RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476231.1

SYF2-204, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SYF2, Length 1,962 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-204ENST00000476231 CNPY2Q9Y2B0 182 aa22.43■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 QSER1Q2KHR3 1735 aa22.42■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 SLC51AQ86UW1 340 aa22.42■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 FAM184AQ8NB25 1140 aa22.42■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 SALL1Q9NSC2 1324 aa22.42■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 UFL1O94874 794 aa22.41■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 SRGNP10124 158 aa22.41■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 NPR1P16066 1061 aa22.41■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 SLC15A2Q16348 729 aa22.41■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 SP8Q8IXZ3 490 aa22.41■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 PFKFB2O60825 505 aa22.41■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 STK3Q13188 491 aa22.41■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 TBC1D10CQ8IV04 446 aa22.41■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 WDR66Q8TBY9 1149 aa22.41■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 GDPD2Q9HCC8 539 aa22.41■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 TIAM2Q8IVF5 1701 aa22.4■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa22.4■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 PRC1O43663 620 aa22.4■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 PRKAB2O43741 272 aa22.4■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 UVSSAQ2YD98 709 aa22.4■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 ZSCAN30Q86W11 494 aa22.4■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 STK32BQ9NY57 414 aa22.4■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 LTBP1Q14766 1721 aa22.4■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 TDO2P48775 406 aa22.39■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 EVCP57679 992 aa22.39■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 MECOMQ03112 1051 aa22.39■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 ZNF384Q8TF68 577 aa22.39■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 CHMP4CQ96CF2 233 aa22.39■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 ALDH1B1P30837 517 aa22.39■■□□□ 1.17
SYF2-204ENST00000476231 APOBRQ0VD83 1088 aa22.39■■□□□ 1.17
SYF2-204ENST00000476231 CHST3Q7LGC8 479 aa22.39■■□□□ 1.17
SYF2-204ENST00000476231 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
SYF2-204ENST00000476231 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa22.39■■□□□ 1.17
SYF2-204ENST00000476231 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa22.39■■□□□ 1.17
SYF2-204ENST00000476231 DUOX1Q9NRD9 1551 aa22.38■■□□□ 1.17
SYF2-204ENST00000476231 ELP1O95163 1332 aa22.38■■□□□ 1.17
SYF2-204ENST00000476231 TBC1D16Q8TBP0 767 aa22.38■■□□□ 1.17
SYF2-204ENST00000476231 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
SYF2-204ENST00000476231 ANTXR2P58335 489 aa22.38■■□□□ 1.17
SYF2-204ENST00000476231 MSL1Q68DK7 614 aa22.38■■□□□ 1.17
SYF2-204ENST00000476231 CHD4Q14839 1912 aa22.37■■□□□ 1.17
SYF2-204ENST00000476231 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
SYF2-204ENST00000476231 PRDX5P30044 214 aa22.37■■□□□ 1.17
SYF2-204ENST00000476231 SCRN1Q12765 414 aa22.37■■□□□ 1.17
SYF2-204ENST00000476231 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
SYF2-204ENST00000476231 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
SYF2-204ENST00000476231 CNNM2Q9H8M5 875 aa22.37■■□□□ 1.17
SYF2-204ENST00000476231 IL1R1P14778 569 aa22.36■■□□□ 1.17
SYF2-204ENST00000476231 MASTLQ96GX5 879 aa22.36■■□□□ 1.17
SYF2-204ENST00000476231 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
SYF2-204ENST00000476231 CD209Q9NNX6 404 aa22.36■■□□□ 1.17
SYF2-204ENST00000476231 POLLQ9UGP5 575 aa22.36■■□□□ 1.17
SYF2-204ENST00000476231 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
SYF2-204ENST00000476231 KRT85P78386 507 aa22.36■■□□□ 1.17
SYF2-204ENST00000476231 AKNAD1Q5T1N1 836 aa22.36■■□□□ 1.17
SYF2-204ENST00000476231 GIMAP6Q6P9H5 292 aa22.36■■□□□ 1.17
SYF2-204ENST00000476231 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
SYF2-204ENST00000476231 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SYF2-204ENST00000476231 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SYF2-204ENST00000476231 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SYF2-204ENST00000476231 STAG1Q8WVM7 1258 aa22.35■■□□□ 1.17
SYF2-204ENST00000476231 LDHBP07195 334 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SYF2-204ENST00000476231 CTDSPL2Q05D32 466 aa22.34■■□□□ 1.17
SYF2-204ENST00000476231 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SYF2-204ENST00000476231 KRT23Q9C075 422 aa22.34■■□□□ 1.17
SYF2-204ENST00000476231 NEDD4P46934 1319 aa22.34■■□□□ 1.17
SYF2-204ENST00000476231 C6orf229H3BNL8 230 aa22.34■■□□□ 1.17
SYF2-204ENST00000476231 FIBPO43427 364 aa22.34■■□□□ 1.17
SYF2-204ENST00000476231 BAG6P46379 1132 aa22.34■■□□□ 1.17
SYF2-204ENST00000476231 MFSD6Q6ZSS7 791 aa22.34■■□□□ 1.17
SYF2-204ENST00000476231 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa22.34■■□□□ 1.17
SYF2-204ENST00000476231 SDR42E1Q8WUS8 393 aa22.34■■□□□ 1.17
SYF2-204ENST00000476231 TMEM87BQ96K49 555 aa22.34■■□□□ 1.17
SYF2-204ENST00000476231 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
SYF2-204ENST00000476231 ANAPC4Q9UJX5 808 aa22.34■■□□□ 1.17
SYF2-204ENST00000476231 JAG2Q9Y219 1238 aa22.34■■□□□ 1.17
SYF2-204ENST00000476231 B4E1Z4 1266 aa22.33■■□□□ 1.17
SYF2-204ENST00000476231 GSTO1P78417 241 aa22.33■■□□□ 1.17
SYF2-204ENST00000476231 CYB5R4Q7L1T6 521 aa22.33■■□□□ 1.17
SYF2-204ENST00000476231 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
SYF2-204ENST00000476231 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
SYF2-204ENST00000476231 PPARAQ07869 468 aa22.32■■□□□ 1.16
SYF2-204ENST00000476231 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SYF2-204ENST00000476231 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
SYF2-204ENST00000476231 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SYF2-204ENST00000476231 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SYF2-204ENST00000476231 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
SYF2-204ENST00000476231 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
SYF2-204ENST00000476231 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa22.31■■□□□ 1.16
SYF2-204ENST00000476231 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.6 ms