RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474160.1

SYF2-203, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 2

Gene SYF2, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-203ENST00000474160 TCP10L2B9ZVM9 353 aa23.12■■□□□ 1.29
SYF2-203ENST00000474160 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
SYF2-203ENST00000474160 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa23.12■■□□□ 1.29
SYF2-203ENST00000474160 RAI14Q9P0K7 980 aa23.12■■□□□ 1.29
SYF2-203ENST00000474160 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa23.12■■□□□ 1.29
SYF2-203ENST00000474160 MYH2Q9UKX2 1941 aa23.12■■□□□ 1.29
SYF2-203ENST00000474160 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa23.11■■□□□ 1.29
SYF2-203ENST00000474160 APBB1O00213 710 aa23.11■■□□□ 1.29
SYF2-203ENST00000474160 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
SYF2-203ENST00000474160 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
SYF2-203ENST00000474160 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
SYF2-203ENST00000474160 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
SYF2-203ENST00000474160 TEPSINQ96N21 525 aa23.11■■□□□ 1.29
SYF2-203ENST00000474160 SLC10A3P09131 477 aa23.1■■□□□ 1.29
SYF2-203ENST00000474160 ZAP70P43403 619 aa23.1■■□□□ 1.29
SYF2-203ENST00000474160 LDLRAD1Q5T700 205 aa23.1■■□□□ 1.29
SYF2-203ENST00000474160 FAM151AQ8WW52 585 aa23.1■■□□□ 1.29
SYF2-203ENST00000474160 IDI2Q9BXS1 227 aa23.1■■□□□ 1.29
SYF2-203ENST00000474160 USP40Q9NVE5 1235 aa23.1■■□□□ 1.29
SYF2-203ENST00000474160 NPM3O75607 178 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
SYF2-203ENST00000474160 IREB2P48200 963 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
SYF2-203ENST00000474160 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
SYF2-203ENST00000474160 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa23.09■■□□□ 1.29
SYF2-203ENST00000474160 CERS3Q8IU89 383 aa23.09■■□□□ 1.29
SYF2-203ENST00000474160 SNRKQ9NRH2 765 aa23.09■■□□□ 1.29
SYF2-203ENST00000474160 ENTPD3O75355 529 aa23.08■■□□□ 1.29
SYF2-203ENST00000474160 BTDP43251 543 aa23.08■■□□□ 1.29
SYF2-203ENST00000474160 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
SYF2-203ENST00000474160 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
SYF2-203ENST00000474160 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
SYF2-203ENST00000474160 TMEM39BQ9GZU3 492 aa23.08■■□□□ 1.29
SYF2-203ENST00000474160 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
SYF2-203ENST00000474160 SSC5DA1L4H1 1573 aa23.08■■□□□ 1.29
SYF2-203ENST00000474160 MAST2Q6P0Q8 1798 aa23.08■■□□□ 1.29
SYF2-203ENST00000474160 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
SYF2-203ENST00000474160 UBE2Q2LH0YL09 131 aa23.07■■□□□ 1.28
SYF2-203ENST00000474160 BAG3O95817 575 aa23.07■■□□□ 1.28
SYF2-203ENST00000474160 PLCG2P16885 1265 aa23.07■■□□□ 1.28
SYF2-203ENST00000474160 ATP5JP18859 108 aa23.07■■□□□ 1.28
SYF2-203ENST00000474160 ZNF384Q8TF68 577 aa23.07■■□□□ 1.28
SYF2-203ENST00000474160 WBP1LQ9NX94 342 aa23.07■■□□□ 1.28
SYF2-203ENST00000474160 RFX7Q2KHR2 1363 aa23.06■■□□□ 1.28
SYF2-203ENST00000474160 CACNB3P54284 484 aa23.06■■□□□ 1.28
SYF2-203ENST00000474160 MAP3K12Q12852 859 aa23.06■■□□□ 1.28
SYF2-203ENST00000474160 DCAF15Q66K64 600 aa23.06■■□□□ 1.28
SYF2-203ENST00000474160 RASAL3Q86YV0 1011 aa23.06■■□□□ 1.28
SYF2-203ENST00000474160 AIDAQ96BJ3 306 aa23.06■■□□□ 1.28
SYF2-203ENST00000474160 GCC1Q96CN9 775 aa23.06■■□□□ 1.28
SYF2-203ENST00000474160 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
