RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473511.5

MIB2-208, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 5

Gene MIB2, Length 1,332 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-208	ENST00000473511	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		28.04	■■■□□ 2.08
MIB2-208	ENST00000473511	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		28.04	■■■□□ 2.08
MIB2-208	ENST00000473511	CAPN15	O75808	1086 aa		28.03	■■■□□ 2.08
MIB2-208	ENST00000473511	MCAM	P43121	646 aa		28.03	■■■□□ 2.08
MIB2-208	ENST00000473511	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		28.03	■■■□□ 2.08
MIB2-208	ENST00000473511	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		28.03	■■■□□ 2.08
MIB2-208	ENST00000473511	USP40	Q9NVE5	1235 aa		28.03	■■■□□ 2.08
MIB2-208	ENST00000473511	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		28.02	■■■□□ 2.08
MIB2-208	ENST00000473511	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		28.02	■■■□□ 2.08
MIB2-208	ENST00000473511	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		28.02	■■■□□ 2.08
MIB2-208	ENST00000473511	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		28.02	■■■□□ 2.08
MIB2-208	ENST00000473511	UNCX	A6NJT0	531 aa		28.01	■■■□□ 2.07
MIB2-208	ENST00000473511	TCP10	Q12799	353 aa		28.01	■■■□□ 2.07
MIB2-208	ENST00000473511	NFIA	Q12857	509 aa		28.01	■■■□□ 2.07
MIB2-208	ENST00000473511	WNK4	Q96J92	1243 aa		28.01	■■■□□ 2.07
MIB2-208	ENST00000473511	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		28.01	■■■□□ 2.07
MIB2-208	ENST00000473511	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		28.01	■■■□□ 2.07
MIB2-208	ENST00000473511	OTOF	Q9HC10	1997 aa		28	■■■□□ 2.07
MIB2-208	ENST00000473511	MECOM	Q03112	1051 aa		28	■■■□□ 2.07
MIB2-208	ENST00000473511	SREBF2	Q12772	1141 aa		28	■■■□□ 2.07
MIB2-208	ENST00000473511	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		28	■■■□□ 2.07
MIB2-208	ENST00000473511	SLF2	Q8IX21	1173 aa		28	■■■□□ 2.07
MIB2-208	ENST00000473511	ELP3	Q9H9T3	547 aa		28	■■■□□ 2.07
MIB2-208	ENST00000473511	SNRK	Q9NRH2	765 aa		28	■■■□□ 2.07
MIB2-208	ENST00000473511	GAK	O14976	1311 aa		28	■■■□□ 2.07
MIB2-208	ENST00000473511	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		28	■■■□□ 2.07
MIB2-208	ENST00000473511	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	27.99	■■■□□ 2.07
MIB2-208	ENST00000473511	FAM151A	Q8WW52	585 aa		27.99	■■■□□ 2.07
MIB2-208	ENST00000473511	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	27.99	■■■□□ 2.07
MIB2-208	ENST00000473511	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	27.99	■■■□□ 2.07
MIB2-208	ENST00000473511	RAI14	Q9P0K7	980 aa		27.99	■■■□□ 2.07
MIB2-208	ENST00000473511	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	27.99	■■■□□ 2.07
MIB2-208	ENST00000473511	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	27.99	■■■□□ 2.07
MIB2-208	ENST00000473511	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	27.98	■■■□□ 2.07
MIB2-208	ENST00000473511	TM4SF4	P48230	202 aa		27.98	■■■□□ 2.07
MIB2-208	ENST00000473511	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	27.98	■■■□□ 2.07
MIB2-208	ENST00000473511	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	27.98	■■■□□ 2.07
MIB2-208	ENST00000473511	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		27.97	■■■□□ 2.07
MIB2-208	ENST00000473511	BTD	P43251	543 aa		27.97	■■■□□ 2.07
MIB2-208	ENST00000473511	MAP3K9	P80192	1104 aa		27.97	■■■□□ 2.07
MIB2-208	ENST00000473511	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		27.97	■■■□□ 2.07
MIB2-208	ENST00000473511	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	27.97	■■■□□ 2.07
MIB2-208	ENST00000473511	ZNF384	Q8TF68	577 aa		27.97	■■■□□ 2.07
MIB2-208	ENST00000473511	HOOK2	Q96ED9	719 aa		27.97	■■■□□ 2.07
MIB2-208	ENST00000473511	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		27.97	■■■□□ 2.07
MIB2-208	ENST00000473511	GJA5	P36382	358 aa		27.96	■■■□□ 2.07
MIB2-208	ENST00000473511	VGLL4	Q14135	290 aa		27.96	■■■□□ 2.07
MIB2-208	ENST00000473511	PDE3A	Q14432	1141 aa		27.96	■■■□□ 2.07
MIB2-208	ENST00000473511	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	27.96	■■■□□ 2.07
