RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468347.1

SHQ1-204, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 134 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-204ENST00000468347 LRFN2Q9ULH4 789 aa4.56□□□□□ -1.68
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SHQ1-204ENST00000468347 KCTD3Q9Y597 815 aa4.55□□□□□ -1.68
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SHQ1-204ENST00000468347 RGS19P49795 217 aa4.54□□□□□ -1.68
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SHQ1-204ENST00000468347 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP4.43□□□□□ -1.7
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SHQ1-204ENST00000468347 C6P13671 934 aa4.43□□□□□ -1.7
SHQ1-204ENST00000468347 ADAM17P78536 824 aa4.43□□□□□ -1.7
SHQ1-204ENST00000468347 FAM214BQ7L5A3 538 aa4.43□□□□□ -1.7
SHQ1-204ENST00000468347 NPAS4Q8IUM7 802 aa4.43□□□□□ -1.7
SHQ1-204ENST00000468347 ZFPM1Q8IX07 1006 aa4.43□□□□□ -1.7
SHQ1-204ENST00000468347 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
SHQ1-204ENST00000468347 MYLIPQ8WY64 445 aa4.43□□□□□ -1.7
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