210ENST00000487548 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
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SENP6-210ENST00000487548 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
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SENP6-210ENST00000487548 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
SENP6-210ENST00000487548 U3KQE9 123 aa6.38□□□□□ -1.39
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SENP6-210ENST00000487548 LRRN4CLQ8ND94 238 aa6.37□□□□□ -1.39
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SENP6-210ENST00000487548 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
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SENP6-210ENST00000487548 PRDM7Q9NQW5 492 aa6.35□□□□□ -1.39
SENP6-210ENST00000487548 TMPRSS2O15393 492 aa6.34□□□□□ -1.39
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SENP6-210ENST00000487548 AOC3Q16853 763 aa6.34□□□□□ -1.39
SENP6-210ENST00000487548 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
SENP6-210ENST00000487548 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
SENP6-210ENST00000487548 CARNS1A5YM72 827 aa6.33□□□□□ -1.4
SENP6-210ENST00000487548 LRRC10BA6NIK2 292 aa6.33□□□□□ -1.4
SENP6-210ENST00000487548 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SENP6-210ENST00000487548 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
SENP6-210ENST00000487548 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SENP6-210ENST00000487548 NPR3P17342 541 aa6.32□□□□□ -1.4
SENP6-210ENST00000487548 AP3B2Q13367 1082 aa6.32□□□□□ -1.4
SENP6-210ENST00000487548 TTLL4Q14679 1199 aa6.32□□□□□ -1.4
SENP6-210ENST00000487548 TMEM40Q8WWA1 233 aa6.32□□□□□ -1.4
SENP6-210ENST00000487548 HRASLS5Q96KN8 279 aa6.32□□□□□ -1.4
SENP6-210ENST00000487548 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6.32□□□□□ -1.4
SENP6-210ENST00000487548 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa6.32□□□□□ -1.4
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SENP6-210ENST00000487548 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SENP6-210ENST00000487548 NPHS2Q9NP85 383 aa6.32□□□□□ -1.4
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SENP6-210ENST00000487548 SLFN14P0C7P3 912 aa6.31□□□□□ -1.4
SENP6-210ENST00000487548 ID3Q02535 119 aa6.31□□□□□ -1.4
SENP6-210ENST00000487548 PRKCQQ04759 706 aa6.31□□□□□ -1.4
SENP6-210ENST00000487548 ORC1Q13415 861 aa6.31□□□□□ -1.4
SENP6-210ENST00000487548 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SENP6-210ENST00000487548 MLANAQ16655 118 aa6.31□□□□□ -1.4
SENP6-210ENST00000487548 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SENP6-210ENST00000487548 SERPINA10Q9UK55 444 aa6.31□□□□□ -1.4
SENP6-210ENST00000487548 MTMR7Q9Y216 660 aa6.31□□□□□ -1.4
SENP6-210ENST00000487548 ZNF862O60290 1169 aa6.3□□□□□ -1.4
SENP6-210ENST00000487548 CEACAM5P06731 702 aa6.3□□□□□ -1.4
SENP6-210ENST00000487548 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SENP6-210ENST00000487548 TOP6BLQ8N6T0 577 aa6.3□□□□□ -1.4
SENP6-210ENST00000487548 DISC1Q9NRI5 854 aa6.3□□□□□ -1.4
SENP6-210ENST00000487548 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
SENP6-210ENST00000487548 TMEM88BA6NKF7 163 aa6.29□□□□□ -1.4
SENP6-210ENST00000487548 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SENP6-210ENST00000487548 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SENP6-210ENST00000487548 ITPKAP23677 461 aa6.29□□□□□ -1.4
SENP6-210ENST00000487548 KIAA0319Q5VV43 1072 aa6.29□□□□□ -1.4
SENP6-210ENST00000487548 KCNB2Q92953 911 aa6.29□□□□□ -1.4
SENP6-210ENST00000487548 DUSP23Q9BVJ7 150 aa6.29□□□□□ -1.4
SENP6-210ENST00000487548 BRPF3Q9ULD4 1205 aa6.29□□□□□ -1.4
SENP6-210ENST00000487548 PLAGL2Q9UPG8 496 aa6.29□□□□□ -1.4
SENP6-210ENST00000487548 TMEM265A0A087WTH1 108 aa6.28□□□□□ -1.4
SENP6-210ENST00000487548 OXCT1P55809 520 aa6.28□□□□□ -1.4
SENP6-210ENST00000487548 FAAP100Q0VG06 881 aa6.28□□□□□ -1.4
SENP6-210ENST00000487548 IKZF1Q13422 519 aa6.28□□□□□ -1.4
SENP6-210ENST00000487548 KCNMB1Q16558 191 aa6.28□□□□□ -1.4
SENP6-210ENST00000487548 ZSWIM9Q86XI8 627 aa6.28□□□□□ -1.4
SENP6-210ENST00000487548 FAM84AQ96KN4 292 aa6.28□□□□□ -1.4
SENP6-210ENST00000487548 ABCB6Q9NP58 842 aa6.28□□□□□ -1.4
SENP6-210ENST00000487548 H3BRB1 525 aa6.27□□□□□ -1.41
SENP6-210ENST00000487548 MESP2Q0VG99 397 aa6.27□□□□□ -1.41
SENP6-210ENST00000487548 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP6.27□□□□□ -1.41
SENP6-210ENST00000487548 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
SENP6-210ENST00000487548 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
SENP6-210ENST00000487548 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
SENP6-210ENST00000487548 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
SENP6-210ENST00000487548 NEFMP07197 916 aa6.26□□□□□ -1.41
SENP6-210ENST00000487548 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
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