RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487538.1

GTPBP1-211, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 358 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-211ENST00000487538 MIGA1Q8NAN2 632 aa12.27□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 NCOA7Q8NI08 942 aa12.27□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 WDR66Q8TBY9 1149 aa12.27□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 AGXT2Q9BYV1 514 aa12.27□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 RNF181Q9P0P0 153 aa12.27□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 ZDHHC9Q9Y397 364 aa12.27□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa12.27□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa12.27□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 LTBP1Q14766 1721 aa12.27□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 WDR19Q8NEZ3 1342 aa12.27□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 WDR90Q96KV7 1748 aa12.26□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 GSG1L2A8MUP6 293 aa12.26□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 GOLGA6L22H0YM25 854 aa12.26□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 BAG4O95429 457 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 ALDH1B1P30837 517 aa12.26□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 MCM5P33992 734 aa12.26□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 TDO2P48775 406 aa12.26□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 MECOMQ03112 1051 aa12.26□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 TRDNQ13061 729 aa12.26□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 STYK1Q6J9G0 422 aa12.26□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 ADGRA1Q86SQ6 560 aa12.26□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 TBC1D10CQ8IV04 446 aa12.26□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 FBXL16Q8N461 479 aa12.26□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 TBC1D16Q8TBP0 767 aa12.26□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 BRF1Q92994 677 aa12.26□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 GTF3C6Q969F1 213 aa12.26□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 NBPF3Q9H094 633 aa12.26□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 PRC1O43663 620 aa12.25□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 PRKAB2O43741 272 aa12.25□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 GJB2P29033 226 aa12.25□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP12.25□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 CHMP4CQ96CF2 233 aa12.25□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 MASTLQ96GX5 879 aa12.25□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 LRRC2Q9BYS8 371 aa12.25□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 NMRK2Q9NPI5 230 aa12.25□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 LTBP3Q9NS15 1303 aa12.25□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 C6orf229H3BNL8 230 aa12.24□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 C21orf2O43822 256 aa12.24□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 PFKFB2O60825 505 aa12.24□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 LDHBP07195 334 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 IL1R1P14778 569 aa12.24□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 LMNB1P20700 586 aa12.24□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 PRDX5P30044 214 aa12.24□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF384Q8TF68 577 aa12.24□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 C7orf43Q8WVR3 580 aa12.24□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 CD209Q9NNX6 404 aa12.24□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 POLLQ9UGP5 575 aa12.24□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 COL4A5P29400 1685 aa12.23□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 STX6O43752 255 aa12.23□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 PDCP20941 246 aa12.23□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 EVCP57679 992 aa12.23□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 ANTXR2P58335 489 aa12.23□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 GSTO1P78417 241 aa12.23□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 APOBRQ0VD83 1088 aa12.23□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 STK3Q13188 491 aa12.23□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 GIMAP6Q6P9H5 292 aa12.23□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 CNNM2Q9H8M5 875 aa12.23□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 JAG2Q9Y219 1238 aa12.23□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 NEDD4P46934 1319 aa12.22□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 SYT1P21579 422 aa12.22□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 AKNAD1Q5T1N1 836 aa12.22□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 CHST3Q7LGC8 479 aa12.22□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 MPNDQ8N594 471 aa12.22□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 STAG1Q8WVM7 1258 aa12.22□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 CNKSR1Q969H4 720 aa12.22□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 KRT23Q9C075 422 aa12.22□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM205AQ6ZU69 1335 aa12.21□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 TRAK2O60296 914 aa12.21□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 LDHCP07864 332 aa12.21□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 CTDSPL2Q05D32 466 aa12.21□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 PPARAQ07869 468 aa12.21□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 SCRN1Q12765 414 aa12.21□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 MCTP1Q6DN14 999 aa12.21□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 OLFM4Q6UX06 510 aa12.21□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 MFSD6Q6ZSS7 791 aa12.21□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa12.21□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 SDR42E1Q8WUS8 393 aa12.21□□□□□ -0.45
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