RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447950.1

PTPRD-AS1-202, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRD-AS1, Length 1,668 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MCOLN1Q9GZU1 580 aa17.86■□□□□ 0.45
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HMG20BQ9P0W2 317 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RFX7Q2KHR2 1363 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CEP85Q6P2H3 762 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FAM83AQ86UY5 434 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP17.85■□□□□ 0.45
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa17.84■□□□□ 0.45
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ABCF2Q9UG63 623 aa17.84■□□□□ 0.45
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MAP3K9P80192 1104 aa17.81■□□□□ 0.44
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MIGA2Q7L4E1 593 aa17.81■□□□□ 0.44
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FAM151AQ8WW52 585 aa17.81■□□□□ 0.44
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GPR108Q9NPR9 543 aa17.81■□□□□ 0.44
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SIPA1L1O43166 1804 aa17.8■□□□□ 0.44
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MS4A4AQ96JQ5 239 aa17.8■□□□□ 0.44
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa17.79■□□□□ 0.44
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IDI2Q9BXS1 227 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CSADQ9Y600 493 aa17.77■□□□□ 0.44
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TTC39AQ5SRH9 613 aa17.77■□□□□ 0.43
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZNF341Q9BYN7 854 aa17.77■□□□□ 0.43
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa17.77■□□□□ 0.43
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CCDC85CA6NKD9 419 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RAI14Q9P0K7 980 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZNF112Q9UJU3 913 aa17.76■□□□□ 0.43
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PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZAP70P43403 619 aa17.75■□□□□ 0.43
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