RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484684.1

SRPRB-204, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene SRPRB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-204ENST00000484684 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
SRPRB-204ENST00000484684 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
SRPRB-204ENST00000484684 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
SRPRB-204ENST00000484684 GABRQQ9UN88 632 aa19.97■□□□□ 0.79
SRPRB-204ENST00000484684 A0A1B0GUL6 1792 aa19.96■□□□□ 0.79
SRPRB-204ENST00000484684 INHAP05111 366 aa19.96■□□□□ 0.79
SRPRB-204ENST00000484684 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP19.96■□□□□ 0.79
SRPRB-204ENST00000484684 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
SRPRB-204ENST00000484684 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
SRPRB-204ENST00000484684 ELNP15502 786 aa19.95■□□□□ 0.78
SRPRB-204ENST00000484684 BCAMP50895 628 aa19.95■□□□□ 0.78
SRPRB-204ENST00000484684 CASP7P55210 303 aa19.95■□□□□ 0.78
SRPRB-204ENST00000484684 LRIT3Q3SXY7 679 aa19.95■□□□□ 0.78
SRPRB-204ENST00000484684 NECAB2Q7Z6G3 386 aa19.95■□□□□ 0.78
SRPRB-204ENST00000484684 ZNF341Q9BYN7 854 aa19.95■□□□□ 0.78
SRPRB-204ENST00000484684 CCER2I3L3R5 266 aa19.94■□□□□ 0.78
SRPRB-204ENST00000484684 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
SRPRB-204ENST00000484684 GYG1P46976 350 aa19.94■□□□□ 0.78
SRPRB-204ENST00000484684 TAF7LQ5H9L4 462 aa19.94■□□□□ 0.78
SRPRB-204ENST00000484684 CNNM1Q9NRU3 951 aa19.94■□□□□ 0.78
SRPRB-204ENST00000484684 CYP2C8P10632 490 aa19.93■□□□□ 0.78
SRPRB-204ENST00000484684 BCRP11274 1271 aa19.93■□□□□ 0.78
SRPRB-204ENST00000484684 INPP5BP32019 993 aa19.93■□□□□ 0.78
SRPRB-204ENST00000484684 FLT3LGP49771 235 aa19.93■□□□□ 0.78
SRPRB-204ENST00000484684 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa19.93■□□□□ 0.78
SRPRB-204ENST00000484684 MIGA2Q7L4E1 593 aa19.93■□□□□ 0.78
SRPRB-204ENST00000484684 TDHQ8IZJ6 230 aa19.93■□□□□ 0.78
SRPRB-204ENST00000484684 TSPYL6Q8N831 410 aa19.93■□□□□ 0.78
SRPRB-204ENST00000484684 TEKT1Q969V4 418 aa19.93■□□□□ 0.78
SRPRB-204ENST00000484684 TAOK2Q9UL54 1235 aa19.93■□□□□ 0.78
SRPRB-204ENST00000484684 KCNH4Q9UQ05 1017 aa19.93■□□□□ 0.78
SRPRB-204ENST00000484684 FAM83AQ86UY5 434 aa19.92■□□□□ 0.78
SRPRB-204ENST00000484684 PXYLP1Q8TE99 480 aa19.92■□□□□ 0.78
SRPRB-204ENST00000484684 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
SRPRB-204ENST00000484684 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
SRPRB-204ENST00000484684 SYN1P17600 705 aa19.91■□□□□ 0.78
SRPRB-204ENST00000484684 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
SRPRB-204ENST00000484684 G2E3Q7L622 706 aa19.91■□□□□ 0.78
SRPRB-204ENST00000484684 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa19.91■□□□□ 0.78
SRPRB-204ENST00000484684 MGAMO43451 1857 aa19.9■□□□□ 0.78
SRPRB-204ENST00000484684 ALPK3Q96L96 1907 aa19.9■□□□□ 0.78
SRPRB-204ENST00000484684 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
SRPRB-204ENST00000484684 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
SRPRB-204ENST00000484684 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
SRPRB-204ENST00000484684 GRIK5Q16478 980 aa19.9■□□□□ 0.78
SRPRB-204ENST00000484684 CCDC57Q2TAC2 916 aa19.9■□□□□ 0.78
SRPRB-204ENST00000484684 WWC1Q8IX03 1113 aa19.9■□□□□ 0.78
SRPRB-204ENST00000484684 LINS1Q8NG48 757 aa19.9■□□□□ 0.78
SRPRB-204ENST00000484684 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