MIB2-208	ENST00000473511	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	27.96	■■■□□ 2.07
MIB2-208	ENST00000473511	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	27.96	■■■□□ 2.07
MIB2-208	ENST00000473511	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	27.96	■■■□□ 2.07
MIB2-208	ENST00000473511	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		27.96	■■■□□ 2.07
MIB2-208	ENST00000473511	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	27.95	■■■□□ 2.07
MIB2-208	ENST00000473511	APBB1	O00213	710 aa		27.95	■■■□□ 2.07
MIB2-208	ENST00000473511	TBC1D8	O95759	1140 aa		27.95	■■■□□ 2.07
MIB2-208	ENST00000473511	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		27.95	■■■□□ 2.07
MIB2-208	ENST00000473511	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		27.95	■■■□□ 2.07
MIB2-208	ENST00000473511	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	27.95	■■■□□ 2.07
MIB2-208	ENST00000473511	OPTN	Q96CV9	577 aa		27.95	■■■□□ 2.07
MIB2-208	ENST00000473511	WRNIP1	Q96S55	665 aa		27.95	■■■□□ 2.07
MIB2-208	ENST00000473511	CSAD	Q9Y600	493 aa		27.95	■■■□□ 2.07
MIB2-208	ENST00000473511	HMMR	O75330	724 aa		27.94	■■■□□ 2.06
MIB2-208	ENST00000473511	RGS3	P49796	1198 aa		27.94	■■■□□ 2.06
MIB2-208	ENST00000473511	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		27.94	■■■□□ 2.06
MIB2-208	ENST00000473511	DCAF15	Q66K64	600 aa		27.94	■■■□□ 2.06
MIB2-208	ENST00000473511	AACS	Q86V21	672 aa		27.94	■■■□□ 2.06
MIB2-208	ENST00000473511	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		27.94	■■■□□ 2.06
MIB2-208	ENST00000473511	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		27.94	■■■□□ 2.06
MIB2-208	ENST00000473511	GSTO1	P78417	241 aa		27.93	■■■□□ 2.06
MIB2-208	ENST00000473511	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		27.93	■■■□□ 2.06
MIB2-208	ENST00000473511	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		27.92	■■■□□ 2.06
MIB2-208	ENST00000473511	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
MIB2-208	ENST00000473511	IDI2	Q9BXS1	227 aa		27.92	■■■□□ 2.06
MIB2-208	ENST00000473511	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		27.92	■■■□□ 2.06
MIB2-208	ENST00000473511	AK9	Q5TCS8	1911 aa		27.92	■■■□□ 2.06
MIB2-208	ENST00000473511	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		27.92	■■■□□ 2.06
MIB2-208	ENST00000473511	LDHC	P07864	332 aa		27.92	■■■□□ 2.06
MIB2-208	ENST00000473511	ZAP70	P43403	619 aa		27.92	■■■□□ 2.06
MIB2-208	ENST00000473511	PICALM	Q13492	652 aa		27.92	■■■□□ 2.06
MIB2-208	ENST00000473511	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
MIB2-208	ENST00000473511	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		27.92	■■■□□ 2.06
MIB2-208	ENST00000473511	BCL11A	Q9H165	835 aa		27.92	■■■□□ 2.06
MIB2-208	ENST00000473511	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	27.91	■■■□□ 2.06
MIB2-208	ENST00000473511	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	27.91	■■■□□ 2.06
MIB2-208	ENST00000473511	INHBE	P58166	350 aa		27.91	■■■□□ 2.06
MIB2-208	ENST00000473511	IFNL1	Q8IU54	200 aa		27.91	■■■□□ 2.06
MIB2-208	ENST00000473511	OTUD5	Q96G74	571 aa		27.91	■■■□□ 2.06
MIB2-208	ENST00000473511	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	27.91	■■■□□ 2.06
MIB2-208	ENST00000473511	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		27.91	■■■□□ 2.06
MIB2-208	ENST00000473511	ENTPD3	O75355	529 aa		27.9	■■■□□ 2.06
MIB2-208	ENST00000473511	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	27.9	■■■□□ 2.06
MIB2-208	ENST00000473511	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	27.89	■■■□□ 2.05
MIB2-208	ENST00000473511	INPP5B	P32019	993 aa		27.89	■■■□□ 2.05
MIB2-208	ENST00000473511	RHBDL3	P58872	404 aa		27.89	■■■□□ 2.05
MIB2-208	ENST00000473511	DGKZ	Q13574	1117 aa		27.89	■■■□□ 2.05
MIB2-208	ENST00000473511	ABHD8	Q96I13	439 aa		27.89	■■■□□ 2.05
MIB2-208	ENST00000473511	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
MIB2-208	ENST00000473511	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		27.88	■■■□□ 2.05
MIB2-208	ENST00000473511	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		27.88	■■■□□ 2.05

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