RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471438.2

CSMD2-208, Transcript of CUB and Sushi multiple domains 2, human

TSL 5

Gene CSMD2, Length 355 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSMD2-208	ENST00000471438	SGO2	Q562F6	1265 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CSMD2-208	ENST00000471438	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CSMD2-208	ENST00000471438	ROCK1	Q13464	1354 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CSMD2-208	ENST00000471438	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSMD2-208	ENST00000471438	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CSMD2-208	ENST00000471438	ADAM11	O75078	769 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSMD2-208	ENST00000471438	XYLB	O75191	536 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSMD2-208	ENST00000471438	MICAL2	O94851	1124 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSMD2-208	ENST00000471438	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CSMD2-208	ENST00000471438	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSMD2-208	ENST00000471438	FAM168A	Q92567	244 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSMD2-208	ENST00000471438	TOX2	Q96NM4	488 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSMD2-208	ENST00000471438	USP20	Q9Y2K6	914 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSMD2-208	ENST00000471438	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CSMD2-208	ENST00000471438	TONSL	Q96HA7	1378 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSMD2-208	ENST00000471438	PLA2R1	Q13018	1463 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSMD2-208	ENST00000471438	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSMD2-208	ENST00000471438	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSMD2-208	ENST00000471438	LGR5	O75473	907 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSMD2-208	ENST00000471438	ITGAE	P38570	1179 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSMD2-208	ENST00000471438	DGKZ	Q13574	1117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSMD2-208	ENST00000471438	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CSMD2-208	ENST00000471438	PLCL1	Q15111	1095 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSMD2-208	ENST00000471438	NFKBIB	Q15653	356 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSMD2-208	ENST00000471438	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSMD2-208	ENST00000471438	CEP135	Q66GS9	1140 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSMD2-208	ENST00000471438	SHISA5	Q8N114	240 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSMD2-208	ENST00000471438	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CSMD2-208	ENST00000471438	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CSMD2-208	ENST00000471438	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSMD2-208	ENST00000471438	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSMD2-208	ENST00000471438	FAM84A	Q96KN4	292 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSMD2-208	ENST00000471438	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSMD2-208	ENST00000471438	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSMD2-208	ENST00000471438	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CSMD2-208	ENST00000471438	RICTOR	Q6R327	1708 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSMD2-208	ENST00000471438	LRP6	O75581	1613 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSMD2-208	ENST00000471438	IQGAP2	Q13576	1575 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	NEO1	Q92859	1461 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	FOXO3	O43524	673 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	NEFL	P07196	543 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	WEE1	P30291	646 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	PAOX	Q6QHF9	649 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	SYNM	O15061	1565 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	ABCA8	O94911	1581 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	FAM177B	A6PVY3	158 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	CFP	P27918	469 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	ATP11A	P98196	1134 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	SPACA7	Q96KW9	195 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	JAG2	Q9Y219	1238 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	KDM5C	P41229	1560 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	OPLAH	O14841	1288 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	RAP1GAP	P47736	663 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	MESP2	Q0VG99	397 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	CDCA8	Q53HL2	280 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	ADGRL2	O95490	1459 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	MBD5	Q9P267	1494 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	CCDC7	Q96M83	1385 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	EPHA1	P21709	976 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	ADM	P35318	185 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	NLRP12	P59046	1061 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	NWD1	Q149M9	1564 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	ZAR1	Q86SH2	424 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	ADAM19	Q9H013	955 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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