SRPRB-204ENST00000484684 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
SRPRB-204ENST00000484684 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
SRPRB-204ENST00000484684 FOXO4P98177 505 aa19.89■□□□□ 0.77
SRPRB-204ENST00000484684 MOGSQ13724 837 aa19.89■□□□□ 0.77
SRPRB-204ENST00000484684 UBE4AQ14139 1066 aa19.89■□□□□ 0.77
SRPRB-204ENST00000484684 VPS37DQ86XT2 251 aa19.89■□□□□ 0.77
SRPRB-204ENST00000484684 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
SRPRB-204ENST00000484684 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
SRPRB-204ENST00000484684 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
SRPRB-204ENST00000484684 RPTORQ8N122 1335 aa19.88■□□□□ 0.77
SRPRB-204ENST00000484684 SLC4A2P04920 1241 aa19.88■□□□□ 0.77
SRPRB-204ENST00000484684 IRF5Q13568 498 aa19.88■□□□□ 0.77
SRPRB-204ENST00000484684 FKBP1CQ5VVH2 108 aa19.88■□□□□ 0.77
SRPRB-204ENST00000484684 LMBR1LQ6UX01 489 aa19.88■□□□□ 0.77
SRPRB-204ENST00000484684 ANKLE1Q8NAG6 615 aa19.88■□□□□ 0.77
SRPRB-204ENST00000484684 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa19.88■□□□□ 0.77
SRPRB-204ENST00000484684 DNAAF4Q8WXU2 420 aa19.88■□□□□ 0.77
SRPRB-204ENST00000484684 ZDHHC15Q96MV8 337 aa19.88■□□□□ 0.77
SRPRB-204ENST00000484684 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP19.88■□□□□ 0.77
SRPRB-204ENST00000484684 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
SRPRB-204ENST00000484684 GPAT2Q6NUI2 795 aa19.87■□□□□ 0.77
SRPRB-204ENST00000484684 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
SRPRB-204ENST00000484684 FLIIQ13045 1269 aa19.86■□□□□ 0.77
SRPRB-204ENST00000484684 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
SRPRB-204ENST00000484684 NBPF3Q9H094 633 aa19.86■□□□□ 0.77
SRPRB-204ENST00000484684 CXCL11O14625 94 aa19.85■□□□□ 0.77
SRPRB-204ENST00000484684 CCDC27Q2M243 656 aa19.85■□□□□ 0.77
SRPRB-204ENST00000484684 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
SRPRB-204ENST00000484684 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
SRPRB-204ENST00000484684 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
SRPRB-204ENST00000484684 COA7Q96BR5 231 aa19.85■□□□□ 0.77
SRPRB-204ENST00000484684 ZNF112Q9UJU3 913 aa19.85■□□□□ 0.77
SRPRB-204ENST00000484684 CACNA1FO60840 1977 aa19.84■□□□□ 0.77
SRPRB-204ENST00000484684 MAST3O60307 1309 aa19.84■□□□□ 0.77
SRPRB-204ENST00000484684 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
SRPRB-204ENST00000484684 C11orf49Q9H6J7 331 aa19.84■□□□□ 0.77
SRPRB-204ENST00000484684 ZNF521Q96K83 1311 aa19.83■□□□□ 0.77
SRPRB-204ENST00000484684 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
SRPRB-204ENST00000484684 GADL1Q6ZQY3 521 aa19.83■□□□□ 0.77
SRPRB-204ENST00000484684 FAM151AQ8WW52 585 aa19.83■□□□□ 0.77
SRPRB-204ENST00000484684 PRDM6Q9NQX0 595 aa19.83■□□□□ 0.77
SRPRB-204ENST00000484684 TCP10Q12799 353 aa19.82■□□□□ 0.76
SRPRB-204ENST00000484684 CAVIN4Q5BKX8 364 aa19.82■□□□□ 0.76
SRPRB-204ENST00000484684 MRIQ9BWK5 157 aa19.82■□□□□ 0.76
SRPRB-204ENST00000484684 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
SRPRB-204ENST00000484684 EPHA10Q5JZY3 1008 aa19.81■□□□□ 0.76
SRPRB-204ENST00000484684 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
SRPRB-204ENST00000484684 FAM161BQ96MY7 647 aa19.81■□□□□ 0.76
SRPRB-204ENST00000484684 GUCD1Q96NT3 240 aa19.81■□□□□ 0.76
SRPRB-204ENST00000484684 ZHX2Q9Y6X8 837 aa19.81■□□□□ 0.76
SRPRB-204ENST00000484684 VCANP13611 3396 aa19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms