RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM57Q8N5G2 664 aa9.99□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 ZDHHC15Q96MV8 337 aa9.99□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 WRNIP1Q96S55 665 aa9.99□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 C1orf115Q9H7X2 142 aa9.99□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 USP40Q9NVE5 1235 aa9.99□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 AKAP2Q9Y2D5 859 aa9.99□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 A0A1B0GUL7 405 aa9.98□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP9.98□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 GJA5P36382 358 aa9.98□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 INHBEP58166 350 aa9.98□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 VGLL4Q14135 290 aa9.98□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 CCDC102BQ68D86 513 aa9.98□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 XAGE2Q96GT9 111 aa9.98□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 TEPSINQ96N21 525 aa9.98□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 COPRSQ9NQ92 184 aa9.98□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 FBXO3Q9UK99 471 aa9.98□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa9.98□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa9.97□□□□□ -0.81
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CTPS1-209ENST00000480420 CRHR2Q13324 411 aa9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 PICALMQ13492 652 aa9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 MVPQ14764 893 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 MAP3K11Q16584 847 aa9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 CCL15Q16663 113 aa9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 DCAF15Q66K64 600 aa9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 HHIPL2Q6UWX4 724 aa9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 HOOK2Q96ED9 719 aa9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 TRIM17Q9Y577 477 aa9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 NFIAQ12857 509 aa9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 RASGRF1Q13972 1273 aa9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 ERICH6Q7L0X2 663 aa9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 CD99L2Q8TCZ2 262 aa9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF341Q9BYN7 854 aa9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 SNRKQ9NRH2 765 aa9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 RAI14Q9P0K7 980 aa9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 HPS5Q9UPZ3 1129 aa9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 SEMA3EO15041 775 aa9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 SURF6O75683 361 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 MYCP01106 439 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 INPP5BP32019 993 aa9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 GTF2A2P52657 109 aa9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 TTC39AQ5SRH9 613 aa9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 PI16Q6UXB8 463 aa9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 FAM83AQ86UY5 434 aa9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 SLF2Q8IX21 1173 aa9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 FAM151AQ8WW52 585 aa9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 PTPN18Q99952 460 aa9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 MRIQ9BWK5 157 aa9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 LRP2BPQ9P2M1 347 aa9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 DOCK2Q92608 1830 aa9.94□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 UNCXA6NJT0 531 aa9.94□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 APBB1O00213 710 aa9.94□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 BTDP43251 543 aa9.94□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 RGS3P49796 1198 aa9.94□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 SP3Q02447 781 aa9.94□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 ERO1BQ86YB8 467 aa9.94□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 ZFPM1Q8IX07 1006 aa9.94□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 SPATA5Q8NB90 893 aa9.94□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 PANK1Q8TE04 598 aa9.94□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 BRI3BPQ8WY22 251 aa9.94□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 ERO1AQ96HE7 468 aa9.94□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa9.94□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa9.94□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 IRF6O14896 467 aa9.93□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 CETPP11597 493 aa9.93□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 MECOMQ03112 1051 aa9.93□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 SNAPC2Q13487 334 aa9.93□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 FKBP1CQ5VVH2 108 aa9.93□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 FAM43AQ8N2R8 423 aa9.93□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 EFCC1Q9HA90 598 aa9.93□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 PICK1Q9NRD5 415 aa9.93□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 FAM198AQ9UFP1 575 aa9.93□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 SALL1Q9NSC2 1324 aa9.92□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 SPDYE5A6NIY4 337 aa9.92□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 LDHCP07864 332 aa9.92□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 SLURP2P0DP57 97 aa9.92□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 RLBP1P12271 317 aa9.92□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 GSTO1P78417 241 aa9.92□□□□□ -0.82
CTPS1-209ENST00000480420 MTX1Q13505 466 aa9.92□□□□□ -0.82
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