SYF2-203ENST00000474160 CA12O43570 354 aa23.05■■□□□ 1.28
SYF2-203ENST00000474160 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
SYF2-203ENST00000474160 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
SYF2-203ENST00000474160 PPP4CP60510 307 aa23.05■■□□□ 1.28
SYF2-203ENST00000474160 GRM1Q13255 1194 aa23.05■■□□□ 1.28
SYF2-203ENST00000474160 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa23.05■■□□□ 1.28
SYF2-203ENST00000474160 GPATCH3Q96I76 525 aa23.05■■□□□ 1.28
SYF2-203ENST00000474160 BEGAINQ9BUH8 593 aa23.05■■□□□ 1.28
SYF2-203ENST00000474160 PCNTO95613 3336 aa23.05■■□□□ 1.28
SYF2-203ENST00000474160 USP2O75604 605 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
SYF2-203ENST00000474160 RHBDL3P58872 404 aa23.04■■□□□ 1.28
SYF2-203ENST00000474160 MOB2Q70IA6 237 aa23.04■■□□□ 1.28
SYF2-203ENST00000474160 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
SYF2-203ENST00000474160 FAM198AQ9UFP1 575 aa23.04■■□□□ 1.28
SYF2-203ENST00000474160 NFIAQ12857 509 aa23.03■■□□□ 1.28
SYF2-203ENST00000474160 AOC2O75106 756 aa23.02■■□□□ 1.28
SYF2-203ENST00000474160 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
SYF2-203ENST00000474160 IDH1O75874 414 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
SYF2-203ENST00000474160 PRKG1Q13976 671 aa23.02■■□□□ 1.28
SYF2-203ENST00000474160 HAUS7Q99871 368 aa23.02■■□□□ 1.28
SYF2-203ENST00000474160 ECHDC1Q9NTX5 307 aa23.02■■□□□ 1.28
SYF2-203ENST00000474160 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
SYF2-203ENST00000474160 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
SYF2-203ENST00000474160 DOCK2Q92608 1830 aa23.01■■□□□ 1.27
SYF2-203ENST00000474160 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
SYF2-203ENST00000474160 RGS3P49796 1198 aa23.01■■□□□ 1.27
SYF2-203ENST00000474160 SLC10A4Q96EP9 437 aa23.01■■□□□ 1.27
SYF2-203ENST00000474160 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
SYF2-203ENST00000474160 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
SYF2-203ENST00000474160 MAP3K9P80192 1104 aa23■■□□□ 1.27
SYF2-203ENST00000474160 TCP10Q12799 353 aa23■■□□□ 1.27
SYF2-203ENST00000474160 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP23■■□□□ 1.27
SYF2-203ENST00000474160 ZNF341Q9BYN7 854 aa23■■□□□ 1.27
SYF2-203ENST00000474160 ATRNL1Q5VV63 1379 aa23■■□□□ 1.27
SYF2-203ENST00000474160 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
SYF2-203ENST00000474160 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
SYF2-203ENST00000474160 CDAN1Q8IWY9 1227 aa22.99■■□□□ 1.27
SYF2-203ENST00000474160 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SYF2-203ENST00000474160 ANTXR1Q9H6X2 564 aa22.99■■□□□ 1.27
SYF2-203ENST00000474160 PAG1Q9NWQ8 432 aa22.99■■□□□ 1.27
SYF2-203ENST00000474160 CSADQ9Y600 493 aa22.99■■□□□ 1.27
SYF2-203ENST00000474160 TTC41PQ6P2S7 1318 aa22.99■■□□□ 1.27
SYF2-203ENST00000474160 CYP7A1P22680 504 aa22.98■■□□□ 1.27
SYF2-203ENST00000474160 SPRYD7Q5W111 196 aa22.98■■□□□ 1.27
SYF2-203ENST00000474160 TEX11Q8IYF3 940 aa22.98■■□□□ 1.27
SYF2-203ENST00000474160 MAGEB6Q8N7X4 407 aa22.98■■□□□ 1.27
SYF2-203ENST00000474160 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.27
SYF2-203ENST00000474160 BOLA2Q9H3K6 86 aa22.98■■□□□ 1.27
SYF2-203ENST00000474160 SAGE1Q9NXZ1 904 aa22.98■■□□□ 1.27
SYF2-203ENST00000474160 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.27
SYF2-203ENST00000474160 GOLIM4O00461 696 aa22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 105.1 ms